MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria pomeroyi DSS-3 chromosome

Total Repeats: 93706

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12502	NC_003911	TTG	2	6	569978	569983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56695480
12503	NC_003911	CG	4	8	570167	570174	0 %	0 %	50 %	50 %	56695480
12504	NC_003911	CAG	2	6	570189	570194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695480
12505	NC_003911	GGT	2	6	570206	570211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695480
12506	NC_003911	CTG	2	6	570252	570257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695480
12507	NC_003911	TCA	2	6	570272	570277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695480
12508	NC_003911	GC	3	6	570327	570332	0 %	0 %	50 %	50 %	56695480
12509	NC_003911	GCG	2	6	570382	570387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695480
12510	NC_003911	GGC	2	6	570414	570419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695480
12511	NC_003911	GCGA	2	8	570450	570457	25 %	0 %	50 %	25 %	56695480
12512	NC_003911	CG	3	6	570511	570516	0 %	0 %	50 %	50 %	56695480
12513	NC_003911	CGG	2	6	570521	570526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695480
12514	NC_003911	AGGCG	2	10	570548	570557	20 %	0 %	60 %	20 %	56695480
12515	NC_003911	GC	3	6	570602	570607	0 %	0 %	50 %	50 %	56695480
12516	NC_003911	CTG	2	6	570630	570635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695480
12517	NC_003911	CAT	2	6	570651	570656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695480
12518	NC_003911	CAG	2	6	570681	570686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695480
12519	NC_003911	CGG	2	6	570692	570697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695480
12520	NC_003911	CGC	2	6	570750	570755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695480
12521	NC_003911	CG	3	6	570758	570763	0 %	0 %	50 %	50 %	56695480
12522	NC_003911	GCA	2	6	570791	570796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695480
12523	NC_003911	CAC	2	6	570831	570836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695480
12524	NC_003911	CAC	2	6	570882	570887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695480
12525	NC_003911	CGC	2	6	570914	570919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695480
12526	NC_003911	GGC	2	6	571047	571052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695480
12527	NC_003911	GC	3	6	571064	571069	0 %	0 %	50 %	50 %	56695480
12528	NC_003911	GAC	2	6	571077	571082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695480
12529	NC_003911	GCC	2	6	571089	571094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695480
12530	NC_003911	CAG	2	6	571107	571112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695480
12531	NC_003911	GGGT	2	8	571139	571146	0 %	25 %	75 %	0 %	56695480
12532	NC_003911	CAGG	2	8	571245	571252	25 %	0 %	50 %	25 %	56695480
12533	NC_003911	TTG	2	6	571261	571266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56695480
12534	NC_003911	CTTGCG	2	12	571284	571295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695480
12535	NC_003911	CG	3	6	571310	571315	0 %	0 %	50 %	50 %	56695480
12536	NC_003911	CGC	2	6	571352	571357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695480
12537	NC_003911	GCG	4	12	571422	571433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695480
12538	NC_003911	CAC	2	6	571503	571508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695480
12539	NC_003911	GTG	2	6	571534	571539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695480
12540	NC_003911	GC	4	8	571555	571562	0 %	0 %	50 %	50 %	56695480
12541	NC_003911	GTC	2	6	571575	571580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695480
12542	NC_003911	GCC	2	6	571665	571670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695480
12543	NC_003911	CGT	2	6	571685	571690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695480
12544	NC_003911	GCG	2	6	571723	571728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695480
12545	NC_003911	GA	3	6	571746	571751	50 %	0 %	50 %	0 %	56695480
12546	NC_003911	GCC	2	6	571800	571805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695480
12547	NC_003911	CCA	2	6	571820	571825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695480
12548	NC_003911	CGC	2	6	571841	571846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695480
12549	NC_003911	CATGA	2	10	571890	571899	40 %	20 %	20 %	20 %	56695480
12550	NC_003911	GC	3	6	571918	571923	0 %	0 %	50 %	50 %	56695480
12551	NC_003911	G	6	6	572010	572015	0 %	0 %	100 %	0 %	56695480
12552	NC_003911	CG	3	6	572031	572036	0 %	0 %	50 %	50 %	56695480
12553	NC_003911	GCGG	2	8	572040	572047	0 %	0 %	75 %	25 %	56695480
12554	NC_003911	TCG	2	6	572056	572061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695480
12555	NC_003911	CCA	2	6	572087	572092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695480
12556	NC_003911	TCG	2	6	572152	572157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695480
12557	NC_003911	GAT	2	6	572226	572231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695480
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12559	NC_003911	GCG	2	6	572292	572297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695480
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12561	NC_003911	GGT	2	6	572412	572417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695480
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12563	NC_003911	GC	3	6	572485	572490	0 %	0 %	50 %	50 %	56695480
12564	NC_003911	GC	3	6	572494	572499	0 %	0 %	50 %	50 %	56695480
12565	NC_003911	CGGCG	2	10	572543	572552	0 %	0 %	60 %	40 %	56695480
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12571	NC_003911	GC	3	6	572972	572977	0 %	0 %	50 %	50 %	56695480
12572	NC_003911	GC	3	6	573055	573060	0 %	0 %	50 %	50 %	56695480
12573	NC_003911	GCCC	2	8	573077	573084	0 %	0 %	25 %	75 %	56695480
12574	NC_003911	GCG	2	6	573086	573091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695480
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12577	NC_003911	CAT	2	6	573159	573164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695480
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12580	NC_003911	GGGCGG	2	12	573248	573259	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	56695480
12581	NC_003911	ATT	2	6	573376	573381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12582	NC_003911	ATG	2	6	573394	573399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12583	NC_003911	TGACCG	2	12	573431	573442	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	56695481
12584	NC_003911	CAG	2	6	573462	573467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695481
12585	NC_003911	GC	3	6	573539	573544	0 %	0 %	50 %	50 %	56695481
12586	NC_003911	GGT	2	6	573581	573586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695481
12587	NC_003911	CGTGCA	2	12	573623	573634	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	56695481
12588	NC_003911	CCA	2	6	573715	573720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695481
12589	NC_003911	GGC	2	6	573764	573769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695481
12590	NC_003911	GTC	2	6	574022	574027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12591	NC_003911	G	6	6	574043	574048	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12592	NC_003911	ATT	2	6	574074	574079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56695482
12593	NC_003911	TG	3	6	574082	574087	0 %	50 %	50 %	0 %	56695482
12594	NC_003911	GCT	2	6	574110	574115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695482
12595	NC_003911	TGC	2	6	574131	574136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695482
12596	NC_003911	TCG	2	6	574217	574222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695482
12597	NC_003911	CAA	2	6	574269	574274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56695482
12598	NC_003911	TCGCC	2	10	574277	574286	0 %	20 %	20 %	60 %	56695482
12599	NC_003911	CGC	2	6	574287	574292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695482
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12601	NC_003911	GCC	2	6	574339	574344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695482
12602	NC_003911	GCG	2	6	574348	574353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695482
12603	NC_003911	TCG	2	6	574360	574365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695482
12604	NC_003911	CCCA	2	8	574414	574421	25 %	0 %	0 %	75 %	56695482
12605	NC_003911	GGCGA	2	10	574426	574435	20 %	0 %	60 %	20 %	56695482
12606	NC_003911	CGA	2	6	574446	574451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695482
12607	NC_003911	GGC	2	6	574481	574486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695482
12608	NC_003911	GGT	2	6	574488	574493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695482
12609	NC_003911	GC	4	8	574608	574615	0 %	0 %	50 %	50 %	56695482
12610	NC_003911	CAC	2	6	574695	574700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695482
12611	NC_003911	CCA	2	6	574754	574759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695482
12612	NC_003911	GCG	2	6	574790	574795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695482
12613	NC_003911	GCT	2	6	574836	574841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695482
12614	NC_003911	ACC	2	6	574861	574866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695482
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12616	NC_003911	ACGAC	2	10	574928	574937	40 %	0 %	20 %	40 %	56695482
12617	NC_003911	GC	3	6	574942	574947	0 %	0 %	50 %	50 %	56695482
12618	NC_003911	AGGGCG	2	12	575012	575023	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	56695482
12619	NC_003911	GC	3	6	575042	575047	0 %	0 %	50 %	50 %	56695482
12620	NC_003911	GC	3	6	575081	575086	0 %	0 %	50 %	50 %	56695482
12621	NC_003911	CCG	2	6	575117	575122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695482
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12786	NC_003911	CAG	2	6	583562	583567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695485
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