MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria pomeroyi DSS-3 chromosome

Total Repeats: 93706

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13502	NC_003911	CGG	2	6	611859	611864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695505
13503	NC_003911	TCGGC	2	10	611967	611976	0 %	20 %	40 %	40 %	56695505
13504	NC_003911	CGG	2	6	612024	612029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695505
13505	NC_003911	GCC	3	9	612032	612040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695505
13506	NC_003911	TGG	2	6	612105	612110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695505
13507	NC_003911	ATC	3	9	612158	612166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695505
13508	NC_003911	GTG	2	6	612257	612262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695505
13509	NC_003911	GGC	2	6	612290	612295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695505
13510	NC_003911	TCGC	2	8	612331	612338	0 %	25 %	25 %	50 %	56695505
13511	NC_003911	CAT	2	6	612373	612378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695505
13512	NC_003911	TCT	2	6	612390	612395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56695505
13513	NC_003911	CCGA	2	8	612410	612417	25 %	0 %	25 %	50 %	56695505
13514	NC_003911	GGCG	2	8	612418	612425	0 %	0 %	75 %	25 %	56695505
13515	NC_003911	TGT	2	6	612433	612438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56695505
13516	NC_003911	ATC	2	6	612539	612544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695505
13517	NC_003911	C	6	6	612555	612560	0 %	0 %	0 %	100 %	56695505
13518	NC_003911	CGA	2	6	612625	612630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695505
13519	NC_003911	GCT	2	6	612637	612642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695505
13520	NC_003911	CTG	2	6	612647	612652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695505
13521	NC_003911	CGG	2	6	612672	612677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695505
13522	NC_003911	GAC	2	6	612691	612696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695505
13523	NC_003911	CAT	2	6	612772	612777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695505
13524	NC_003911	GAT	2	6	612778	612783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695505
13525	NC_003911	TCA	2	6	612804	612809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695505
13526	NC_003911	CGC	3	9	612810	612818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695505
13527	NC_003911	CGC	2	6	612874	612879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695505
13528	NC_003911	TGTTC	2	10	612895	612904	0 %	60 %	20 %	20 %	56695505
13529	NC_003911	TGC	2	6	612906	612911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695505
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13534	NC_003911	GGCG	2	8	613087	613094	0 %	0 %	75 %	25 %	56695506
13535	NC_003911	GCC	2	6	613118	613123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695506
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13539	NC_003911	GCT	2	6	613341	613346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695506
13540	NC_003911	CGG	2	6	613354	613359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695506
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13542	NC_003911	CGC	3	9	613440	613448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695506
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13545	NC_003911	GCGTC	2	10	613536	613545	0 %	20 %	40 %	40 %	56695506
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13550	NC_003911	GAT	2	6	613778	613783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695506
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13552	NC_003911	GAT	2	6	613810	613815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695506
13553	NC_003911	GCC	3	9	613859	613867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695506
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13559	NC_003911	TGC	2	6	614073	614078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695506
13560	NC_003911	GCG	2	6	614085	614090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695506
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13588	NC_003911	CATG	2	8	615169	615176	25 %	25 %	25 %	25 %	56695508
13589	NC_003911	CG	3	6	615193	615198	0 %	0 %	50 %	50 %	56695508
13590	NC_003911	G	6	6	615248	615253	0 %	0 %	100 %	0 %	56695508
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13603	NC_003911	GCG	2	6	615962	615967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695508
13604	NC_003911	CG	3	6	615983	615988	0 %	0 %	50 %	50 %	56695508
13605	NC_003911	GGC	2	6	615997	616002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695508
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13612	NC_003911	GC	3	6	616249	616254	0 %	0 %	50 %	50 %	56695509
13613	NC_003911	CG	3	6	616310	616315	0 %	0 %	50 %	50 %	56695509
13614	NC_003911	ATC	2	6	616352	616357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695509
13615	NC_003911	CCGGC	2	10	616369	616378	0 %	0 %	40 %	60 %	56695509
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13621	NC_003911	TGC	2	6	616498	616503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695510
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13623	NC_003911	CGGC	2	8	616591	616598	0 %	0 %	50 %	50 %	56695510
13624	NC_003911	GAG	2	6	616599	616604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56695510
13625	NC_003911	GC	3	6	616620	616625	0 %	0 %	50 %	50 %	56695510
13626	NC_003911	TGC	2	6	616660	616665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695510
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13635	NC_003911	TCG	2	6	617056	617061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695510
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13679	NC_003911	CGCC	2	8	619225	619232	0 %	0 %	25 %	75 %	56695512
13680	NC_003911	GAT	2	6	619280	619285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695512
13681	NC_003911	TCG	2	6	619308	619313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695512
13682	NC_003911	CCA	2	6	619410	619415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695512
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13685	NC_003911	G	6	6	619662	619667	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13686	NC_003911	C	6	6	619673	619678	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13687	NC_003911	C	6	6	619682	619687	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13688	NC_003911	AGA	2	6	619703	619708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13702	NC_003911	CCGAG	2	10	620529	620538	20 %	0 %	40 %	40 %	56695513
13703	NC_003911	GCCT	2	8	620551	620558	0 %	25 %	25 %	50 %	56695513
13704	NC_003911	AGGC	2	8	620660	620667	25 %	0 %	50 %	25 %	56695513
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13710	NC_003911	CTGG	2	8	620963	620970	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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13721	NC_003911	GATA	2	8	621502	621509	50 %	25 %	25 %	0 %	56695514
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13744	NC_003911	CGG	2	6	622976	622981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13745	NC_003911	GCC	2	6	622986	622991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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13751	NC_003911	TGGT	2	8	623196	623203	0 %	50 %	50 %	0 %	56695515
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13990	NC_003911	TTC	2	6	633791	633796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56698726
13991	NC_003911	CTG	2	6	633823	633828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56698726
13992	NC_003911	GCT	2	6	633852	633857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56698726
13993	NC_003911	GCT	2	6	633912	633917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56698726
13994	NC_003911	TGC	2	6	633932	633937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56698726
13995	NC_003911	TGG	2	6	633938	633943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56698726
13996	NC_003911	CGC	2	6	633947	633952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56698726
13997	NC_003911	TGGCGA	2	12	633956	633967	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	56698726
13998	NC_003911	CAC	2	6	633969	633974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56698726
13999	NC_003911	C	6	6	633991	633996	0 %	0 %	0 %	100 %	56698726
14000	NC_003911	CTG	2	6	634009	634014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56698726

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