MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia conorii str. Malish 7

Total Repeats: 32366

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_003103	CAG	2	6	239263	239268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15892152
6002	NC_003103	TTA	2	6	239296	239301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15892152
6003	NC_003103	TCTT	2	8	239309	239316	0 %	75 %	0 %	25 %	15892152
6004	NC_003103	TTC	2	6	239321	239326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15892152
6005	NC_003103	CTT	2	6	239383	239388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15892152
6006	NC_003103	ATT	2	6	239393	239398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15892152
6007	NC_003103	TTG	2	6	239442	239447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15892152
6008	NC_003103	CCTTG	2	10	239448	239457	0 %	40 %	20 %	40 %	15892152
6009	NC_003103	TAA	2	6	239459	239464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15892152
6010	NC_003103	TATT	2	8	239488	239495	25 %	75 %	0 %	0 %	15892152
6011	NC_003103	TTA	2	6	239502	239507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15892152
6012	NC_003103	TTA	2	6	239527	239532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15892152
6013	NC_003103	TCT	2	6	239586	239591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15892152
6014	NC_003103	TTC	2	6	239621	239626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15892152
6015	NC_003103	AAT	2	6	239641	239646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15892152
6016	NC_003103	TTTC	2	8	239692	239699	0 %	75 %	0 %	25 %	15892152
6017	NC_003103	AGA	2	6	239799	239804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15892152
6018	NC_003103	ATT	3	9	239810	239818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15892152
6019	NC_003103	AATA	2	8	239835	239842	75 %	25 %	0 %	0 %	15892152
6020	NC_003103	TGC	2	6	239853	239858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15892152
6021	NC_003103	ATT	2	6	239882	239887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15892152
6022	NC_003103	A	6	6	239892	239897	100 %	0 %	0 %	0 %	15892152
6023	NC_003103	T	6	6	239898	239903	0 %	100 %	0 %	0 %	15892152
6024	NC_003103	ACAA	2	8	239931	239938	75 %	0 %	0 %	25 %	15892152
6025	NC_003103	T	6	6	239976	239981	0 %	100 %	0 %	0 %	15892152
6026	NC_003103	TTC	2	6	239984	239989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15892152
6027	NC_003103	ATATT	2	10	240001	240010	40 %	60 %	0 %	0 %	15892152
6028	NC_003103	AAC	2	6	240011	240016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15892152
6029	NC_003103	TAT	2	6	240038	240043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15892152
6030	NC_003103	ATT	2	6	240044	240049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15892152
6031	NC_003103	AAAAT	2	10	240070	240079	80 %	20 %	0 %	0 %	15892152
6032	NC_003103	TAA	2	6	240121	240126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15892152
6033	NC_003103	TTA	2	6	240138	240143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15892152
6034	NC_003103	GA	3	6	240186	240191	50 %	0 %	50 %	0 %	15892152
6035	NC_003103	TGG	2	6	240217	240222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15892153
6036	NC_003103	T	7	7	240294	240300	0 %	100 %	0 %	0 %	15892153
6037	NC_003103	CAT	2	6	240321	240326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15892153
6038	NC_003103	AGT	2	6	240369	240374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15892153
6039	NC_003103	TTCTTT	2	12	240424	240435	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	15892153
6040	NC_003103	CAT	2	6	240453	240458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15892153
6041	NC_003103	ATA	2	6	240612	240617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15892153
6042	NC_003103	CTT	2	6	240701	240706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15892153
6043	NC_003103	GCG	2	6	240715	240720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15892153
6044	NC_003103	GCG	2	6	240755	240760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15892153
6045	NC_003103	TCATT	2	10	240761	240770	20 %	60 %	0 %	20 %	15892153
6046	NC_003103	TTC	2	6	240801	240806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15892153
6047	NC_003103	T	6	6	240822	240827	0 %	100 %	0 %	0 %	15892153
6048	NC_003103	ACT	2	6	240874	240879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15892153
6049	NC_003103	TCA	2	6	240883	240888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15892153
6050	NC_003103	T	8	8	240892	240899	0 %	100 %	0 %	0 %	15892153
6051	NC_003103	AAT	2	6	240946	240951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15892153
6052	NC_003103	TAA	2	6	240983	240988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_003103	GGA	2	6	241081	241086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_003103	AGA	2	6	241172	241177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_003103	T	8	8	241237	241244	0 %	100 %	0 %	0 %	15892154
6056	NC_003103	TC	3	6	241278	241283	0 %	50 %	0 %	50 %	15892154
6057	NC_003103	GAT	2	6	241378	241383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_003103	TTA	2	6	241407	241412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_003103	ATA	2	6	241452	241457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_003103	A	6	6	241532	241537	100 %	0 %	0 %	0 %	15892155
6061	NC_003103	TTTC	2	8	241549	241556	0 %	75 %	0 %	25 %	15892155
6062	NC_003103	T	6	6	241571	241576	0 %	100 %	0 %	0 %	15892155
6063	NC_003103	TTC	2	6	241580	241585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15892155
6064	NC_003103	TGC	2	6	241687	241692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15892155
6065	NC_003103	TG	3	6	241716	241721	0 %	50 %	50 %	0 %	15892155
6066	NC_003103	TC	3	6	241774	241779	0 %	50 %	0 %	50 %	15892155
6067	NC_003103	AGC	2	6	241787	241792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15892155
6068	NC_003103	GTT	2	6	241984	241989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15892155
6069	NC_003103	CCATG	2	10	242002	242011	20 %	20 %	20 %	40 %	15892155
6070	NC_003103	T	6	6	242028	242033	0 %	100 %	0 %	0 %	15892155
6071	NC_003103	TGC	2	6	242091	242096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15892155
6072	NC_003103	AGT	2	6	242132	242137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15892155
6073	NC_003103	T	7	7	242208	242214	0 %	100 %	0 %	0 %	15892155
6074	NC_003103	TGA	2	6	242297	242302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15892155
6075	NC_003103	TCT	2	6	242303	242308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15892155
6076	NC_003103	AAG	2	6	242331	242336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15892155
6077	NC_003103	TCC	3	9	242381	242389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15892155
6078	NC_003103	TTG	2	6	242399	242404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15892155
6079	NC_003103	AGC	2	6	242438	242443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15892155
6080	NC_003103	T	6	6	242446	242451	0 %	100 %	0 %	0 %	15892155
6081	NC_003103	CAT	2	6	242467	242472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15892155
6082	NC_003103	AGT	2	6	242519	242524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15892155
6083	NC_003103	T	6	6	242561	242566	0 %	100 %	0 %	0 %	15892155
6084	NC_003103	TAA	2	6	242610	242615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15892155
6085	NC_003103	TCGCT	2	10	242723	242732	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
6086	NC_003103	TACTTC	2	12	242750	242761	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15892156
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6088	NC_003103	T	6	6	242793	242798	0 %	100 %	0 %	0 %	15892156
6089	NC_003103	CAT	2	6	242799	242804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15892156
6090	NC_003103	GCA	2	6	242819	242824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15892156
6091	NC_003103	TCTTT	2	10	242895	242904	0 %	80 %	0 %	20 %	15892156
6092	NC_003103	TGC	2	6	242953	242958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15892156
6093	NC_003103	TGA	2	6	242980	242985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15892156
6094	NC_003103	T	6	6	243012	243017	0 %	100 %	0 %	0 %	15892156
6095	NC_003103	TAAAC	2	10	243026	243035	60 %	20 %	0 %	20 %	15892156
6096	NC_003103	GCA	2	6	243041	243046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15892156
6097	NC_003103	T	6	6	243047	243052	0 %	100 %	0 %	0 %	15892156
6098	NC_003103	TCA	2	6	243083	243088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15892156
6099	NC_003103	ACC	2	6	243139	243144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15892156
6100	NC_003103	GCTT	2	8	243178	243185	0 %	50 %	25 %	25 %	15892156
6101	NC_003103	TAT	2	6	243303	243308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15892156
6102	NC_003103	ATC	2	6	243364	243369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15892156
6103	NC_003103	TAG	2	6	243396	243401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15892156
6104	NC_003103	TAG	2	6	243405	243410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15892156
6105	NC_003103	CGC	2	6	243438	243443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15892156
6106	NC_003103	TAA	3	9	243481	243489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15892156
6107	NC_003103	CTT	2	6	243501	243506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15892156
6108	NC_003103	AGC	2	6	243529	243534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15892156
6109	NC_003103	GAA	2	6	243586	243591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15892156
6110	NC_003103	T	7	7	243592	243598	0 %	100 %	0 %	0 %	15892156
6111	NC_003103	CTT	2	6	243603	243608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15892156
6112	NC_003103	CTA	2	6	243636	243641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15892156
6113	NC_003103	TAC	2	6	243643	243648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15892156
6114	NC_003103	T	6	6	243711	243716	0 %	100 %	0 %	0 %	15892156
6115	NC_003103	ATC	2	6	243724	243729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15892156
6116	NC_003103	CTA	2	6	243785	243790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15892156
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6118	NC_003103	CTT	2	6	243864	243869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15892156
6119	NC_003103	T	6	6	243919	243924	0 %	100 %	0 %	0 %	15892156
6120	NC_003103	TTG	2	6	243993	243998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15892156
6121	NC_003103	CCG	2	6	244052	244057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15892156
6122	NC_003103	GCA	2	6	244118	244123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15892156
6123	NC_003103	ATT	2	6	244136	244141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15892156
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