MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia conorii str. Malish 7

Total Repeats: 32366

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_003103	ATTT	2	8	40300	40307	25 %	75 %	0 %	0 %	15891965
1002	NC_003103	TAC	2	6	40311	40316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15891965
1003	NC_003103	AGA	2	6	40353	40358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15891965
1004	NC_003103	TAT	2	6	40359	40364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891965
1005	NC_003103	GAA	2	6	40374	40379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15891965
1006	NC_003103	AGT	2	6	40398	40403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15891965
1007	NC_003103	TTA	2	6	40406	40411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891965
1008	NC_003103	A	7	7	40446	40452	100 %	0 %	0 %	0 %	15891965
1009	NC_003103	A	6	6	40460	40465	100 %	0 %	0 %	0 %	15891965
1010	NC_003103	GAT	2	6	40468	40473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15891965
1011	NC_003103	TCT	3	9	40535	40543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15891965
1012	NC_003103	ACAA	2	8	40570	40577	75 %	0 %	0 %	25 %	15891965
1013	NC_003103	ACA	2	6	40587	40592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15891965
1014	NC_003103	ATT	2	6	40640	40645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891965
1015	NC_003103	TGA	2	6	40700	40705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15891966
1016	NC_003103	TCA	2	6	40716	40721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15891966
1017	NC_003103	AAAT	2	8	40774	40781	75 %	25 %	0 %	0 %	15891966
1018	NC_003103	TTA	2	6	40785	40790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891966
1019	NC_003103	TTC	3	9	40823	40831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15891966
1020	NC_003103	TCT	2	6	40905	40910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15891966
1021	NC_003103	TAT	2	6	40969	40974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891966
1022	NC_003103	GAA	2	6	40987	40992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15891966
1023	NC_003103	A	6	6	40991	40996	100 %	0 %	0 %	0 %	15891966
1024	NC_003103	AT	3	6	41027	41032	50 %	50 %	0 %	0 %	15891966
1025	NC_003103	GTT	2	6	41049	41054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15891966
1026	NC_003103	T	6	6	41064	41069	0 %	100 %	0 %	0 %	15891966
1027	NC_003103	A	6	6	41075	41080	100 %	0 %	0 %	0 %	15891966
1028	NC_003103	CTT	2	6	41134	41139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15891966
1029	NC_003103	GT	3	6	41142	41147	0 %	50 %	50 %	0 %	15891966
1030	NC_003103	TA	3	6	41267	41272	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_003103	AT	3	6	41273	41278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_003103	ATT	2	6	41293	41298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_003103	AAT	2	6	41313	41318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891967
1034	NC_003103	T	6	6	41326	41331	0 %	100 %	0 %	0 %	15891967
1035	NC_003103	TAT	2	6	41349	41354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891967
1036	NC_003103	TTA	2	6	41420	41425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891967
1037	NC_003103	T	6	6	41445	41450	0 %	100 %	0 %	0 %	15891967
1038	NC_003103	AT	3	6	41457	41462	50 %	50 %	0 %	0 %	15891967
1039	NC_003103	AT	3	6	41481	41486	50 %	50 %	0 %	0 %	15891967
1040	NC_003103	AAT	2	6	41505	41510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891967
1041	NC_003103	TAC	2	6	41649	41654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15891967
1042	NC_003103	T	6	6	41671	41676	0 %	100 %	0 %	0 %	15891967
1043	NC_003103	GTA	2	6	41734	41739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15891967
1044	NC_003103	GGA	2	6	41761	41766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15891967
1045	NC_003103	ATT	2	6	41792	41797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891967
1046	NC_003103	AAT	2	6	41881	41886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891967
1047	NC_003103	CT	3	6	41895	41900	0 %	50 %	0 %	50 %	15891967
1048	NC_003103	GAT	2	6	41923	41928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15891967
1049	NC_003103	GAT	2	6	41974	41979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15891967
1050	NC_003103	ATT	2	6	42022	42027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_003103	ATG	2	6	42120	42125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_003103	CAAA	2	8	42135	42142	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1053	NC_003103	TAAT	2	8	42212	42219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_003103	ATTA	2	8	42247	42254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_003103	TG	3	6	42256	42261	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_003103	TAAA	2	8	42265	42272	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_003103	TAAGT	2	10	42290	42299	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_003103	TAA	2	6	42343	42348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_003103	T	8	8	42357	42364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_003103	AGT	2	6	42386	42391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15891968
1061	NC_003103	ATT	2	6	42392	42397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891968
1062	NC_003103	GCT	2	6	42400	42405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15891968
1063	NC_003103	GCG	2	6	42425	42430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15891968
1064	NC_003103	ATT	2	6	42434	42439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891968
1065	NC_003103	CGG	2	6	42441	42446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15891968
1066	NC_003103	TCT	2	6	42455	42460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15891968
1067	NC_003103	ATGA	2	8	42473	42480	50 %	25 %	25 %	0 %	15891968
1068	NC_003103	ATA	2	6	42516	42521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891968
1069	NC_003103	ATT	2	6	42527	42532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891968
1070	NC_003103	ATATTA	2	12	42570	42581	50 %	50 %	0 %	0 %	15891968
1071	NC_003103	TAT	2	6	42619	42624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891968
1072	NC_003103	TAAC	2	8	42663	42670	50 %	25 %	0 %	25 %	15891968
1073	NC_003103	AAT	4	12	42737	42748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891969
1074	NC_003103	AAAGCT	2	12	42757	42768	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15891969
1075	NC_003103	TACTAA	2	12	42817	42828	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15891969
1076	NC_003103	GAGAG	2	10	42835	42844	40 %	0 %	60 %	0 %	15891969
1077	NC_003103	CAAAC	2	10	42887	42896	60 %	0 %	0 %	40 %	15891969
1078	NC_003103	ATTC	2	8	42950	42957	25 %	50 %	0 %	25 %	15891969
1079	NC_003103	ACGTA	2	10	43051	43060	40 %	20 %	20 %	20 %	15891969
1080	NC_003103	GTA	2	6	43076	43081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15891969
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1082	NC_003103	ATG	2	6	43197	43202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15891969
1083	NC_003103	GCC	2	6	43205	43210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15891969
1084	NC_003103	GCA	2	6	43267	43272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15891969
1085	NC_003103	AAT	2	6	43289	43294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891969
1086	NC_003103	ATGT	2	8	43295	43302	25 %	50 %	25 %	0 %	15891969
1087	NC_003103	TAACT	2	10	43318	43327	40 %	40 %	0 %	20 %	15891969
1088	NC_003103	ATTT	2	8	43443	43450	25 %	75 %	0 %	0 %	15891970
1089	NC_003103	AGC	2	6	43483	43488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15891970
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1091	NC_003103	GCA	2	6	43579	43584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15891970
1092	NC_003103	CCA	2	6	43595	43600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15891970
1093	NC_003103	AGC	2	6	43671	43676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_003103	ATA	2	6	43703	43708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_003103	TGC	2	6	43724	43729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_003103	A	6	6	43764	43769	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_003103	GCA	2	6	43780	43785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_003103	TTC	2	6	43842	43847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_003103	AGAAA	2	10	43922	43931	80 %	0 %	20 %	0 %	15891971
1100	NC_003103	AAG	2	6	43999	44004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15891971
1101	NC_003103	AT	3	6	44021	44026	50 %	50 %	0 %	0 %	15891971
1102	NC_003103	TTG	2	6	44081	44086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15891971
1103	NC_003103	CTT	2	6	44122	44127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15891971
1104	NC_003103	TTTTTA	2	12	44139	44150	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	15891971
1105	NC_003103	ATCA	2	8	44201	44208	50 %	25 %	0 %	25 %	15891971
1106	NC_003103	AT	3	6	44217	44222	50 %	50 %	0 %	0 %	15891971
1107	NC_003103	ATT	2	6	44255	44260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891971
1108	NC_003103	TA	4	8	44290	44297	50 %	50 %	0 %	0 %	15891971
1109	NC_003103	GTTTC	2	10	44362	44371	0 %	60 %	20 %	20 %	15891971
1110	NC_003103	TAT	2	6	44432	44437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891971
1111	NC_003103	T	6	6	44442	44447	0 %	100 %	0 %	0 %	15891971
1112	NC_003103	TGCC	2	8	44511	44518	0 %	25 %	25 %	50 %	15891971
1113	NC_003103	ATC	2	6	44522	44527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15891971
1114	NC_003103	TC	3	6	44526	44531	0 %	50 %	0 %	50 %	15891971
1115	NC_003103	TGC	2	6	44582	44587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15891971
1116	NC_003103	GCA	2	6	44589	44594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15891971
1117	NC_003103	GAT	2	6	44614	44619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15891971
1118	NC_003103	TAT	2	6	44623	44628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891971
1119	NC_003103	CCG	2	6	44646	44651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15891971
1120	NC_003103	CAT	2	6	44735	44740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15891971
1121	NC_003103	TTA	2	6	44781	44786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891971
1122	NC_003103	AGA	2	6	44787	44792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15891971
1123	NC_003103	TTA	2	6	44800	44805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891971
1124	NC_003103	CTT	2	6	44854	44859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15891971
1125	NC_003103	T	6	6	44889	44894	0 %	100 %	0 %	0 %	15891971
1126	NC_003103	ATTTT	2	10	44911	44920	20 %	80 %	0 %	0 %	15891971
1127	NC_003103	T	6	6	44917	44922	0 %	100 %	0 %	0 %	15891971
1128	NC_003103	CTT	2	6	44998	45003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15891971
1129	NC_003103	GCA	2	6	45056	45061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15891971
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1131	NC_003103	TATC	2	8	45070	45077	25 %	50 %	0 %	25 %	15891971
1132	NC_003103	TTAA	2	8	45093	45100	50 %	50 %	0 %	0 %	15891971
1133	NC_003103	AT	3	6	45173	45178	50 %	50 %	0 %	0 %	15891971
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