MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia prowazekii str. Madrid E chromosome

Total Repeats: 30188

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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28002	NC_000963	ACA	2	6	1031634	1031639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28003	NC_000963	CTTAC	2	10	1031667	1031676	20 %	40 %	0 %	40 %	15604653
28004	NC_000963	CTC	2	6	1031733	1031738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15604653
28005	NC_000963	TA	3	6	1031759	1031764	50 %	50 %	0 %	0 %	15604653
28006	NC_000963	T	7	7	1031770	1031776	0 %	100 %	0 %	0 %	15604653
28007	NC_000963	TCA	2	6	1031809	1031814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604653
28008	NC_000963	ATA	3	9	1031903	1031911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604653
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28010	NC_000963	TTTA	2	8	1032087	1032094	25 %	75 %	0 %	0 %	15604653
28011	NC_000963	GATAA	2	10	1032191	1032200	60 %	20 %	20 %	0 %	15604653
28012	NC_000963	ATTAT	2	10	1032256	1032265	40 %	60 %	0 %	0 %	15604653
28013	NC_000963	AT	3	6	1032395	1032400	50 %	50 %	0 %	0 %	15604653
28014	NC_000963	T	7	7	1032404	1032410	0 %	100 %	0 %	0 %	15604653
28015	NC_000963	TAA	2	6	1032417	1032422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604653
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28017	NC_000963	TAT	2	6	1032590	1032595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604653
28018	NC_000963	GTAT	2	8	1032631	1032638	25 %	50 %	25 %	0 %	15604653
28019	NC_000963	T	6	6	1032692	1032697	0 %	100 %	0 %	0 %	15604653
28020	NC_000963	CTA	2	6	1032710	1032715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604653
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28027	NC_000963	AT	3	6	1032965	1032970	50 %	50 %	0 %	0 %	15604653
28028	NC_000963	TAT	3	9	1032968	1032976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604653
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28030	NC_000963	TTC	2	6	1033023	1033028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604653
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28037	NC_000963	A	6	6	1033298	1033303	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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28039	NC_000963	A	8	8	1033370	1033377	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28040	NC_000963	TA	3	6	1033392	1033397	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28041	NC_000963	TAT	2	6	1033406	1033411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28042	NC_000963	T	6	6	1033411	1033416	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28043	NC_000963	A	6	6	1033419	1033424	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28044	NC_000963	TA	3	6	1033466	1033471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28045	NC_000963	TA	3	6	1033475	1033480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28046	NC_000963	ATA	2	6	1033484	1033489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28047	NC_000963	TA	3	6	1033530	1033535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28048	NC_000963	ATA	2	6	1033545	1033550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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28052	NC_000963	CAA	2	6	1033649	1033654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28053	NC_000963	GCA	2	6	1033669	1033674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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28055	NC_000963	CTT	2	6	1033727	1033732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28056	NC_000963	AAT	2	6	1033762	1033767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28057	NC_000963	TA	3	6	1033795	1033800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28058	NC_000963	TAT	2	6	1033812	1033817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28059	NC_000963	ACA	2	6	1033821	1033826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28060	NC_000963	TTA	2	6	1033828	1033833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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28063	NC_000963	ATT	2	6	1033950	1033955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28064	NC_000963	CTAC	2	8	1033977	1033984	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
28065	NC_000963	TA	3	6	1034013	1034018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28066	NC_000963	A	8	8	1034026	1034033	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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28071	NC_000963	TA	3	6	1034128	1034133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28072	NC_000963	ATT	2	6	1034151	1034156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28073	NC_000963	TAA	2	6	1034218	1034223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28074	NC_000963	TA	3	6	1034236	1034241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28075	NC_000963	CT	3	6	1034286	1034291	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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28079	NC_000963	TAGA	2	8	1034409	1034416	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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28093	NC_000963	TAT	2	6	1034701	1034706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28094	NC_000963	TAC	2	6	1034717	1034722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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28101	NC_000963	AAATTT	2	12	1035047	1035058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28102	NC_000963	AGT	2	6	1035117	1035122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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28108	NC_000963	TATTGT	2	12	1035239	1035250	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28109	NC_000963	ATA	2	6	1035258	1035263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28110	NC_000963	TACTG	2	10	1035291	1035300	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
28111	NC_000963	TAT	2	6	1035326	1035331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28112	NC_000963	AAT	2	6	1035351	1035356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28113	NC_000963	TTA	2	6	1035378	1035383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28114	NC_000963	TAT	2	6	1035405	1035410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28115	NC_000963	TAA	2	6	1035414	1035419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28116	NC_000963	A	6	6	1035452	1035457	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28117	NC_000963	TAAA	2	8	1035526	1035533	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28118	NC_000963	AAAT	2	8	1035590	1035597	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28119	NC_000963	ATA	2	6	1035615	1035620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28120	NC_000963	TTA	2	6	1035621	1035626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28121	NC_000963	AAT	2	6	1035652	1035657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28122	NC_000963	AT	3	6	1035674	1035679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28123	NC_000963	TAAT	2	8	1035711	1035718	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28124	NC_000963	ACATA	2	10	1035880	1035889	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
28125	NC_000963	T	6	6	1036035	1036040	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28126	NC_000963	TTA	2	6	1036056	1036061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28127	NC_000963	ATT	2	6	1036104	1036109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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28129	NC_000963	AATTA	2	10	1036170	1036179	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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28498	NC_000963	TAAT	2	8	1049227	1049234	50 %	50 %	0 %	0 %	15604666
28499	NC_000963	A	6	6	1049261	1049266	100 %	0 %	0 %	0 %	15604666
28500	NC_000963	TTGCA	2	10	1049267	1049276	20 %	40 %	20 %	20 %	15604666

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