MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ralstonia solanacearum GMI1000 plasmid pGMI1000MP

Total Repeats: 55900

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_003296	AGCA	2	8	453098	453105	50 %	0 %	25 %	25 %	17548569
12003	NC_003296	GCA	2	6	453132	453137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17548569
12004	NC_003296	GCT	2	6	453187	453192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17548569
12005	NC_003296	CAA	2	6	453214	453219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17548569
12006	NC_003296	CAA	2	6	453250	453255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17548569
12007	NC_003296	CCA	2	6	453264	453269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17548569
12008	NC_003296	GGT	2	6	453280	453285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17548569
12009	NC_003296	GTC	2	6	453311	453316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17548569
12010	NC_003296	GCG	2	6	453318	453323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17548569
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12012	NC_003296	CAA	2	6	453394	453399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17548569
12013	NC_003296	CAG	2	6	453476	453481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17548569
12014	NC_003296	GCTG	2	8	453486	453493	0 %	25 %	50 %	25 %	17548569
12015	NC_003296	TTC	2	6	453500	453505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17548569
12016	NC_003296	CTG	2	6	453582	453587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17548570
12017	NC_003296	ACC	2	6	453639	453644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17548570
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12021	NC_003296	GCG	2	6	453787	453792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17548570
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12026	NC_003296	GCT	3	9	453923	453931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17548570
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12041	NC_003296	GTC	2	6	454323	454328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17548570
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12053	NC_003296	TGCGC	2	10	454628	454637	0 %	20 %	40 %	40 %	17548570
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12056	NC_003296	CGG	2	6	454774	454779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17548571
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12063	NC_003296	GCT	2	6	454958	454963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17548571
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12099	NC_003296	CGGC	2	8	455982	455989	0 %	0 %	50 %	50 %	17548572
12100	NC_003296	GGCT	2	8	456040	456047	0 %	25 %	50 %	25 %	17548572
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12105	NC_003296	CTT	2	6	456226	456231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17548572
12106	NC_003296	GCC	2	6	456236	456241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17548572
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12110	NC_003296	CGC	2	6	456418	456423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17548572
12111	NC_003296	GCG	2	6	456459	456464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17548572
12112	NC_003296	GTG	2	6	456539	456544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17548572
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12116	NC_003296	CGA	2	6	456697	456702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17548572
12117	NC_003296	CAGC	2	8	456703	456710	25 %	0 %	25 %	50 %	17548572
12118	NC_003296	CGG	3	9	456712	456720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17548572
12119	NC_003296	CGG	2	6	456727	456732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17548572
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12121	NC_003296	ACCGGC	2	12	456911	456922	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	17548572
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12123	NC_003296	GCG	2	6	456990	456995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17548572
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12233	NC_003296	GCA	2	6	460805	460810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17548575
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12237	NC_003296	CGG	2	6	460904	460909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17548575
12238	NC_003296	ATG	2	6	460921	460926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17548575
12239	NC_003296	GAT	2	6	460946	460951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17548575
12240	NC_003296	CT	3	6	461061	461066	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12241	NC_003296	TTC	2	6	461135	461140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17548576
12242	NC_003296	ACGC	2	8	461198	461205	25 %	0 %	25 %	50 %	17548576
12243	NC_003296	CAT	2	6	461217	461222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17548576
12244	NC_003296	GGGCA	2	10	461307	461316	20 %	0 %	60 %	20 %	17548576
12245	NC_003296	CGC	2	6	461347	461352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17548576
12246	NC_003296	CGTC	2	8	461379	461386	0 %	25 %	25 %	50 %	17548576
12247	NC_003296	GGC	2	6	461390	461395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17548576
12248	NC_003296	GCC	2	6	461406	461411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17548576
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12250	NC_003296	CTG	2	6	461436	461441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17548576
12251	NC_003296	TCA	2	6	461510	461515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17548576
12252	NC_003296	CTG	3	9	461574	461582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17548576
12253	NC_003296	GCT	2	6	461627	461632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17548576
12254	NC_003296	CATG	2	8	461645	461652	25 %	25 %	25 %	25 %	17548576
12255	NC_003296	GC	3	6	461662	461667	0 %	0 %	50 %	50 %	17548576
12256	NC_003296	CGGG	2	8	461688	461695	0 %	0 %	75 %	25 %	17548576
12257	NC_003296	TGG	2	6	461739	461744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17548576
12258	NC_003296	CTG	2	6	461766	461771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17548576
12259	NC_003296	GCG	2	6	461807	461812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17548576
12260	NC_003296	CGT	2	6	461828	461833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17548576
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12262	NC_003296	ACG	2	6	461932	461937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17548577
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12264	NC_003296	CGC	2	6	461975	461980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17548577
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12267	NC_003296	GCT	2	6	462230	462235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17548577
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12270	NC_003296	CAG	2	6	462317	462322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17548577
12271	NC_003296	CGGAT	2	10	462329	462338	20 %	20 %	40 %	20 %	17548577
12272	NC_003296	GCC	2	6	462417	462422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17548578
12273	NC_003296	GAAA	2	8	462429	462436	75 %	0 %	25 %	0 %	17548578
12274	NC_003296	TGG	2	6	462443	462448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17548578
12275	NC_003296	GCG	2	6	462471	462476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17548578
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12280	NC_003296	GC	3	6	462662	462667	0 %	0 %	50 %	50 %	17548578
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12282	NC_003296	TG	3	6	462735	462740	0 %	50 %	50 %	0 %	17548578
12283	NC_003296	GCTG	2	8	462771	462778	0 %	25 %	50 %	25 %	17548578
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12290	NC_003296	CTG	2	6	463053	463058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17548578
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12297	NC_003296	CGCC	2	8	463442	463449	0 %	0 %	25 %	75 %	17548578
12298	NC_003296	ATGCCC	2	12	463561	463572	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	17548578
12299	NC_003296	CGG	2	6	463604	463609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12300	NC_003296	ACG	2	6	463611	463616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12302	NC_003296	GAGG	2	8	463655	463662	25 %	0 %	75 %	0 %	17548579
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12307	NC_003296	TCA	2	6	463804	463809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17548579
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12310	NC_003296	AGCCGA	2	12	464077	464088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17548579
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12329	NC_003296	ATC	2	6	465209	465214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17548580
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12333	NC_003296	GTA	2	6	465343	465348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17548580
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12343	NC_003296	CG	3	6	465811	465816	0 %	0 %	50 %	50 %	17548581
12344	NC_003296	CAG	2	6	465837	465842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17548581
12345	NC_003296	CAG	2	6	465987	465992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17548581
12346	NC_003296	GCGGG	2	10	466029	466038	0 %	0 %	80 %	20 %	17548581
12347	NC_003296	G	8	8	466036	466043	0 %	0 %	100 %	0 %	17548581
12348	NC_003296	GTTCAT	2	12	466056	466067	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	17548581
12349	NC_003296	TGC	2	6	466093	466098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17548582
12350	NC_003296	CGAA	2	8	466108	466115	50 %	0 %	25 %	25 %	17548582
12351	NC_003296	GGC	2	6	466144	466149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17548582
12352	NC_003296	CCA	2	6	466159	466164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17548582
12353	NC_003296	GCG	2	6	466171	466176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17548582
12354	NC_003296	TCA	2	6	466227	466232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17548582
12355	NC_003296	TGCA	2	8	466388	466395	25 %	25 %	25 %	25 %	17548582
12356	NC_003296	CGCC	2	8	466516	466523	0 %	0 %	25 %	75 %	17548582
12357	NC_003296	CTC	2	6	466544	466549	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	17548582
12358	NC_003296	TCA	2	6	466555	466560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17548582
12359	NC_003296	ACC	3	9	466695	466703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17548582
12360	NC_003296	CAGGCG	2	12	466712	466723	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	17548582
12361	NC_003296	GCGGCA	2	12	466809	466820	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	17548582
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12484	NC_003296	GTC	2	6	471454	471459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17548586
12485	NC_003296	GCTTG	2	10	471516	471525	0 %	40 %	40 %	20 %	17548586
12486	NC_003296	CAGG	2	8	471631	471638	25 %	0 %	50 %	25 %	17548586
12487	NC_003296	TCA	2	6	471648	471653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17548586
12488	NC_003296	CCG	2	6	471654	471659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17548586
12489	NC_003296	TCA	2	6	471666	471671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17548586
12490	NC_003296	CCT	2	6	471681	471686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	17548586
12491	NC_003296	GCTG	2	8	471733	471740	0 %	25 %	50 %	25 %	17548586
12492	NC_003296	CCA	2	6	471777	471782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17548586
12493	NC_003296	CGC	2	6	471816	471821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17548586
12494	NC_003296	CCG	2	6	471840	471845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17548586
12495	NC_003296	GCA	2	6	471891	471896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17548586
12496	NC_003296	ACGC	2	8	471904	471911	25 %	0 %	25 %	50 %	17548586
12497	NC_003296	GCCGC	2	10	471939	471948	0 %	0 %	40 %	60 %	17548586
12498	NC_003296	GCAGCG	2	12	472017	472028	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	17548586
12499	NC_003296	GCT	2	6	472113	472118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17548586
12500	NC_003296	TCG	2	6	472163	472168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17548586

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