MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia prowazekii str. Madrid E chromosome

Total Repeats: 30188

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_000963	GTA	2	6	514815	514820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604283
14002	NC_000963	ATT	2	6	514853	514858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604283
14003	NC_000963	ATT	2	6	514877	514882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604283
14004	NC_000963	AGTA	2	8	514952	514959	50 %	25 %	25 %	0 %	15604283
14005	NC_000963	T	7	7	514991	514997	0 %	100 %	0 %	0 %	15604283
14006	NC_000963	GTG	2	6	515059	515064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15604283
14007	NC_000963	TAA	3	9	515069	515077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604283
14008	NC_000963	ATC	2	6	515209	515214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604283
14009	NC_000963	CAAT	2	8	515224	515231	50 %	25 %	0 %	25 %	15604283
14010	NC_000963	TTA	2	6	515250	515255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604283
14011	NC_000963	TTG	2	6	515428	515433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604283
14012	NC_000963	ATA	2	6	515457	515462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604283
14013	NC_000963	AT	3	6	515465	515470	50 %	50 %	0 %	0 %	15604283
14014	NC_000963	A	6	6	515547	515552	100 %	0 %	0 %	0 %	15604283
14015	NC_000963	TAAAA	2	10	515564	515573	80 %	20 %	0 %	0 %	15604283
14016	NC_000963	GAT	2	6	515583	515588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604283
14017	NC_000963	GTAAT	2	10	515756	515765	40 %	40 %	20 %	0 %	15604284
14018	NC_000963	CTA	2	6	515822	515827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604284
14019	NC_000963	A	6	6	515849	515854	100 %	0 %	0 %	0 %	15604284
14020	NC_000963	ATTTA	2	10	515997	516006	40 %	60 %	0 %	0 %	15604284
14021	NC_000963	TTTAC	2	10	516007	516016	20 %	60 %	0 %	20 %	15604284
14022	NC_000963	AAT	2	6	516093	516098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604284
14023	NC_000963	CAA	2	6	516104	516109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15604284
14024	NC_000963	TATT	2	8	516153	516160	25 %	75 %	0 %	0 %	15604284
14025	NC_000963	T	6	6	516181	516186	0 %	100 %	0 %	0 %	15604284
14026	NC_000963	AGA	2	6	516234	516239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604284
14027	NC_000963	A	6	6	516239	516244	100 %	0 %	0 %	0 %	15604284
14028	NC_000963	A	6	6	516272	516277	100 %	0 %	0 %	0 %	15604284
14029	NC_000963	AGA	2	6	516282	516287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604284
14030	NC_000963	AGT	2	6	516346	516351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604284
14031	NC_000963	AAATT	2	10	516356	516365	60 %	40 %	0 %	0 %	15604284
14032	NC_000963	TGT	2	6	516389	516394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604284
14033	NC_000963	AGC	2	6	516445	516450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15604284
14034	NC_000963	AAT	2	6	516507	516512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604284
14035	NC_000963	ATTATC	2	12	516540	516551	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15604284
14036	NC_000963	ATT	2	6	516607	516612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604284
14037	NC_000963	AAAG	2	8	516628	516635	75 %	0 %	25 %	0 %	15604284
14038	NC_000963	ATG	2	6	516653	516658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604284
14039	NC_000963	AGA	2	6	516693	516698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604284
14040	NC_000963	TAG	2	6	516725	516730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604284
14041	NC_000963	TTCAGC	2	12	516750	516761	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15604284
14042	NC_000963	TTA	2	6	516770	516775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604284
14043	NC_000963	AT	3	6	516846	516851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14044	NC_000963	TAA	2	6	516927	516932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14045	NC_000963	A	6	6	516976	516981	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14046	NC_000963	T	7	7	516982	516988	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14047	NC_000963	AAT	2	6	517024	517029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14048	NC_000963	T	6	6	517093	517098	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14049	NC_000963	TA	3	6	517100	517105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14050	NC_000963	AAT	2	6	517128	517133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14051	NC_000963	TTAA	2	8	517179	517186	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14052	NC_000963	A	7	7	517197	517203	100 %	0 %	0 %	0 %	15604285
14053	NC_000963	ATT	2	6	517211	517216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604285
14054	NC_000963	T	6	6	517215	517220	0 %	100 %	0 %	0 %	15604285
14055	NC_000963	TAA	2	6	517237	517242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604285
14056	NC_000963	AGAACA	2	12	517277	517288	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	15604285
14057	NC_000963	A	6	6	517352	517357	100 %	0 %	0 %	0 %	15604285
14058	NC_000963	CTA	2	6	517363	517368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604285
14059	NC_000963	TAA	2	6	517388	517393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604285
14060	NC_000963	AGC	2	6	517406	517411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15604285
14061	NC_000963	CGG	2	6	517457	517462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15604285
14062	NC_000963	GAT	2	6	517536	517541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604285
14063	NC_000963	TAA	2	6	517543	517548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604285
14064	NC_000963	GAA	2	6	517578	517583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604285
14065	NC_000963	ACAA	2	8	517594	517601	75 %	0 %	0 %	25 %	15604285
14066	NC_000963	AT	5	10	517672	517681	50 %	50 %	0 %	0 %	15604285
14067	NC_000963	T	6	6	517698	517703	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14068	NC_000963	A	8	8	517775	517782	100 %	0 %	0 %	0 %	15604286
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14071	NC_000963	GTGAT	2	10	517919	517928	20 %	40 %	40 %	0 %	15604286
14072	NC_000963	TGC	2	6	518007	518012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604286
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14082	NC_000963	GCA	2	6	518383	518388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15604286
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14088	NC_000963	AAG	2	6	518613	518618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604286
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14091	NC_000963	AT	3	6	518690	518695	50 %	50 %	0 %	0 %	15604286
14092	NC_000963	TTA	3	9	518705	518713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604286
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14094	NC_000963	TAG	2	6	518886	518891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604286
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14096	NC_000963	TCCTAT	2	12	519003	519014	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15604286
14097	NC_000963	GTA	2	6	519037	519042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604286
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14099	NC_000963	CAT	2	6	519118	519123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604286
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14102	NC_000963	A	6	6	519259	519264	100 %	0 %	0 %	0 %	15604286
14103	NC_000963	TA	3	6	519295	519300	50 %	50 %	0 %	0 %	15604286
14104	NC_000963	TAT	2	6	519329	519334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604286
14105	NC_000963	T	7	7	519342	519348	0 %	100 %	0 %	0 %	15604286
14106	NC_000963	GAAC	2	8	519360	519367	50 %	0 %	25 %	25 %	15604286
14107	NC_000963	TGC	2	6	519422	519427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604286
14108	NC_000963	AAT	3	9	519448	519456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604286
14109	NC_000963	AGT	2	6	519474	519479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604286
14110	NC_000963	A	6	6	519480	519485	100 %	0 %	0 %	0 %	15604286
14111	NC_000963	T	6	6	519496	519501	0 %	100 %	0 %	0 %	15604286
14112	NC_000963	A	8	8	519559	519566	100 %	0 %	0 %	0 %	15604286
14113	NC_000963	TAT	2	6	519626	519631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604286
14114	NC_000963	TAA	2	6	519699	519704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604286
14115	NC_000963	TCTTT	2	10	519728	519737	0 %	80 %	0 %	20 %	15604286
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14118	NC_000963	GAT	2	6	519811	519816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604286
14119	NC_000963	TA	3	6	519873	519878	50 %	50 %	0 %	0 %	15604286
14120	NC_000963	AGA	2	6	519975	519980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604286
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14122	NC_000963	TGA	2	6	520038	520043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604286
14123	NC_000963	AT	3	6	520065	520070	50 %	50 %	0 %	0 %	15604286
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14125	NC_000963	ATT	2	6	520207	520212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604286
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