MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia prowazekii str. Madrid E chromosome

Total Repeats: 30188

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25004	NC_000963	ATCG	2	8	918121	918128	25 %	25 %	25 %	25 %	15604569
25005	NC_000963	TAA	2	6	918143	918148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604569
25006	NC_000963	TGC	2	6	918192	918197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604569
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25009	NC_000963	GAA	2	6	918457	918462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604569
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25011	NC_000963	TGA	2	6	918513	918518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604569
25012	NC_000963	A	6	6	918599	918604	100 %	0 %	0 %	0 %	15604569
25013	NC_000963	A	6	6	918613	918618	100 %	0 %	0 %	0 %	15604569
25014	NC_000963	ATAA	2	8	918625	918632	75 %	25 %	0 %	0 %	15604569
25015	NC_000963	TAA	2	6	918654	918659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604569
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25017	NC_000963	TA	3	6	918687	918692	50 %	50 %	0 %	0 %	15604569
25018	NC_000963	TTTA	2	8	918708	918715	25 %	75 %	0 %	0 %	15604569
25019	NC_000963	T	6	6	918751	918756	0 %	100 %	0 %	0 %	15604569
25020	NC_000963	A	7	7	918804	918810	100 %	0 %	0 %	0 %	15604569
25021	NC_000963	ATT	2	6	918819	918824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604569
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25027	NC_000963	T	7	7	918929	918935	0 %	100 %	0 %	0 %	15604569
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25029	NC_000963	AGA	2	6	918957	918962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604569
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25036	NC_000963	ACT	2	6	919123	919128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604569
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25040	NC_000963	ATTT	2	8	919385	919392	25 %	75 %	0 %	0 %	15604569
25041	NC_000963	ATC	2	6	919413	919418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604569
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25053	NC_000963	AT	4	8	919913	919920	50 %	50 %	0 %	0 %	15604569
25054	NC_000963	T	7	7	919971	919977	0 %	100 %	0 %	0 %	15604569
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25063	NC_000963	ATACC	2	10	920438	920447	40 %	20 %	0 %	40 %	15604569
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25073	NC_000963	TAA	2	6	920727	920732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25074	NC_000963	CAGT	2	8	920846	920853	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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25091	NC_000963	ATT	2	6	921236	921241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25092	NC_000963	TA	3	6	921258	921263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25093	NC_000963	AT	3	6	921283	921288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25094	NC_000963	T	6	6	921309	921314	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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25096	NC_000963	TAG	3	9	921411	921419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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25098	NC_000963	A	6	6	921488	921493	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25099	NC_000963	TAA	2	6	921523	921528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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25110	NC_000963	A	8	8	922008	922015	100 %	0 %	0 %	0 %	15604570
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25113	NC_000963	A	6	6	922184	922189	100 %	0 %	0 %	0 %	15604570
25114	NC_000963	TAAT	2	8	922214	922221	50 %	50 %	0 %	0 %	15604570
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25123	NC_000963	T	6	6	922612	922617	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25124	NC_000963	AAT	2	6	922624	922629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25125	NC_000963	CAAG	2	8	922648	922655	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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