MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria pomeroyi DSS-3 chromosome

Total Repeats: 93706

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_003911	CGC	2	6	295893	295898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695196
6502	NC_003911	GTT	2	6	295940	295945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6503	NC_003911	GTG	2	6	296006	296011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6504	NC_003911	GTG	2	6	296024	296029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6505	NC_003911	CGTTCA	2	12	296033	296044	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6506	NC_003911	CGC	2	6	296300	296305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695197
6507	NC_003911	CG	3	6	296422	296427	0 %	0 %	50 %	50 %	56695198
6508	NC_003911	AAG	2	6	296499	296504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56695198
6509	NC_003911	CCAG	2	8	296507	296514	25 %	0 %	25 %	50 %	56695198
6510	NC_003911	GCC	3	9	296527	296535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695198
6511	NC_003911	CCG	2	6	296567	296572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695198
6512	NC_003911	GCCA	2	8	296578	296585	25 %	0 %	25 %	50 %	56695198
6513	NC_003911	GCCAG	2	10	296612	296621	20 %	0 %	40 %	40 %	56695198
6514	NC_003911	GCCA	2	8	296623	296630	25 %	0 %	25 %	50 %	56695198
6515	NC_003911	GCC	2	6	296658	296663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695198
6516	NC_003911	CCAG	2	8	296672	296679	25 %	0 %	25 %	50 %	56695198
6517	NC_003911	CGC	2	6	296703	296708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695198
6518	NC_003911	GCC	2	6	296713	296718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695198
6519	NC_003911	CTGCG	2	10	296721	296730	0 %	20 %	40 %	40 %	56695198
6520	NC_003911	GC	4	8	296746	296753	0 %	0 %	50 %	50 %	56695198
6521	NC_003911	CAG	2	6	296754	296759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695198
6522	NC_003911	GCC	2	6	296778	296783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695198
6523	NC_003911	AGC	2	6	296788	296793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695198
6524	NC_003911	GCC	3	9	296803	296811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695198
6525	NC_003911	TTG	2	6	296815	296820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56695198
6526	NC_003911	TGG	2	6	296837	296842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695198
6527	NC_003911	CG	3	6	296889	296894	0 %	0 %	50 %	50 %	56695198
6528	NC_003911	CAT	2	6	296958	296963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695198
6529	NC_003911	GT	3	6	296969	296974	0 %	50 %	50 %	0 %	56695198
6530	NC_003911	TC	3	6	296991	296996	0 %	50 %	0 %	50 %	56695199
6531	NC_003911	CGATTT	2	12	297074	297085	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	56695199
6532	NC_003911	CGG	2	6	297139	297144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695199
6533	NC_003911	GC	3	6	297145	297150	0 %	0 %	50 %	50 %	56695199
6534	NC_003911	GCC	2	6	297160	297165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695199
6535	NC_003911	CCAGCC	2	12	297172	297183	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	56695199
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6538	NC_003911	GCTT	2	8	297319	297326	0 %	50 %	25 %	25 %	56695199
6539	NC_003911	GT	3	6	297340	297345	0 %	50 %	50 %	0 %	56695199
6540	NC_003911	TGG	2	6	297483	297488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695199
6541	NC_003911	CGG	2	6	297499	297504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695199
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6545	NC_003911	TGG	2	6	297685	297690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695199
6546	NC_003911	CCG	2	6	297691	297696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695199
6547	NC_003911	GC	3	6	297739	297744	0 %	0 %	50 %	50 %	56695199
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6553	NC_003911	TGG	2	6	297997	298002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695199
6554	NC_003911	CCGC	2	8	298008	298015	0 %	0 %	25 %	75 %	56695199
6555	NC_003911	CGC	4	12	298013	298024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695199
6556	NC_003911	CGA	2	6	298090	298095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695199
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6558	NC_003911	GGC	2	6	298140	298145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695199
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6560	NC_003911	CGGT	2	8	298218	298225	0 %	25 %	50 %	25 %	56695199
6561	NC_003911	GATC	2	8	298237	298244	25 %	25 %	25 %	25 %	56695199
6562	NC_003911	GGC	2	6	298294	298299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695200
6563	NC_003911	TGG	2	6	298302	298307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695200
6564	NC_003911	GGGCC	2	10	298418	298427	0 %	0 %	60 %	40 %	56695200
6565	NC_003911	ACC	2	6	298457	298462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695200
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6567	NC_003911	GCC	2	6	298589	298594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695200
6568	NC_003911	CAA	2	6	298632	298637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56695200
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6570	NC_003911	ATG	3	9	298684	298692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695201
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6572	NC_003911	TCA	2	6	298838	298843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695201
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6574	NC_003911	GCA	2	6	298892	298897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695201
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6579	NC_003911	TCG	2	6	299265	299270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695202
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6582	NC_003911	CCAT	2	8	299409	299416	25 %	25 %	0 %	50 %	56695202
6583	NC_003911	GCA	2	6	299434	299439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695202
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6591	NC_003911	GCC	2	6	299701	299706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695202
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6593	NC_003911	CAC	2	6	299780	299785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695202
6594	NC_003911	CAG	2	6	299786	299791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695202
6595	NC_003911	CTT	2	6	299843	299848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56695202
6596	NC_003911	TCA	2	6	299875	299880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695202
6597	NC_003911	CGG	2	6	300049	300054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695202
6598	NC_003911	GGC	2	6	300102	300107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6599	NC_003911	GCC	2	6	300190	300195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6601	NC_003911	GGC	2	6	300297	300302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6602	NC_003911	CGC	2	6	300351	300356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6603	NC_003911	GGCA	2	8	300359	300366	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6604	NC_003911	TGCC	2	8	300372	300379	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6605	NC_003911	GT	3	6	300405	300410	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6606	NC_003911	CG	3	6	300429	300434	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6607	NC_003911	TGG	2	6	300435	300440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6608	NC_003911	CCTG	2	8	300505	300512	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6609	NC_003911	GC	3	6	300522	300527	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6610	NC_003911	ACC	2	6	300535	300540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6611	NC_003911	CA	3	6	300544	300549	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6612	NC_003911	ACC	2	6	300574	300579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6613	NC_003911	AAC	2	6	300642	300647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6614	NC_003911	CGGG	2	8	300675	300682	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6615	NC_003911	CAGAGC	2	12	300719	300730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6616	NC_003911	ACA	2	6	300738	300743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6617	NC_003911	CG	3	6	300786	300791	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6618	NC_003911	CTG	2	6	300882	300887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695203
6619	NC_003911	CCGCG	2	10	300961	300970	0 %	0 %	40 %	60 %	56695203
6620	NC_003911	CCCG	2	8	300971	300978	0 %	0 %	25 %	75 %	56695203
6621	NC_003911	CGC	2	6	300999	301004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695203
6622	NC_003911	GCCC	2	8	301013	301020	0 %	0 %	25 %	75 %	56695203
6623	NC_003911	CCGCG	2	10	301064	301073	0 %	0 %	40 %	60 %	56695203
6624	NC_003911	CG	5	10	301070	301079	0 %	0 %	50 %	50 %	56695203
6625	NC_003911	GCG	2	6	301141	301146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695203
6626	NC_003911	GC	3	6	301180	301185	0 %	0 %	50 %	50 %	56695203
6627	NC_003911	TGA	2	6	301189	301194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695203
6628	NC_003911	CGA	2	6	301217	301222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695203
6629	NC_003911	GGC	2	6	301234	301239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695203
6630	NC_003911	CGGG	2	8	301247	301254	0 %	0 %	75 %	25 %	56695203
6631	NC_003911	GGC	2	6	301280	301285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695203
6632	NC_003911	GGC	2	6	301336	301341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695203
6633	NC_003911	ATG	2	6	301380	301385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695203
6634	NC_003911	GGTGCT	2	12	301427	301438	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	56695203
6635	NC_003911	TGC	2	6	301528	301533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695203
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6638	NC_003911	GA	3	6	301619	301624	50 %	0 %	50 %	0 %	56695203
6639	NC_003911	GC	4	8	301664	301671	0 %	0 %	50 %	50 %	56695204
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6642	NC_003911	ATT	2	6	301731	301736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56695204
6643	NC_003911	GGCGAT	2	12	301762	301773	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	56695204
6644	NC_003911	GCTGGT	2	12	301795	301806	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	56695204
6645	NC_003911	TGA	2	6	301828	301833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695204
6646	NC_003911	GC	3	6	301837	301842	0 %	0 %	50 %	50 %	56695204
6647	NC_003911	CGC	3	9	301840	301848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695204
6648	NC_003911	TGC	2	6	301866	301871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695204
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6650	NC_003911	TGACC	2	10	301957	301966	20 %	20 %	20 %	40 %	56695204
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6654	NC_003911	GTC	2	6	302183	302188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695204
6655	NC_003911	ATG	2	6	302299	302304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695205
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6657	NC_003911	CG	4	8	302336	302343	0 %	0 %	50 %	50 %	56695205
6658	NC_003911	GCC	2	6	302350	302355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695205
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6683	NC_003911	G	6	6	303229	303234	0 %	0 %	100 %	0 %	56695206
6684	NC_003911	G	6	6	303241	303246	0 %	0 %	100 %	0 %	56695206
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6703	NC_003911	CTGA	2	8	304169	304176	25 %	25 %	25 %	25 %	56695207
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6734	NC_003911	TGG	2	6	305991	305996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695208
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6746	NC_003911	CG	3	6	306241	306246	0 %	0 %	50 %	50 %	56695208
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7000	NC_003911	CTG	2	6	316877	316882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695217

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