MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ralstonia solanacearum GMI1000 chromosome

Total Repeats: 102168

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_003295	CGGC	2	8	429753	429760	0 %	0 %	50 %	50 %	17545119
12002	NC_003295	GCT	2	6	429763	429768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17545119
12003	NC_003295	GCC	2	6	429785	429790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17545119
12004	NC_003295	GAC	2	6	429792	429797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17545119
12005	NC_003295	CGA	2	6	429810	429815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12006	NC_003295	GCCT	2	8	429868	429875	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12007	NC_003295	GC	3	6	429876	429881	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12008	NC_003295	CGCGC	3	15	429922	429936	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
12009	NC_003295	CCGCCC	2	12	429940	429951	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
12010	NC_003295	GCC	2	6	429953	429958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12011	NC_003295	GCC	2	6	430000	430005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17545120
12012	NC_003295	GCC	2	6	430009	430014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17545120
12013	NC_003295	TGC	2	6	430072	430077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17545120
12014	NC_003295	CGG	2	6	430093	430098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17545120
12015	NC_003295	CTA	2	6	430106	430111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17545120
12016	NC_003295	GAC	2	6	430167	430172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17545120
12017	NC_003295	GCC	2	6	430179	430184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17545120
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12019	NC_003295	CTA	2	6	430199	430204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17545120
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12021	NC_003295	GC	3	6	430231	430236	0 %	0 %	50 %	50 %	17545120
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12041	NC_003295	ATCG	2	8	430847	430854	25 %	25 %	25 %	25 %	17545120
12042	NC_003295	CGGC	2	8	430858	430865	0 %	0 %	50 %	50 %	17545120
12043	NC_003295	CTG	2	6	430908	430913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17545120
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12048	NC_003295	TGC	2	6	431080	431085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17545121
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12052	NC_003295	TCG	2	6	431296	431301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17545121
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12058	NC_003295	ATC	2	6	431422	431427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17545121
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12064	NC_003295	GGGC	2	8	431718	431725	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12065	NC_003295	CGG	2	6	431728	431733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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12110	NC_003295	CGT	2	6	433544	433549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17545124
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12120	NC_003295	GCTC	2	8	433772	433779	0 %	25 %	25 %	50 %	17545124
12121	NC_003295	CG	3	6	433853	433858	0 %	0 %	50 %	50 %	17545124
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12124	NC_003295	GCG	2	6	433970	433975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17545124
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12144	NC_003295	GC	3	6	434848	434853	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12145	NC_003295	GCG	2	6	434896	434901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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12211	NC_003295	GC	3	6	437145	437150	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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12232	NC_003295	GGC	2	6	437897	437902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17545128
12233	NC_003295	GCG	2	6	437905	437910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17545128
12234	NC_003295	TGG	2	6	437914	437919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17545128
12235	NC_003295	CGG	2	6	437966	437971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12236	NC_003295	GGC	2	6	437987	437992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17545129
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12238	NC_003295	GCACG	2	10	438016	438025	20 %	0 %	40 %	40 %	17545129
12239	NC_003295	GGC	2	6	438044	438049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17545129
12240	NC_003295	CGC	2	6	438064	438069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17545129
12241	NC_003295	CGT	2	6	438097	438102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17545129
12242	NC_003295	TGA	2	6	438106	438111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17545129
12243	NC_003295	CCGCG	2	10	438112	438121	0 %	0 %	40 %	60 %	17545129
12244	NC_003295	TCG	2	6	438126	438131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17545129
12245	NC_003295	CGT	2	6	438199	438204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17545129
12246	NC_003295	TGGCGA	2	12	438286	438297	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	17545129
12247	NC_003295	CGG	2	6	438334	438339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17545129
12248	NC_003295	GCA	2	6	438349	438354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17545129
12249	NC_003295	CAC	2	6	438374	438379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17545129
12250	NC_003295	GTC	2	6	438410	438415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17545129
12251	NC_003295	GC	3	6	438462	438467	0 %	0 %	50 %	50 %	17545129
12252	NC_003295	GCA	2	6	438490	438495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17545129
12253	NC_003295	GCG	2	6	438501	438506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17545129
12254	NC_003295	GAG	2	6	438515	438520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	17545129
12255	NC_003295	GCG	2	6	438536	438541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17545129
12256	NC_003295	ATCGG	2	10	438558	438567	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
12257	NC_003295	GC	3	6	438633	438638	0 %	0 %	50 %	50 %	17545130
12258	NC_003295	GTT	2	6	438694	438699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17545130
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12260	NC_003295	GTC	2	6	438772	438777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17545130
12261	NC_003295	AGC	2	6	438782	438787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17545130
12262	NC_003295	CGG	2	6	438807	438812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17545130
12263	NC_003295	TCA	2	6	438813	438818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17545130
12264	NC_003295	ACC	2	6	438854	438859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17545130
12265	NC_003295	GAT	2	6	438880	438885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17545130
12266	NC_003295	GCGG	2	8	438933	438940	0 %	0 %	75 %	25 %	17545130
12267	NC_003295	AGGTC	2	10	438981	438990	20 %	20 %	40 %	20 %	17545130
12268	NC_003295	CGC	2	6	439038	439043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17545130
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12273	NC_003295	ACC	2	6	439169	439174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17545130
12274	NC_003295	CAG	2	6	439180	439185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17545130
12275	NC_003295	GCA	2	6	439200	439205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17545130
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12277	NC_003295	GAG	2	6	439220	439225	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	17545130
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12279	NC_003295	GTC	2	6	439295	439300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17545131
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12281	NC_003295	GGC	2	6	439421	439426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17545131
12282	NC_003295	GTC	2	6	439463	439468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17545131
12283	NC_003295	CGG	2	6	439486	439491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17545131
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12286	NC_003295	TGA	2	6	439615	439620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17545131
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12291	NC_003295	CGG	2	6	439844	439849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12292	NC_003295	AGC	2	6	439866	439871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12293	NC_003295	GC	3	6	439920	439925	0 %	0 %	50 %	50 %	17545132
12294	NC_003295	CGG	2	6	439938	439943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17545132
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12300	NC_003295	GCG	2	6	440199	440204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17545132
12301	NC_003295	CG	3	6	440217	440222	0 %	0 %	50 %	50 %	17545132
12302	NC_003295	ATG	2	6	440243	440248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17545132
12303	NC_003295	CGTG	2	8	440256	440263	0 %	25 %	50 %	25 %	17545132
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12306	NC_003295	CCG	2	6	440285	440290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17545132
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12308	NC_003295	GGT	2	6	440377	440382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17545132
12309	NC_003295	CCTCGA	2	12	440415	440426	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	17545132
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12311	NC_003295	TGC	2	6	440453	440458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17545132
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12314	NC_003295	CG	3	6	440583	440588	0 %	0 %	50 %	50 %	17545132
12315	NC_003295	TGGC	2	8	440609	440616	0 %	25 %	50 %	25 %	17545132
12316	NC_003295	CGG	2	6	440619	440624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17545132
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12320	NC_003295	GCAGC	2	10	440728	440737	20 %	0 %	40 %	40 %	17545132
12321	NC_003295	CG	4	8	440749	440756	0 %	0 %	50 %	50 %	17545132
12322	NC_003295	CGG	2	6	440763	440768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17545132
12323	NC_003295	CTG	2	6	440818	440823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17545132
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12327	NC_003295	GCC	2	6	440902	440907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12328	NC_003295	GC	3	6	440912	440917	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12329	NC_003295	CGC	2	6	441007	441012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12330	NC_003295	TTG	2	6	441056	441061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12331	NC_003295	GCG	2	6	441085	441090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12332	NC_003295	CGCA	2	8	441101	441108	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12333	NC_003295	GCAT	2	8	441169	441176	25 %	25 %	25 %	25 %	17545133
12334	NC_003295	CGC	2	6	441178	441183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17545133
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12339	NC_003295	GCC	2	6	441251	441256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17545133
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12350	NC_003295	TGC	2	6	441631	441636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17545133
12351	NC_003295	GTG	2	6	441654	441659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17545133
12352	NC_003295	CTG	3	9	441660	441668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17545133
12353	NC_003295	GTG	2	6	441672	441677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17545133
12354	NC_003295	CGAC	2	8	441697	441704	25 %	0 %	25 %	50 %	17545133
12355	NC_003295	CGG	2	6	441727	441732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17545133
12356	NC_003295	ATC	2	6	441738	441743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17545133
12357	NC_003295	GCT	2	6	441779	441784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17545133
12358	NC_003295	TGG	2	6	441802	441807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17545133
12359	NC_003295	CG	3	6	441809	441814	0 %	0 %	50 %	50 %	17545133
12360	NC_003295	CTG	3	9	441843	441851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17545133
12361	NC_003295	GGC	2	6	441866	441871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17545133
12362	NC_003295	GGA	3	9	441959	441967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	17545133
12363	NC_003295	TGC	2	6	441988	441993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17545133
12364	NC_003295	TTC	2	6	442002	442007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17545133
12365	NC_003295	TGC	2	6	442021	442026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17545133
12366	NC_003295	CG	3	6	442033	442038	0 %	0 %	50 %	50 %	17545133
12367	NC_003295	GC	4	8	442119	442126	0 %	0 %	50 %	50 %	17545133
12368	NC_003295	GCG	2	6	442138	442143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17545133
12369	NC_003295	TGC	2	6	442198	442203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17545133
12370	NC_003295	GATC	2	8	442229	442236	25 %	25 %	25 %	25 %	17545133
12371	NC_003295	GCT	2	6	442238	442243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17545133
12372	NC_003295	GGC	2	6	442259	442264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17545133
12373	NC_003295	TGC	2	6	442267	442272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17545133
12374	NC_003295	TGC	2	6	442279	442284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17545133
12375	NC_003295	GCGAT	2	10	442309	442318	20 %	20 %	40 %	20 %	17545133
12376	NC_003295	CGC	2	6	442376	442381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17545133
12377	NC_003295	TCA	2	6	442408	442413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17545133
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12380	NC_003295	GCG	2	6	442551	442556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17545133
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12383	NC_003295	GCG	3	9	442593	442601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17545133
12384	NC_003295	TGC	2	6	442642	442647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17545133
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12392	NC_003295	GTG	2	6	442821	442826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17545133
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12395	NC_003295	GC	3	6	442851	442856	0 %	0 %	50 %	50 %	17545133
12396	NC_003295	CTG	2	6	442863	442868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17545133
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12400	NC_003295	TCG	2	6	443086	443091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17545133
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12411	NC_003295	CTG	2	6	443307	443312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17545134
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12419	NC_003295	CGGG	2	8	443579	443586	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12420	NC_003295	GC	3	6	443595	443600	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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12488	NC_003295	GCG	3	9	445523	445531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17545137
12489	NC_003295	GGC	2	6	445535	445540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17545137
12490	NC_003295	CGC	2	6	445554	445559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17545137
12491	NC_003295	GC	3	6	445558	445563	0 %	0 %	50 %	50 %	17545137
12492	NC_003295	GGGCTG	2	12	445604	445615	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	17545137
12493	NC_003295	CG	3	6	445639	445644	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12494	NC_003295	CAGG	2	8	445646	445653	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12495	NC_003295	GGC	2	6	445675	445680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12496	NC_003295	CCG	3	9	445717	445725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12497	NC_003295	GCA	2	6	445760	445765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17545138
12498	NC_003295	GCG	2	6	445808	445813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17545138
12499	NC_003295	CCA	2	6	445823	445828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17545138
12500	NC_003295	CGC	2	6	445838	445843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17545138

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