MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ralstonia solanacearum GMI1000 chromosome

Total Repeats: 102168

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_003295	TCGT	2	8	230871	230878	0 %	50 %	25 %	25 %	17544926
6502	NC_003295	CCG	2	6	230914	230919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17544926
6503	NC_003295	CGT	2	6	231004	231009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17544926
6504	NC_003295	GCC	2	6	231024	231029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17544926
6505	NC_003295	GCT	2	6	231069	231074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17544926
6506	NC_003295	TGG	2	6	231084	231089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17544926
6507	NC_003295	TGGC	2	8	231093	231100	0 %	25 %	50 %	25 %	17544926
6508	NC_003295	CGG	3	9	231128	231136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17544926
6509	NC_003295	TGG	2	6	231142	231147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17544926
6510	NC_003295	ATC	2	6	231150	231155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17544926
6511	NC_003295	CGG	3	9	231182	231190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17544926
6512	NC_003295	GGC	2	6	231207	231212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17544926
6513	NC_003295	CG	3	6	231216	231221	0 %	0 %	50 %	50 %	17544926
6514	NC_003295	TGC	2	6	231329	231334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6515	NC_003295	GC	3	6	231379	231384	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6516	NC_003295	TGT	2	6	231420	231425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6517	NC_003295	GCG	2	6	231464	231469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6518	NC_003295	CGC	2	6	231531	231536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6519	NC_003295	TGC	2	6	231574	231579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6520	NC_003295	CTG	2	6	231631	231636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6521	NC_003295	TGT	2	6	231727	231732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6522	NC_003295	TGT	2	6	231787	231792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6523	NC_003295	CGA	2	6	231814	231819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6524	NC_003295	GAT	2	6	231842	231847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6525	NC_003295	CGC	2	6	231856	231861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6526	NC_003295	CCG	2	6	231890	231895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6527	NC_003295	A	6	6	231920	231925	100 %	0 %	0 %	0 %	17544927
6528	NC_003295	TGC	2	6	232017	232022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17544927
6529	NC_003295	CGC	2	6	232027	232032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17544927
6530	NC_003295	GAGG	2	8	232063	232070	25 %	0 %	75 %	0 %	17544927
6531	NC_003295	TGC	2	6	232119	232124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17544927
6532	NC_003295	TGG	2	6	232157	232162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17544927
6533	NC_003295	TCG	2	6	232165	232170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17544927
6534	NC_003295	ACG	2	6	232203	232208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17544927
6535	NC_003295	GGC	2	6	232239	232244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17544927
6536	NC_003295	ACG	2	6	232314	232319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17544927
6537	NC_003295	TCG	2	6	232332	232337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17544927
6538	NC_003295	GCT	2	6	232375	232380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17544927
6539	NC_003295	CGG	2	6	232398	232403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17544927
6540	NC_003295	GAA	2	6	232447	232452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17544927
6541	NC_003295	GGT	2	6	232546	232551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17544927
6542	NC_003295	AGC	2	6	232563	232568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17544927
6543	NC_003295	GCCGC	2	10	232588	232597	0 %	0 %	40 %	60 %	17544927
6544	NC_003295	GGT	2	6	232600	232605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17544927
6545	NC_003295	TGGA	2	8	232618	232625	25 %	25 %	50 %	0 %	17544927
6546	NC_003295	GA	3	6	232837	232842	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6547	NC_003295	ATG	2	6	232846	232851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6548	NC_003295	GTT	2	6	232881	232886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6549	NC_003295	GCC	2	6	232902	232907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6550	NC_003295	TC	3	6	233027	233032	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6551	NC_003295	AGG	2	6	233119	233124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	17544928
6552	NC_003295	GAG	2	6	233129	233134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	17544928
6553	NC_003295	GCAG	2	8	233151	233158	25 %	0 %	50 %	25 %	17544928
6554	NC_003295	AGA	2	6	233215	233220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17544928
6555	NC_003295	GCG	2	6	233319	233324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17544928
6556	NC_003295	CTGGGC	2	12	233336	233347	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	17544928
6557	NC_003295	CAG	2	6	233399	233404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17544928
6558	NC_003295	ACA	2	6	233407	233412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17544928
6559	NC_003295	AAT	2	6	233466	233471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6560	NC_003295	A	6	6	233526	233531	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6561	NC_003295	A	6	6	233546	233551	100 %	0 %	0 %	0 %	17544929
6562	NC_003295	ACG	2	6	233583	233588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17544929
6563	NC_003295	GCG	2	6	233593	233598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17544929
6564	NC_003295	GCTCT	2	10	233606	233615	0 %	40 %	20 %	40 %	17544929
6565	NC_003295	CA	3	6	233701	233706	50 %	0 %	0 %	50 %	17544929
6566	NC_003295	TGG	2	6	233852	233857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17544929
6567	NC_003295	GCA	2	6	233930	233935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17544929
6568	NC_003295	GAT	2	6	233964	233969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6569	NC_003295	GTT	2	6	233986	233991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6570	NC_003295	GC	3	6	234086	234091	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6571	NC_003295	CGC	2	6	234122	234127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17544930
6572	NC_003295	CG	3	6	234346	234351	0 %	0 %	50 %	50 %	17544930
6573	NC_003295	CCG	2	6	234385	234390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17544930
6574	NC_003295	CG	3	6	234389	234394	0 %	0 %	50 %	50 %	17544930
6575	NC_003295	CGT	2	6	234428	234433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17544930
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6577	NC_003295	CCT	2	6	234496	234501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	17544930
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6580	NC_003295	CAG	2	6	234665	234670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17544930
6581	NC_003295	CGG	2	6	234723	234728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6582	NC_003295	GGATT	2	10	234734	234743	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
6583	NC_003295	GCG	2	6	234814	234819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6584	NC_003295	CGT	2	6	234823	234828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6585	NC_003295	CAT	2	6	234867	234872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6586	NC_003295	GCG	3	9	234891	234899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6587	NC_003295	TGAG	2	8	234913	234920	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6588	NC_003295	CTGGT	2	10	235016	235025	0 %	40 %	40 %	20 %	17544931
6589	NC_003295	TGA	2	6	235098	235103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17544931
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6592	NC_003295	CGC	2	6	235298	235303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17544931
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6594	NC_003295	CGG	2	6	235422	235427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17544931
6595	NC_003295	GAT	2	6	235573	235578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17544931
6596	NC_003295	GTA	2	6	235585	235590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17544931
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6598	NC_003295	GCT	2	6	235667	235672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6599	NC_003295	CACT	2	8	235675	235682	25 %	25 %	0 %	50 %	17544932
6600	NC_003295	CAA	2	6	235696	235701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17544932
6601	NC_003295	GTC	2	6	235733	235738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17544932
6602	NC_003295	TCCT	2	8	235769	235776	0 %	50 %	0 %	50 %	17544932
6603	NC_003295	GCA	2	6	235780	235785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17544932
6604	NC_003295	CGA	2	6	235811	235816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17544932
6605	NC_003295	GGCA	2	8	235922	235929	25 %	0 %	50 %	25 %	17544932
6606	NC_003295	ACG	2	6	235935	235940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17544932
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6608	NC_003295	GCC	2	6	236072	236077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17544932
6609	NC_003295	TGCG	2	8	236081	236088	0 %	25 %	50 %	25 %	17544932
6610	NC_003295	CAAA	2	8	236116	236123	75 %	0 %	0 %	25 %	17544932
6611	NC_003295	CGG	2	6	236158	236163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17544932
6612	NC_003295	TGA	2	6	236212	236217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17544932
6613	NC_003295	GCG	2	6	236248	236253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17544932
6614	NC_003295	GC	3	6	236338	236343	0 %	0 %	50 %	50 %	17544932
6615	NC_003295	CAG	3	9	236375	236383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17544932
6616	NC_003295	CGAG	2	8	236398	236405	25 %	0 %	50 %	25 %	17544932
6617	NC_003295	CAAA	2	8	236414	236421	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6618	NC_003295	GCG	2	6	236438	236443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6619	NC_003295	TGG	2	6	236472	236477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6620	NC_003295	CTG	2	6	236511	236516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17544933
6621	NC_003295	TTC	2	6	236517	236522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17544933
6622	NC_003295	GTCG	2	8	236525	236532	0 %	25 %	50 %	25 %	17544933
6623	NC_003295	GCC	2	6	236556	236561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17544933
6624	NC_003295	CAC	2	6	236591	236596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17544933
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6626	NC_003295	TCA	2	6	236871	236876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17544933
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6747	NC_003295	GC	3	6	241781	241786	0 %	0 %	50 %	50 %	17544937
6748	NC_003295	ATG	2	6	241813	241818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17544937
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6750	NC_003295	CGGG	2	8	241842	241849	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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6752	NC_003295	CGG	2	6	241921	241926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6753	NC_003295	CCG	2	6	241938	241943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17544938
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