MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria pomeroyi DSS-3 chromosome

Total Repeats: 93706

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_003911	T	6	6	362172	362177	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8002	NC_003911	CGG	2	6	362342	362347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8003	NC_003911	GGT	2	6	362351	362356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8004	NC_003911	G	6	6	362369	362374	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8005	NC_003911	GTG	2	6	362383	362388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695263
8006	NC_003911	GGT	2	6	362463	362468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695263
8007	NC_003911	ACC	2	6	362470	362475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695263
8008	NC_003911	ACCG	2	8	362484	362491	25 %	0 %	25 %	50 %	56695263
8009	NC_003911	CAT	2	6	362515	362520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695263
8010	NC_003911	CGA	2	6	362622	362627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695263
8011	NC_003911	GCA	2	6	362637	362642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695263
8012	NC_003911	CGG	2	6	362649	362654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695263
8013	NC_003911	CAAC	2	8	362666	362673	50 %	0 %	0 %	50 %	56695263
8014	NC_003911	CGG	2	6	362790	362795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695263
8015	NC_003911	AGC	2	6	362867	362872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695263
8016	NC_003911	GC	4	8	362889	362896	0 %	0 %	50 %	50 %	56695263
8017	NC_003911	GCT	2	6	362898	362903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695263
8018	NC_003911	GGT	2	6	362967	362972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695263
8019	NC_003911	CGG	2	6	362993	362998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695263
8020	NC_003911	CTG	2	6	363139	363144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695263
8021	NC_003911	GCG	2	6	363164	363169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695263
8022	NC_003911	GCG	3	9	363172	363180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695263
8023	NC_003911	CG	3	6	363198	363203	0 %	0 %	50 %	50 %	56695263
8024	NC_003911	CGA	2	6	363225	363230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695263
8025	NC_003911	TGG	2	6	363290	363295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695263
8026	NC_003911	GCG	2	6	363352	363357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695263
8027	NC_003911	CAG	2	6	363377	363382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695263
8028	NC_003911	CG	3	6	363389	363394	0 %	0 %	50 %	50 %	56695263
8029	NC_003911	CGA	2	6	363402	363407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695263
8030	NC_003911	GGC	2	6	363455	363460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695263
8031	NC_003911	GAA	2	6	363506	363511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56695263
8032	NC_003911	GGCC	2	8	363513	363520	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8033	NC_003911	GAT	2	6	363663	363668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695264
8034	NC_003911	GCC	2	6	363678	363683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695264
8035	NC_003911	GGC	2	6	363747	363752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695264
8036	NC_003911	GCAGG	2	10	363753	363762	20 %	0 %	60 %	20 %	56695264
8037	NC_003911	TGG	2	6	363809	363814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695264
8038	NC_003911	GCC	2	6	363864	363869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695264
8039	NC_003911	CTGG	2	8	363906	363913	0 %	25 %	50 %	25 %	56695264
8040	NC_003911	GCC	2	6	363996	364001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695264
8041	NC_003911	CTG	2	6	364125	364130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695264
8042	NC_003911	CCGA	2	8	364210	364217	25 %	0 %	25 %	50 %	56695264
8043	NC_003911	CAG	2	6	364242	364247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695264
8044	NC_003911	GTC	2	6	364248	364253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695264
8045	NC_003911	CGG	2	6	364283	364288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695264
8046	NC_003911	ACA	2	6	364429	364434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56695264
8047	NC_003911	CGA	2	6	364454	364459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695264
8048	NC_003911	GCC	2	6	364473	364478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695264
8049	NC_003911	TCCGG	2	10	364531	364540	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
8050	NC_003911	CGC	2	6	364549	364554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8051	NC_003911	GCG	2	6	364571	364576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8052	NC_003911	GA	3	6	364625	364630	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8053	NC_003911	CGG	2	6	364723	364728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695265
8054	NC_003911	GGGT	2	8	364751	364758	0 %	25 %	75 %	0 %	56695265
8055	NC_003911	GCCTCG	2	12	364779	364790	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	56695265
8056	NC_003911	GGCGCT	2	12	364820	364831	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	56695265
8057	NC_003911	TGC	2	6	364834	364839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695265
8058	NC_003911	TTG	2	6	364842	364847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56695265
8059	NC_003911	GCT	2	6	364952	364957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695265
8060	NC_003911	CG	3	6	364962	364967	0 %	0 %	50 %	50 %	56695265
8061	NC_003911	TTG	2	6	364980	364985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56695265
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8063	NC_003911	G	6	6	364998	365003	0 %	0 %	100 %	0 %	56695265
8064	NC_003911	TGC	2	6	365032	365037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695265
8065	NC_003911	GCGG	2	8	365136	365143	0 %	0 %	75 %	25 %	56695265
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8070	NC_003911	CG	3	6	365282	365287	0 %	0 %	50 %	50 %	56695265
8071	NC_003911	CTG	3	9	365295	365303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695265
8072	NC_003911	CTGG	2	8	365327	365334	0 %	25 %	50 %	25 %	56695265
8073	NC_003911	CAT	2	6	365346	365351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695265
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8076	NC_003911	GC	3	6	365507	365512	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8077	NC_003911	CGT	2	6	365526	365531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695266
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8081	NC_003911	GGCGC	2	10	365739	365748	0 %	0 %	60 %	40 %	56695266
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8088	NC_003911	GC	4	8	366032	366039	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8089	NC_003911	TGC	2	6	366061	366066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8091	NC_003911	T	6	6	366076	366081	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8092	NC_003911	A	6	6	366099	366104	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8095	NC_003911	ATC	2	6	366243	366248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695267
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8097	NC_003911	CG	4	8	366290	366297	0 %	0 %	50 %	50 %	56695267
8098	NC_003911	GGC	2	6	366308	366313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695267
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8100	NC_003911	GC	3	6	366334	366339	0 %	0 %	50 %	50 %	56695267
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8105	NC_003911	GCC	2	6	366534	366539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695267
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8108	NC_003911	GAT	2	6	366635	366640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695267
8109	NC_003911	CTG	2	6	366660	366665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695267
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8111	NC_003911	GC	3	6	366745	366750	0 %	0 %	50 %	50 %	56695267
8112	NC_003911	ATCC	2	8	366786	366793	25 %	25 %	0 %	50 %	56695267
8113	NC_003911	TCG	2	6	366854	366859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695267
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8123	NC_003911	GAT	2	6	367253	367258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695268
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8125	NC_003911	GCT	2	6	367283	367288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695268
8126	NC_003911	GCG	3	9	367332	367340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695268
8127	NC_003911	CTG	2	6	367344	367349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695268
8128	NC_003911	ATC	2	6	367371	367376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695268
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8133	NC_003911	CAT	2	6	367704	367709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695269
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8142	NC_003911	CGA	2	6	368183	368188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695270
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8147	NC_003911	GACCT	2	10	368478	368487	20 %	20 %	20 %	40 %	56695270
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8157	NC_003911	CTG	2	6	368861	368866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695271
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8182	NC_003911	A	6	6	370376	370381	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8335	NC_003911	GGTG	2	8	378698	378705	0 %	25 %	75 %	0 %	56695280
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8375	NC_003911	CCG	2	6	380970	380975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695283
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8378	NC_003911	GCC	2	6	381133	381138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695283
8379	NC_003911	TCCGG	2	10	381165	381174	0 %	20 %	40 %	40 %	56695283
8380	NC_003911	GCG	3	9	381175	381183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695283
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8382	NC_003911	CCG	2	6	381209	381214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695283
8383	NC_003911	TCG	2	6	381217	381222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695283
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8399	NC_003911	GC	3	6	381841	381846	0 %	0 %	50 %	50 %	56695283
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8491	NC_003911	GC	3	6	387217	387222	0 %	0 %	50 %	50 %	56695287
8492	NC_003911	CGGG	2	8	387234	387241	0 %	0 %	75 %	25 %	56695287
8493	NC_003911	CGC	2	6	387300	387305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695287
8494	NC_003911	CT	3	6	387343	387348	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8495	NC_003911	CGA	2	6	387409	387414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8496	NC_003911	GCT	2	6	387445	387450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8497	NC_003911	GC	3	6	387451	387456	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8498	NC_003911	GAC	2	6	387473	387478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8499	NC_003911	GCT	2	6	387484	387489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8500	NC_003911	GCCC	2	8	387492	387499	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding

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