MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria pomeroyi DSS-3 chromosome

Total Repeats: 93706

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12125	NC_003911	GC	3	6	551988	551993	0 %	0 %	50 %	50 %	56695468
12126	NC_003911	CAGG	2	8	552004	552011	25 %	0 %	50 %	25 %	56695468
12127	NC_003911	GCCGAG	2	12	552078	552089	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	56695468
12128	NC_003911	CGG	2	6	552109	552114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695468
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12132	NC_003911	CAA	3	9	552355	552363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56695469
12133	NC_003911	CAT	2	6	552367	552372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695469
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12135	NC_003911	GCG	2	6	552581	552586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695469
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12137	NC_003911	GGC	2	6	552622	552627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695469
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12145	NC_003911	CGA	2	6	553153	553158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695469
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12150	NC_003911	CCAGCG	2	12	553438	553449	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	56695469
12151	NC_003911	AGCCC	2	10	553462	553471	20 %	0 %	20 %	60 %	56695469
12152	NC_003911	GCAG	2	8	553590	553597	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12153	NC_003911	TGTC	2	8	553796	553803	0 %	50 %	25 %	25 %	56695470
12154	NC_003911	GGC	2	6	553813	553818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695470
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12156	NC_003911	CGC	2	6	553894	553899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695470
12157	NC_003911	CCGC	2	8	553983	553990	0 %	0 %	25 %	75 %	56695470
12158	NC_003911	TGA	2	6	554019	554024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695470
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12160	NC_003911	TGC	3	9	554178	554186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695470
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12162	NC_003911	CGCA	2	8	554230	554237	25 %	0 %	25 %	50 %	56695470
12163	NC_003911	CG	3	6	554268	554273	0 %	0 %	50 %	50 %	56695470
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12169	NC_003911	CGG	2	6	554722	554727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695470
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12174	NC_003911	GTCG	2	8	554893	554900	0 %	25 %	50 %	25 %	56695470
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12191	NC_003911	A	6	6	555570	555575	100 %	0 %	0 %	0 %	56695470
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12232	NC_003911	GC	3	6	557681	557686	0 %	0 %	50 %	50 %	56695472
12233	NC_003911	CAT	2	6	557695	557700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695472
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12243	NC_003911	TGC	2	6	558143	558148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695472
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12372	NC_003911	CGC	2	6	564080	564085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695476
12373	NC_003911	CAT	2	6	564108	564113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695476
12374	NC_003911	ACC	2	6	564169	564174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695476
12375	NC_003911	CCG	2	6	564197	564202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695476
12376	NC_003911	GCG	2	6	564212	564217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695476
12377	NC_003911	GGT	2	6	564276	564281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695476
12378	NC_003911	GCC	2	6	564322	564327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695476
12379	NC_003911	CGC	2	6	564380	564385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695476
12380	NC_003911	GGC	2	6	564426	564431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695476
12381	NC_003911	GCG	3	9	564779	564787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695476
12382	NC_003911	GAT	2	6	564810	564815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695476
12383	NC_003911	GATG	2	8	564846	564853	25 %	25 %	50 %	0 %	56695476
12384	NC_003911	ACC	2	6	564901	564906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695476
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12390	NC_003911	GCC	2	6	565292	565297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695476
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12396	NC_003911	TGC	2	6	565643	565648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695476
12397	NC_003911	GGGC	2	8	565658	565665	0 %	0 %	75 %	25 %	56695476
12398	NC_003911	CGG	2	6	565736	565741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695476
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12400	NC_003911	CCCG	2	8	565855	565862	0 %	0 %	25 %	75 %	56695476
12401	NC_003911	GCG	2	6	565888	565893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695476
12402	NC_003911	GATGCC	2	12	565894	565905	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	56695476
12403	NC_003911	TGG	2	6	566003	566008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695476
12404	NC_003911	GTC	2	6	566050	566055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695476
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12410	NC_003911	GCG	2	6	566335	566340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695477
12411	NC_003911	CG	3	6	566339	566344	0 %	0 %	50 %	50 %	56695477
12412	NC_003911	GGC	2	6	566387	566392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695477
12413	NC_003911	GC	3	6	566401	566406	0 %	0 %	50 %	50 %	56695477
12414	NC_003911	GTG	2	6	566448	566453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695477
12415	NC_003911	GCC	3	9	566521	566529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695477
12416	NC_003911	TGC	2	6	566584	566589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695477
12417	NC_003911	GCC	2	6	566597	566602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695477
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12420	NC_003911	CGC	2	6	566812	566817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695477
12421	NC_003911	GGCG	2	8	566927	566934	0 %	0 %	75 %	25 %	56695477
12422	NC_003911	GGC	2	6	566963	566968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695477
12423	NC_003911	CAGC	2	8	566978	566985	25 %	0 %	25 %	50 %	56695477
12424	NC_003911	TGG	2	6	567091	567096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695477
12425	NC_003911	GGCGC	2	10	567107	567116	0 %	0 %	60 %	40 %	56695477
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12429	NC_003911	ATC	2	6	567285	567290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695477
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12433	NC_003911	CTT	2	6	567398	567403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56695477
12434	NC_003911	CA	3	6	567412	567417	50 %	0 %	0 %	50 %	56695477
12435	NC_003911	GC	3	6	567423	567428	0 %	0 %	50 %	50 %	56695477
12436	NC_003911	TGG	2	6	567454	567459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695477
12437	NC_003911	GAGC	2	8	567485	567492	25 %	0 %	50 %	25 %	56695477
12438	NC_003911	ATC	2	6	567511	567516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695477
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12441	NC_003911	CCG	2	6	567616	567621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695477
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12444	NC_003911	CGA	2	6	567685	567690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12445	NC_003911	TGG	2	6	567708	567713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695478
12446	NC_003911	CGA	2	6	567733	567738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695478
12447	NC_003911	GATG	2	8	567754	567761	25 %	25 %	50 %	0 %	56695478
12448	NC_003911	TGA	2	6	567795	567800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695478
12449	NC_003911	CTC	2	6	567829	567834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56695478
12450	NC_003911	CTG	2	6	567866	567871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695478
12451	NC_003911	GCT	2	6	567877	567882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695478
12452	NC_003911	CCG	2	6	567906	567911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695478
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12454	NC_003911	GC	3	6	568034	568039	0 %	0 %	50 %	50 %	56695478
12455	NC_003911	TCTG	2	8	568069	568076	0 %	50 %	25 %	25 %	56695478
12456	NC_003911	CGG	2	6	568082	568087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695478
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12461	NC_003911	GGGA	2	8	568314	568321	25 %	0 %	75 %	0 %	56695478
12462	NC_003911	CGA	2	6	568322	568327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695478
12463	NC_003911	ATC	3	9	568348	568356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695479
12464	NC_003911	AGGC	2	8	568400	568407	25 %	0 %	50 %	25 %	56695479
12465	NC_003911	CAT	2	6	568473	568478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695479
12466	NC_003911	GCAT	2	8	568481	568488	25 %	25 %	25 %	25 %	56695479
12467	NC_003911	TGA	2	6	568613	568618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695479
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12473	NC_003911	GC	3	6	568876	568881	0 %	0 %	50 %	50 %	56695479
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12476	NC_003911	GCG	2	6	568967	568972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695479
12477	NC_003911	CCCG	2	8	569069	569076	0 %	0 %	25 %	75 %	56695479
12478	NC_003911	GGT	2	6	569088	569093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695479
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12483	NC_003911	TGG	2	6	569351	569356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695479
12484	NC_003911	CGAC	2	8	569372	569379	25 %	0 %	25 %	50 %	56695479
12485	NC_003911	GTC	2	6	569400	569405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695479
12486	NC_003911	GAT	2	6	569475	569480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695479
12487	NC_003911	GCG	2	6	569510	569515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695479
12488	NC_003911	AGC	2	6	569611	569616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695479
12489	NC_003911	GC	3	6	569647	569652	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12490	NC_003911	GCG	2	6	569655	569660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12491	NC_003911	TCG	3	9	569673	569681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12492	NC_003911	TCC	4	12	569683	569694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12493	NC_003911	TGA	2	6	569710	569715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12494	NC_003911	CGG	2	6	569756	569761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12495	NC_003911	AGAA	2	8	569776	569783	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12496	NC_003911	TGC	2	6	569794	569799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12497	NC_003911	TTCT	2	8	569800	569807	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12498	NC_003911	TG	3	6	569830	569835	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12499	NC_003911	GGC	2	6	569870	569875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695480
12500	NC_003911	CGG	2	6	569900	569905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695480

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