MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia conorii str. Malish 7

Total Repeats: 32366

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_003103	AGCAG	2	10	20226	20235	40 %	0 %	40 %	20 %	15891942
502	NC_003103	TAA	2	6	20246	20251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891942
503	NC_003103	AGATGT	2	12	20261	20272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15891942
504	NC_003103	A	6	6	20336	20341	100 %	0 %	0 %	0 %	15891942
505	NC_003103	TA	3	6	20377	20382	50 %	50 %	0 %	0 %	15891942
506	NC_003103	CAA	2	6	20397	20402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15891942
507	NC_003103	AAG	2	6	20407	20412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15891942
508	NC_003103	TAA	2	6	20428	20433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891942
509	NC_003103	AT	3	6	20508	20513	50 %	50 %	0 %	0 %	15891942
510	NC_003103	CTC	2	6	20521	20526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15891942
511	NC_003103	GAAGCT	2	12	20541	20552	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	15891942
512	NC_003103	ATA	2	6	20590	20595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891942
513	NC_003103	A	6	6	20601	20606	100 %	0 %	0 %	0 %	15891942
514	NC_003103	CTA	2	6	20632	20637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15891942
515	NC_003103	TA	3	6	20636	20641	50 %	50 %	0 %	0 %	15891942
516	NC_003103	GTTA	2	8	20649	20656	25 %	50 %	25 %	0 %	15891942
517	NC_003103	AT	3	6	20679	20684	50 %	50 %	0 %	0 %	15891942
518	NC_003103	ATT	2	6	20750	20755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891942
519	NC_003103	AGA	2	6	20798	20803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15891942
520	NC_003103	AAGGAA	2	12	20838	20849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15891942
521	NC_003103	A	6	6	20953	20958	100 %	0 %	0 %	0 %	15891942
522	NC_003103	TGA	2	6	21038	21043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15891942
523	NC_003103	A	6	6	21163	21168	100 %	0 %	0 %	0 %	15891942
524	NC_003103	TAA	2	6	21182	21187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891942
525	NC_003103	TAAA	2	8	21208	21215	75 %	25 %	0 %	0 %	15891942
526	NC_003103	ATG	3	9	21337	21345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15891942
527	NC_003103	AGT	2	6	21351	21356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15891942
528	NC_003103	TGT	2	6	21362	21367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15891942
529	NC_003103	TAA	2	6	21398	21403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891942
530	NC_003103	TA	3	6	21420	21425	50 %	50 %	0 %	0 %	15891942
531	NC_003103	A	6	6	21448	21453	100 %	0 %	0 %	0 %	15891942
532	NC_003103	AGA	2	6	21455	21460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15891942
533	NC_003103	A	6	6	21466	21471	100 %	0 %	0 %	0 %	15891942
534	NC_003103	AGA	2	6	21473	21478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15891942
535	NC_003103	AAG	2	6	21523	21528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15891942
536	NC_003103	TA	3	6	21537	21542	50 %	50 %	0 %	0 %	15891942
537	NC_003103	A	6	6	21577	21582	100 %	0 %	0 %	0 %	15891942
538	NC_003103	ATG	2	6	21616	21621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15891942
539	NC_003103	A	6	6	21622	21627	100 %	0 %	0 %	0 %	15891942
540	NC_003103	TTC	2	6	21629	21634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15891942
541	NC_003103	GAA	2	6	21645	21650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15891942
542	NC_003103	TACCT	2	10	21716	21725	20 %	40 %	0 %	40 %	15891942
543	NC_003103	GAA	2	6	21735	21740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15891942
544	NC_003103	AAG	2	6	21742	21747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15891942
545	NC_003103	AAGT	2	8	21754	21761	50 %	25 %	25 %	0 %	15891942
546	NC_003103	GCATTA	2	12	21807	21818	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15891942
547	NC_003103	TAG	2	6	21857	21862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15891942
548	NC_003103	GAA	2	6	21870	21875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15891942
549	NC_003103	GAA	3	9	21900	21908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15891942
550	NC_003103	TCCGAT	2	12	21924	21935	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15891942
551	NC_003103	A	7	7	21992	21998	100 %	0 %	0 %	0 %	15891942
552	NC_003103	GTT	2	6	22050	22055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15891942
553	NC_003103	ATA	2	6	22069	22074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891942
554	NC_003103	TAA	2	6	22112	22117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891942
555	NC_003103	TGA	2	6	22139	22144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15891942
556	NC_003103	AGA	2	6	22145	22150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15891942
557	NC_003103	TAA	2	6	22196	22201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891942
558	NC_003103	CTA	2	6	22252	22257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15891942
559	NC_003103	AAT	2	6	22281	22286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891942
560	NC_003103	TTCA	2	8	22312	22319	25 %	50 %	0 %	25 %	15891942
561	NC_003103	ATTTAA	2	12	22322	22333	50 %	50 %	0 %	0 %	15891942
562	NC_003103	AAT	2	6	22344	22349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891942
563	NC_003103	TTA	2	6	22360	22365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891942
564	NC_003103	GAA	2	6	22406	22411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15891942
565	NC_003103	TTA	2	6	22450	22455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891942
566	NC_003103	AAC	2	6	22463	22468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15891942
567	NC_003103	TTA	2	6	22576	22581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891942
568	NC_003103	TA	3	6	22624	22629	50 %	50 %	0 %	0 %	15891942
569	NC_003103	AAT	2	6	22677	22682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891942
570	NC_003103	AT	3	6	22681	22686	50 %	50 %	0 %	0 %	15891942
571	NC_003103	TAA	2	6	22742	22747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891942
572	NC_003103	AATA	2	8	22805	22812	75 %	25 %	0 %	0 %	15891942
573	NC_003103	GTT	2	6	22815	22820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15891942
574	NC_003103	ATA	2	6	22831	22836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891942
575	NC_003103	TAT	2	6	22898	22903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891942
576	NC_003103	TAC	2	6	22919	22924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15891942
577	NC_003103	ATT	2	6	22942	22947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891942
578	NC_003103	TAAA	2	8	22951	22958	75 %	25 %	0 %	0 %	15891942
579	NC_003103	TCA	2	6	22970	22975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15891942
580	NC_003103	TA	3	6	23037	23042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_003103	ACTA	2	8	23087	23094	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
582	NC_003103	ACC	2	6	23141	23146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
583	NC_003103	TATAA	2	10	23204	23213	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_003103	AAT	2	6	23221	23226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_003103	CAC	2	6	23242	23247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
586	NC_003103	AGAAAA	2	12	23328	23339	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
587	NC_003103	TAC	2	6	23459	23464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_003103	AAT	2	6	23601	23606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891943
589	NC_003103	AAC	2	6	23797	23802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_003103	TTAT	2	8	23803	23810	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_003103	TAA	2	6	23848	23853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_003103	TTA	2	6	23866	23871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_003103	AGCA	2	8	23877	23884	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
594	NC_003103	AT	3	6	23890	23895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_003103	CTT	2	6	23925	23930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_003103	AAT	2	6	24004	24009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_003103	AAG	2	6	24092	24097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
598	NC_003103	CAAATA	2	12	24119	24130	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
599	NC_003103	AGT	2	6	24139	24144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
600	NC_003103	A	6	6	24184	24189	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_003103	TAA	2	6	24203	24208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_003103	TAA	2	6	24224	24229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_003103	A	7	7	24228	24234	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_003103	TAAAGT	2	12	24282	24293	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
605	NC_003103	AG	3	6	24304	24309	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
606	NC_003103	AAGT	2	8	24329	24336	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
607	NC_003103	ACA	2	6	24375	24380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15891944
608	NC_003103	AGA	2	6	24384	24389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15891944
609	NC_003103	TTA	2	6	24506	24511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891944
610	NC_003103	GAA	2	6	24592	24597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15891944
611	NC_003103	ATA	2	6	24601	24606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891944
612	NC_003103	TAT	2	6	24647	24652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891944
613	NC_003103	TAAT	2	8	24707	24714	50 %	50 %	0 %	0 %	15891944
614	NC_003103	TAC	2	6	24744	24749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15891944
615	NC_003103	ATA	2	6	24755	24760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891944
616	NC_003103	TGA	2	6	24768	24773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15891944
617	NC_003103	ATATT	2	10	24782	24791	40 %	60 %	0 %	0 %	15891944
618	NC_003103	A	6	6	24808	24813	100 %	0 %	0 %	0 %	15891944
619	NC_003103	ATATT	2	10	24820	24829	40 %	60 %	0 %	0 %	15891944
620	NC_003103	A	6	6	24843	24848	100 %	0 %	0 %	0 %	15891944
621	NC_003103	AAGA	2	8	24859	24866	75 %	0 %	25 %	0 %	15891944
622	NC_003103	TAG	2	6	24878	24883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15891944
623	NC_003103	GTA	2	6	24893	24898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15891944
624	NC_003103	TGC	2	6	24903	24908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15891944
625	NC_003103	AAAT	2	8	24951	24958	75 %	25 %	0 %	0 %	15891944
626	NC_003103	ATTA	2	8	24980	24987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_003103	GAT	2	6	25004	25009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
628	NC_003103	TAC	2	6	25029	25034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_003103	ATT	2	6	25036	25041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_003103	GAA	2	6	25123	25128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
631	NC_003103	GAA	2	6	25144	25149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
632	NC_003103	AT	3	6	25265	25270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_003103	AAATA	2	10	25271	25280	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_003103	GAT	2	6	25334	25339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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