MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia prowazekii str. Madrid E chromosome

Total Repeats: 30188

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_000963	TAT	2	6	111228	111233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_000963	AT	3	6	111248	111253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_000963	ATTT	2	8	111262	111269	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_000963	GGTGTT	2	12	111325	111336	0 %	50 %	50 %	0 %	15603977
3005	NC_000963	TAA	2	6	111345	111350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15603977
3006	NC_000963	AGA	2	6	111376	111381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15603977
3007	NC_000963	TA	3	6	111437	111442	50 %	50 %	0 %	0 %	15603977
3008	NC_000963	AT	3	6	111501	111506	50 %	50 %	0 %	0 %	15603977
3009	NC_000963	ATG	2	6	111518	111523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15603977
3010	NC_000963	A	6	6	111557	111562	100 %	0 %	0 %	0 %	15603977
3011	NC_000963	AGC	2	6	111576	111581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15603977
3012	NC_000963	GTA	2	6	111741	111746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15603978
3013	NC_000963	AATC	2	8	111747	111754	50 %	25 %	0 %	25 %	15603978
3014	NC_000963	TAA	2	6	111755	111760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15603978
3015	NC_000963	TAA	2	6	111776	111781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15603978
3016	NC_000963	TCTT	2	8	111794	111801	0 %	75 %	0 %	25 %	15603978
3017	NC_000963	AAGA	2	8	111810	111817	75 %	0 %	25 %	0 %	15603978
3018	NC_000963	AGTAG	2	10	111879	111888	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_000963	CTA	2	6	111900	111905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3020	NC_000963	ATA	2	6	111914	111919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_000963	TAG	2	6	112049	112054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_000963	TGA	2	6	112065	112070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_000963	CACTA	2	10	112140	112149	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
3024	NC_000963	CATA	2	8	112259	112266	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3025	NC_000963	AATAC	2	10	112284	112293	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3026	NC_000963	TA	3	6	112315	112320	50 %	50 %	0 %	0 %	15603979
3027	NC_000963	TAA	2	6	112325	112330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15603979
3028	NC_000963	ATA	2	6	112345	112350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15603979
3029	NC_000963	A	6	6	112350	112355	100 %	0 %	0 %	0 %	15603979
3030	NC_000963	GATT	2	8	112358	112365	25 %	50 %	25 %	0 %	15603979
3031	NC_000963	TCA	2	6	112382	112387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15603979
3032	NC_000963	AAATC	2	10	112418	112427	60 %	20 %	0 %	20 %	15603979
3033	NC_000963	TTG	2	6	112456	112461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15603979
3034	NC_000963	ATA	2	6	112488	112493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15603979
3035	NC_000963	TAA	3	9	112505	112513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15603979
3036	NC_000963	TTA	2	6	112585	112590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15603979
3037	NC_000963	TTA	2	6	112664	112669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15603979
3038	NC_000963	GTTA	2	8	112694	112701	25 %	50 %	25 %	0 %	15603979
3039	NC_000963	AAG	2	6	112718	112723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15603979
3040	NC_000963	AAG	2	6	112743	112748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15603979
3041	NC_000963	TTA	2	6	112758	112763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15603979
3042	NC_000963	ATT	2	6	112788	112793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15603979
3043	NC_000963	ACT	2	6	112867	112872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15603979
3044	NC_000963	TA	3	6	112883	112888	50 %	50 %	0 %	0 %	15603979
3045	NC_000963	AGT	2	6	112893	112898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15603979
3046	NC_000963	AAG	2	6	112906	112911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15603979
3047	NC_000963	GA	3	6	112916	112921	50 %	0 %	50 %	0 %	15603979
3048	NC_000963	TAG	2	6	112980	112985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_000963	AT	3	6	113030	113035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_000963	AT	3	6	113038	113043	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_000963	CTA	2	6	113128	113133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3052	NC_000963	TA	3	6	113137	113142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_000963	AAT	2	6	113143	113148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_000963	TAT	3	9	113151	113159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_000963	ATG	2	6	113213	113218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_000963	TAAA	2	8	113235	113242	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_000963	ATT	2	6	113274	113279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_000963	TAT	2	6	113297	113302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_000963	TTA	2	6	113374	113379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_000963	TAA	2	6	113396	113401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_000963	TAA	2	6	113446	113451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_000963	ATA	2	6	113523	113528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_000963	AGTA	2	8	113616	113623	50 %	25 %	25 %	0 %	543938667
3064	NC_000963	TATT	2	8	113663	113670	25 %	75 %	0 %	0 %	543938667
3065	NC_000963	TAG	2	6	113717	113722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543938667
3066	NC_000963	TTATA	2	10	113724	113733	40 %	60 %	0 %	0 %	543938667
3067	NC_000963	TAAA	2	8	113768	113775	75 %	25 %	0 %	0 %	543938667
3068	NC_000963	TAA	2	6	113799	113804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543938667
3069	NC_000963	TAC	2	6	113809	113814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543938667
3070	NC_000963	AT	3	6	113831	113836	50 %	50 %	0 %	0 %	543938667
3071	NC_000963	T	6	6	113846	113851	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_000963	GTAAT	2	10	113862	113871	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_000963	AGG	2	6	113923	113928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_000963	ATA	2	6	113929	113934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_000963	A	6	6	113970	113975	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_000963	A	6	6	113997	114002	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_000963	AGC	2	6	114043	114048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15603980
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3079	NC_000963	TTA	2	6	114146	114151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15603980
3080	NC_000963	TTA	2	6	114156	114161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15603980
3081	NC_000963	GAT	2	6	114191	114196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15603980
3082	NC_000963	TGCTT	2	10	114229	114238	0 %	60 %	20 %	20 %	15603980
3083	NC_000963	AGA	2	6	114284	114289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15603980
3084	NC_000963	TTA	2	6	114357	114362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15603980
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3086	NC_000963	TA	3	6	114423	114428	50 %	50 %	0 %	0 %	15603980
3087	NC_000963	TA	3	6	114438	114443	50 %	50 %	0 %	0 %	15603980
3088	NC_000963	TGG	2	6	114454	114459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15603980
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3091	NC_000963	AAG	2	6	114485	114490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15603980
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3093	NC_000963	GAAA	2	8	114541	114548	75 %	0 %	25 %	0 %	15603980
3094	NC_000963	TAAT	2	8	114669	114676	50 %	50 %	0 %	0 %	15603980
3095	NC_000963	TGA	2	6	114721	114726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15603980
3096	NC_000963	TACC	2	8	114732	114739	25 %	25 %	0 %	50 %	15603980
3097	NC_000963	ATT	2	6	114745	114750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15603980
3098	NC_000963	T	6	6	114749	114754	0 %	100 %	0 %	0 %	15603980
3099	NC_000963	AAG	2	6	114775	114780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15603980
3100	NC_000963	ATC	2	6	114806	114811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15603980
3101	NC_000963	ACA	2	6	114943	114948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15603980
3102	NC_000963	TTG	2	6	114990	114995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15603980
3103	NC_000963	CTA	2	6	115020	115025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15603980
3104	NC_000963	GCG	2	6	115026	115031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15603980
3105	NC_000963	ATC	2	6	115047	115052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15603980
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3107	NC_000963	TAT	2	6	115101	115106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15603980
3108	NC_000963	GCA	2	6	115112	115117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15603980
3109	NC_000963	TA	3	6	115208	115213	50 %	50 %	0 %	0 %	15603980
3110	NC_000963	CTA	2	6	115224	115229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15603980
3111	NC_000963	TTTTA	2	10	115346	115355	20 %	80 %	0 %	0 %	15603980
3112	NC_000963	T	6	6	115472	115477	0 %	100 %	0 %	0 %	15603980
3113	NC_000963	ATA	2	6	115662	115667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15603980
3114	NC_000963	A	8	8	115707	115714	100 %	0 %	0 %	0 %	15603980
3115	NC_000963	GAT	2	6	115835	115840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15603980
3116	NC_000963	TA	3	6	115923	115928	50 %	50 %	0 %	0 %	15603980
3117	NC_000963	AT	3	6	115944	115949	50 %	50 %	0 %	0 %	15603980
3118	NC_000963	A	6	6	115962	115967	100 %	0 %	0 %	0 %	15603980
3119	NC_000963	TGA	2	6	115981	115986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15603980
3120	NC_000963	AGA	2	6	116092	116097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15603980
3121	NC_000963	TGC	2	6	116098	116103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15603980
3122	NC_000963	AGT	2	6	116108	116113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15603980
3123	NC_000963	CAA	2	6	116132	116137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15603980
3124	NC_000963	CA	3	6	116143	116148	50 %	0 %	0 %	50 %	15603980
3125	NC_000963	T	7	7	116151	116157	0 %	100 %	0 %	0 %	15603980
3126	NC_000963	AT	3	6	116215	116220	50 %	50 %	0 %	0 %	15603980
3127	NC_000963	TTAA	2	8	116222	116229	50 %	50 %	0 %	0 %	15603980
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3129	NC_000963	T	6	6	116254	116259	0 %	100 %	0 %	0 %	15603980
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3332	NC_000963	TGA	2	6	123799	123804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15603983
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3361	NC_000963	A	7	7	124815	124821	100 %	0 %	0 %	0 %	15603983
3362	NC_000963	GAA	2	6	124842	124847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15603983
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3366	NC_000963	CA	3	6	124920	124925	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3367	NC_000963	GTAA	2	8	124939	124946	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3369	NC_000963	A	7	7	124973	124979	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3374	NC_000963	AAAT	2	8	125253	125260	75 %	25 %	0 %	0 %	15603984
3375	NC_000963	TAC	2	6	125278	125283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15603984
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