MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia prowazekii str. Madrid E chromosome

Total Repeats: 30188

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_000963	TA	4	8	551356	551363	50 %	50 %	0 %	0 %	15604314
15002	NC_000963	TTA	2	6	551364	551369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604314
15003	NC_000963	ATAA	2	8	551380	551387	75 %	25 %	0 %	0 %	15604314
15004	NC_000963	CAT	2	6	551389	551394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604314
15005	NC_000963	TAA	2	6	551420	551425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604314
15006	NC_000963	CCG	2	6	551481	551486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15604314
15007	NC_000963	AAG	2	6	551488	551493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604314
15008	NC_000963	TAT	2	6	551561	551566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604314
15009	NC_000963	TAG	2	6	551592	551597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604314
15010	NC_000963	TTC	2	6	551606	551611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604314
15011	NC_000963	CTT	2	6	551635	551640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604314
15012	NC_000963	TA	3	6	551655	551660	50 %	50 %	0 %	0 %	15604314
15013	NC_000963	TAA	2	6	551673	551678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604314
15014	NC_000963	GCT	2	6	551682	551687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604314
15015	NC_000963	TAAA	2	8	551717	551724	75 %	25 %	0 %	0 %	15604314
15016	NC_000963	AAT	2	6	551742	551747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604314
15017	NC_000963	CTA	2	6	551784	551789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604314
15018	NC_000963	TTTTAA	2	12	551825	551836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604314
15019	NC_000963	ATT	2	6	551840	551845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604314
15020	NC_000963	T	6	6	551875	551880	0 %	100 %	0 %	0 %	15604314
15021	NC_000963	A	8	8	551897	551904	100 %	0 %	0 %	0 %	15604314
15022	NC_000963	TA	3	6	551960	551965	50 %	50 %	0 %	0 %	15604314
15023	NC_000963	TAT	2	6	551977	551982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604314
15024	NC_000963	GAG	2	6	552001	552006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15604314
15025	NC_000963	GTA	2	6	552010	552015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604314
15026	NC_000963	TAAT	2	8	552031	552038	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15027	NC_000963	TATAT	2	10	552066	552075	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15028	NC_000963	TA	3	6	552096	552101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15029	NC_000963	TGA	2	6	552123	552128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604315
15030	NC_000963	A	6	6	552131	552136	100 %	0 %	0 %	0 %	15604315
15031	NC_000963	GA	3	6	552157	552162	50 %	0 %	50 %	0 %	15604315
15032	NC_000963	TTG	2	6	552198	552203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604315
15033	NC_000963	A	6	6	552209	552214	100 %	0 %	0 %	0 %	15604315
15034	NC_000963	CT	3	6	552227	552232	0 %	50 %	0 %	50 %	15604315
15035	NC_000963	TAC	2	6	552235	552240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604315
15036	NC_000963	GAA	2	6	552248	552253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604315
15037	NC_000963	AAT	2	6	552254	552259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604315
15038	NC_000963	AT	3	6	552265	552270	50 %	50 %	0 %	0 %	15604315
15039	NC_000963	A	6	6	552287	552292	100 %	0 %	0 %	0 %	15604315
15040	NC_000963	GAA	2	6	552437	552442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604315
15041	NC_000963	ATT	2	6	552464	552469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604315
15042	NC_000963	GAA	2	6	552476	552481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604315
15043	NC_000963	ATA	2	6	552495	552500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604315
15044	NC_000963	AATG	2	8	552547	552554	50 %	25 %	25 %	0 %	15604315
15045	NC_000963	ATT	2	6	552575	552580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604315
15046	NC_000963	AT	3	6	552633	552638	50 %	50 %	0 %	0 %	15604315
15047	NC_000963	AAACA	2	10	552666	552675	80 %	0 %	0 %	20 %	15604315
15048	NC_000963	TTA	2	6	552680	552685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604315
15049	NC_000963	GAA	2	6	552686	552691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604315
15050	NC_000963	ACT	2	6	552713	552718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604315
15051	NC_000963	TTA	2	6	552720	552725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604315
15052	NC_000963	GCAT	2	8	552763	552770	25 %	25 %	25 %	25 %	15604315
15053	NC_000963	CAA	2	6	552773	552778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15604315
15054	NC_000963	A	6	6	552798	552803	100 %	0 %	0 %	0 %	15604315
15055	NC_000963	ATT	3	9	552813	552821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604315
15056	NC_000963	TGA	2	6	552856	552861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604315
15057	NC_000963	A	7	7	552890	552896	100 %	0 %	0 %	0 %	15604315
15058	NC_000963	AAG	2	6	552918	552923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604315
15059	NC_000963	CTGAAT	2	12	552936	552947	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15604315
15060	NC_000963	ATA	2	6	553044	553049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604315
15061	NC_000963	A	6	6	553074	553079	100 %	0 %	0 %	0 %	15604315
15062	NC_000963	TAT	2	6	553123	553128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604315
15063	NC_000963	TAT	2	6	553176	553181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604315
15064	NC_000963	CCA	2	6	553193	553198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15604315
15065	NC_000963	GAA	2	6	553245	553250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604315
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15067	NC_000963	TGC	2	6	553383	553388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604315
15068	NC_000963	TGA	2	6	553390	553395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604315
15069	NC_000963	CTTG	2	8	553441	553448	0 %	50 %	25 %	25 %	15604315
15070	NC_000963	TGT	2	6	553519	553524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604315
15071	NC_000963	AT	4	8	553586	553593	50 %	50 %	0 %	0 %	15604315
15072	NC_000963	GAA	2	6	553610	553615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604315
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15074	NC_000963	ATAG	2	8	553832	553839	50 %	25 %	25 %	0 %	15604315
15075	NC_000963	TAA	2	6	553840	553845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604315
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15079	NC_000963	GTA	2	6	553911	553916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604315
15080	NC_000963	AGG	2	6	553942	553947	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15604315
15081	NC_000963	ACT	2	6	554000	554005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604315
15082	NC_000963	GCT	2	6	554042	554047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604315
15083	NC_000963	GTT	2	6	554052	554057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604315
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15085	NC_000963	CTG	2	6	554160	554165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604315
15086	NC_000963	TAC	2	6	554179	554184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604315
15087	NC_000963	GCA	2	6	554297	554302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15604315
15088	NC_000963	G	6	6	554309	554314	0 %	0 %	100 %	0 %	15604315
15089	NC_000963	ACC	2	6	554365	554370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15604315
15090	NC_000963	AATA	2	8	554449	554456	75 %	25 %	0 %	0 %	15604315
15091	NC_000963	TTA	2	6	554485	554490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15092	NC_000963	GCAAAA	2	12	554497	554508	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15093	NC_000963	GTT	2	6	554534	554539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15094	NC_000963	ATG	2	6	554593	554598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15095	NC_000963	AT	3	6	554600	554605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15096	NC_000963	ATA	2	6	554667	554672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15097	NC_000963	TATC	2	8	554698	554705	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15098	NC_000963	TTA	2	6	554712	554717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15099	NC_000963	T	6	6	554752	554757	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15100	NC_000963	A	6	6	554785	554790	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15101	NC_000963	T	6	6	554805	554810	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15102	NC_000963	TTAA	3	12	554860	554871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15103	NC_000963	A	6	6	554897	554902	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15104	NC_000963	ATT	2	6	554913	554918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15105	NC_000963	AAT	2	6	554926	554931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15106	NC_000963	CATTAA	2	12	554936	554947	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15107	NC_000963	TTA	2	6	554950	554955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15108	NC_000963	AT	3	6	554963	554968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15109	NC_000963	T	7	7	554974	554980	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15110	NC_000963	TTAA	2	8	554984	554991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15111	NC_000963	TAT	2	6	554994	554999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15112	NC_000963	ATTAAT	2	12	555001	555012	50 %	50 %	0 %	0 %	15604316
15113	NC_000963	A	6	6	555014	555019	100 %	0 %	0 %	0 %	15604316
15114	NC_000963	ATT	2	6	555067	555072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604316
15115	NC_000963	ATT	2	6	555098	555103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604316
15116	NC_000963	TAA	2	6	555106	555111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604316
15117	NC_000963	AGG	2	6	555148	555153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15604316
15118	NC_000963	GGA	2	6	555239	555244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15604316
15119	NC_000963	TGG	2	6	555274	555279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15604316
15120	NC_000963	AAGT	2	8	555285	555292	50 %	25 %	25 %	0 %	15604316
15121	NC_000963	TAA	2	6	555367	555372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604316
15122	NC_000963	ATT	2	6	555383	555388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604316
15123	NC_000963	TAA	2	6	555454	555459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604316
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15125	NC_000963	AAT	2	6	555503	555508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604316
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