MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria pomeroyi DSS-3 chromosome

Total Repeats: 93706

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_003911	CAA	2	6	456345	456350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56695360
10002	NC_003911	CTG	2	6	456382	456387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695360
10003	NC_003911	ACG	2	6	456391	456396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695360
10004	NC_003911	GTG	2	6	456442	456447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695360
10005	NC_003911	CG	3	6	456482	456487	0 %	0 %	50 %	50 %	56695360
10006	NC_003911	CGC	2	6	456566	456571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695360
10007	NC_003911	CATCA	2	10	456673	456682	40 %	20 %	0 %	40 %	56695360
10008	NC_003911	GGC	2	6	456702	456707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695360
10009	NC_003911	GA	3	6	456806	456811	50 %	0 %	50 %	0 %	56695360
10010	NC_003911	GGGC	2	8	456818	456825	0 %	0 %	75 %	25 %	56695360
10011	NC_003911	CTT	2	6	456902	456907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56695361
10012	NC_003911	GGC	2	6	456946	456951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695361
10013	NC_003911	GAA	2	6	457049	457054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56695361
10014	NC_003911	GC	4	8	457111	457118	0 %	0 %	50 %	50 %	56695361
10015	NC_003911	AGG	2	6	457158	457163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56695361
10016	NC_003911	GCC	2	6	457169	457174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695361
10017	NC_003911	CGC	2	6	457213	457218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695361
10018	NC_003911	AGC	2	6	457224	457229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695361
10019	NC_003911	CTT	2	6	457235	457240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56695361
10020	NC_003911	CTG	2	6	457241	457246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695361
10021	NC_003911	CGC	2	6	457249	457254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695361
10022	NC_003911	TTGAAG	2	12	457257	457268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695361
10023	NC_003911	GAT	2	6	457313	457318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695361
10024	NC_003911	GCC	2	6	457325	457330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695361
10025	NC_003911	TCG	2	6	457368	457373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695361
10026	NC_003911	CG	3	6	457372	457377	0 %	0 %	50 %	50 %	56695361
10027	NC_003911	TGC	2	6	457420	457425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695361
10028	NC_003911	GTT	2	6	457435	457440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56695361
10029	NC_003911	ATC	2	6	457452	457457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695361
10030	NC_003911	CGA	2	6	457501	457506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695361
10031	NC_003911	CCG	2	6	457509	457514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695361
10032	NC_003911	G	6	6	457514	457519	0 %	0 %	100 %	0 %	56695361
10033	NC_003911	GCT	2	6	457546	457551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695361
10034	NC_003911	CCTCGA	2	12	457576	457587	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	56695361
10035	NC_003911	GC	3	6	457709	457714	0 %	0 %	50 %	50 %	56695361
10036	NC_003911	CG	3	6	457777	457782	0 %	0 %	50 %	50 %	56695361
10037	NC_003911	GCCGCG	2	12	457847	457858	0 %	0 %	50 %	50 %	56695361
10038	NC_003911	CGTG	2	8	457906	457913	0 %	25 %	50 %	25 %	56695361
10039	NC_003911	GGT	2	6	457981	457986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695361
10040	NC_003911	TCG	2	6	457995	458000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695361
10041	NC_003911	AGC	3	9	458001	458009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695361
10042	NC_003911	CGG	2	6	458049	458054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695361
10043	NC_003911	CCCG	2	8	458060	458067	0 %	0 %	25 %	75 %	56695361
10044	NC_003911	GCAGC	2	10	458099	458108	20 %	0 %	40 %	40 %	56695361
10045	NC_003911	TCG	2	6	458187	458192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695361
10046	NC_003911	TCG	2	6	458199	458204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695361
10047	NC_003911	CTT	2	6	458246	458251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56695361
10048	NC_003911	CGG	2	6	458341	458346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695361
10049	NC_003911	GGCC	2	8	458377	458384	0 %	0 %	50 %	50 %	56695361
10050	NC_003911	TCA	2	6	458392	458397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695361
10051	NC_003911	CGA	2	6	458425	458430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695361
10052	NC_003911	GGC	2	6	458537	458542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695361
10053	NC_003911	GC	3	6	458623	458628	0 %	0 %	50 %	50 %	56695361
10054	NC_003911	TGC	2	6	458678	458683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10055	NC_003911	AT	3	6	458809	458814	50 %	50 %	0 %	0 %	56695362
10056	NC_003911	CCA	2	6	458869	458874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695362
10057	NC_003911	CGAC	2	8	458978	458985	25 %	0 %	25 %	50 %	56695362
10058	NC_003911	TTC	2	6	459049	459054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56695362
10059	NC_003911	CGG	2	6	459072	459077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695362
10060	NC_003911	CAA	2	6	459102	459107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56695362
10061	NC_003911	CAGCGA	2	12	459117	459128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695362
10062	NC_003911	CGG	2	6	459177	459182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695362
10063	NC_003911	CCA	2	6	459284	459289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695362
10064	NC_003911	GCC	2	6	459354	459359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695362
10065	NC_003911	GAC	2	6	459367	459372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695362
10066	NC_003911	GTGTTC	2	12	459406	459417	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	56695362
10067	NC_003911	GCG	2	6	459440	459445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695362
10068	NC_003911	GTTG	2	8	459483	459490	0 %	50 %	50 %	0 %	56695362
10069	NC_003911	CGA	2	6	459522	459527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695362
10070	NC_003911	GAC	2	6	459550	459555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695362
10071	NC_003911	GTTCC	2	10	459562	459571	0 %	40 %	20 %	40 %	56695362
10072	NC_003911	GTG	2	6	459598	459603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695362
10073	NC_003911	GACC	2	8	459663	459670	25 %	0 %	25 %	50 %	56695362
10074	NC_003911	CCG	2	6	459683	459688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695362
10075	NC_003911	CT	3	6	459752	459757	0 %	50 %	0 %	50 %	56695362
10076	NC_003911	CGA	2	6	459762	459767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695362
10077	NC_003911	GCG	2	6	459770	459775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695362
10078	NC_003911	GCT	2	6	459812	459817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10079	NC_003911	TGA	2	6	459948	459953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695363
10080	NC_003911	GCG	2	6	460024	460029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695363
10081	NC_003911	CG	3	6	460028	460033	0 %	0 %	50 %	50 %	56695363
10082	NC_003911	GGCG	2	8	460078	460085	0 %	0 %	75 %	25 %	56695363
10083	NC_003911	GGC	2	6	460092	460097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695363
10084	NC_003911	GCGG	2	8	460105	460112	0 %	0 %	75 %	25 %	56695363
10085	NC_003911	GCG	2	6	460189	460194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695363
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10087	NC_003911	GCGGT	2	10	460254	460263	0 %	20 %	60 %	20 %	56695363
10088	NC_003911	CGG	2	6	460321	460326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695363
10089	NC_003911	CGG	2	6	460332	460337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695363
10090	NC_003911	GGC	2	6	460349	460354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695363
10091	NC_003911	CAAG	2	8	460440	460447	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10092	NC_003911	CGG	2	6	460504	460509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695364
10093	NC_003911	CCG	2	6	460520	460525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695364
10094	NC_003911	CG	3	6	460548	460553	0 %	0 %	50 %	50 %	56695364
10095	NC_003911	TGG	2	6	460586	460591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695364
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10101	NC_003911	ATC	2	6	460838	460843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695364
10102	NC_003911	CGG	2	6	460905	460910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695364
10103	NC_003911	CTG	2	6	460955	460960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695364
10104	NC_003911	GGC	2	6	461039	461044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695364
10105	NC_003911	GCG	2	6	461051	461056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695364
10106	NC_003911	CAG	2	6	461057	461062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695364
10107	NC_003911	GCCCA	2	10	461139	461148	20 %	0 %	20 %	60 %	56695365
10108	NC_003911	CGC	3	9	461156	461164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695365
10109	NC_003911	CCA	2	6	461218	461223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695365
10110	NC_003911	CAG	2	6	461228	461233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695365
10111	NC_003911	CGAGC	2	10	461246	461255	20 %	0 %	40 %	40 %	56695365
10112	NC_003911	GC	3	6	461254	461259	0 %	0 %	50 %	50 %	56695365
10113	NC_003911	GCC	2	6	461274	461279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695365
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10116	NC_003911	CAG	2	6	461432	461437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695365
10117	NC_003911	CAG	3	9	461441	461449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695365
10118	NC_003911	GCC	2	6	461459	461464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695365
10119	NC_003911	CAG	2	6	461483	461488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695365
10120	NC_003911	AGC	2	6	461505	461510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695365
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10122	NC_003911	GCA	2	6	461524	461529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695365
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10245	NC_003911	TGG	2	6	467315	467320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695371
10246	NC_003911	GCT	2	6	467323	467328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695371
10247	NC_003911	GGT	2	6	467380	467385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695371
10248	NC_003911	GGT	2	6	467389	467394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695371
10249	NC_003911	TCA	3	9	467400	467408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695371
10250	NC_003911	AGCC	2	8	467423	467430	25 %	0 %	25 %	50 %	56695371
10251	NC_003911	GAAC	2	8	467431	467438	50 %	0 %	25 %	25 %	56695371
10252	NC_003911	GGC	2	6	467482	467487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695371
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10254	NC_003911	CGG	2	6	467548	467553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10255	NC_003911	CTC	2	6	467572	467577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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10258	NC_003911	TGGT	2	8	467638	467645	0 %	50 %	50 %	0 %	56695372
10259	NC_003911	GGCCCA	2	12	467648	467659	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	56695372
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10264	NC_003911	GC	3	6	468095	468100	0 %	0 %	50 %	50 %	56695374
10265	NC_003911	GTC	2	6	468107	468112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695374
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10284	NC_003911	GGC	2	6	469060	469065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695374
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10303	NC_003911	CG	3	6	470250	470255	0 %	0 %	50 %	50 %	56695374
10304	NC_003911	G	6	6	470296	470301	0 %	0 %	100 %	0 %	56695374
10305	NC_003911	GCA	2	6	470335	470340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695374
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10308	NC_003911	TGC	2	6	470564	470569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695375
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10330	NC_003911	TCA	2	6	471996	472001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695377
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10336	NC_003911	GCT	2	6	472439	472444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695378
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10348	NC_003911	GTT	2	6	472842	472847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56695379
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10350	NC_003911	TTC	2	6	472855	472860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56695379
10351	NC_003911	GCT	2	6	472871	472876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695379
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10354	NC_003911	GTC	2	6	472950	472955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695379
10355	NC_003911	GTC	2	6	472959	472964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695379
10356	NC_003911	TGC	2	6	472969	472974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695379
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10358	NC_003911	CGA	2	6	473039	473044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695379
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10360	NC_003911	CGG	2	6	473230	473235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695379
10361	NC_003911	CTG	2	6	473241	473246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695379
10362	NC_003911	GAG	2	6	473391	473396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56695379
10363	NC_003911	GC	3	6	473400	473405	0 %	0 %	50 %	50 %	56695379
10364	NC_003911	ACCGC	2	10	473440	473449	20 %	0 %	20 %	60 %	56695380
10365	NC_003911	CAG	2	6	473468	473473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695380
10366	NC_003911	CGGCAA	2	12	473479	473490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695380
10367	NC_003911	GCA	2	6	473542	473547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695380
10368	NC_003911	GC	3	6	473559	473564	0 %	0 %	50 %	50 %	56695380
10369	NC_003911	CAG	2	6	473669	473674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695380
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10375	NC_003911	CGG	2	6	473872	473877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695380
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10399	NC_003911	GCG	2	6	474960	474965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695382
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10402	NC_003911	GC	3	6	475090	475095	0 %	0 %	50 %	50 %	56695382
10403	NC_003911	CGG	2	6	475132	475137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695382
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10456	NC_003911	CGA	2	6	477794	477799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695386
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10488	NC_003911	CAT	2	6	479292	479297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695387
10489	NC_003911	GGT	2	6	479316	479321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695387
10490	NC_003911	CTG	2	6	479326	479331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695387
10491	NC_003911	TGA	2	6	479348	479353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695387
10492	NC_003911	GCA	2	6	479406	479411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695387
10493	NC_003911	CTG	2	6	479425	479430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695387
10494	NC_003911	GT	3	6	479438	479443	0 %	50 %	50 %	0 %	56695387
10495	NC_003911	GAT	2	6	479521	479526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695388
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10497	NC_003911	TGGG	2	8	479721	479728	0 %	25 %	75 %	0 %	56695388
10498	NC_003911	AGCCG	2	10	479743	479752	20 %	0 %	40 %	40 %	56695388
10499	NC_003911	CG	3	6	479751	479756	0 %	0 %	50 %	50 %	56695388
10500	NC_003911	GTG	2	6	479810	479815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695388

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