MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia prowazekii str. Madrid E chromosome

Total Repeats: 30188

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_000963	GCA	2	6	480226	480231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15604256
13002	NC_000963	AGA	2	6	480289	480294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604256
13003	NC_000963	AAC	2	6	480324	480329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15604256
13004	NC_000963	CAA	2	6	480505	480510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13005	NC_000963	AT	3	6	480519	480524	50 %	50 %	0 %	0 %	15604257
13006	NC_000963	ATTT	2	8	480544	480551	25 %	75 %	0 %	0 %	15604257
13007	NC_000963	T	6	6	480549	480554	0 %	100 %	0 %	0 %	15604257
13008	NC_000963	AAAT	2	8	480577	480584	75 %	25 %	0 %	0 %	15604257
13009	NC_000963	ACT	2	6	480654	480659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604257
13010	NC_000963	GAAAAA	2	12	480677	480688	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	15604257
13011	NC_000963	TCT	2	6	480723	480728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604257
13012	NC_000963	CT	3	6	480744	480749	0 %	50 %	0 %	50 %	15604257
13013	NC_000963	ATT	2	6	480798	480803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604257
13014	NC_000963	ATATA	2	10	480815	480824	60 %	40 %	0 %	0 %	15604257
13015	NC_000963	TA	3	6	480839	480844	50 %	50 %	0 %	0 %	15604257
13016	NC_000963	TAA	2	6	480868	480873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604257
13017	NC_000963	GAA	2	6	480897	480902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604257
13018	NC_000963	ATA	2	6	480903	480908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604257
13019	NC_000963	TATAA	2	10	480932	480941	60 %	40 %	0 %	0 %	15604257
13020	NC_000963	ATA	2	6	480957	480962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604257
13021	NC_000963	TAA	2	6	480967	480972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604257
13022	NC_000963	ACC	2	6	480998	481003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15604257
13023	NC_000963	A	8	8	481009	481016	100 %	0 %	0 %	0 %	15604257
13024	NC_000963	A	6	6	481022	481027	100 %	0 %	0 %	0 %	15604257
13025	NC_000963	ATT	2	6	481076	481081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13026	NC_000963	AATT	2	8	481097	481104	50 %	50 %	0 %	0 %	15604258
13027	NC_000963	TTTG	2	8	481112	481119	0 %	75 %	25 %	0 %	15604258
13028	NC_000963	TTA	2	6	481173	481178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604258
13029	NC_000963	TAG	2	6	481185	481190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604258
13030	NC_000963	GTA	2	6	481248	481253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604258
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13032	NC_000963	GCA	2	6	481349	481354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15604258
13033	NC_000963	TGC	2	6	481357	481362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604258
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13035	NC_000963	AT	3	6	481409	481414	50 %	50 %	0 %	0 %	15604258
13036	NC_000963	TTAA	2	8	481430	481437	50 %	50 %	0 %	0 %	15604258
13037	NC_000963	AT	3	6	481444	481449	50 %	50 %	0 %	0 %	15604258
13038	NC_000963	AAG	2	6	481463	481468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604258
13039	NC_000963	TAT	2	6	481483	481488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604258
13040	NC_000963	TGA	2	6	481528	481533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604258
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13042	NC_000963	TAG	2	6	481578	481583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604258
13043	NC_000963	A	7	7	481592	481598	100 %	0 %	0 %	0 %	15604258
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13050	NC_000963	ACT	2	6	481814	481819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604258
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13053	NC_000963	TTTGT	2	10	481863	481872	0 %	80 %	20 %	0 %	15604258
13054	NC_000963	TAA	2	6	481894	481899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604258
13055	NC_000963	ACT	2	6	481925	481930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604258
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13062	NC_000963	AT	3	6	482219	482224	50 %	50 %	0 %	0 %	15604259
13063	NC_000963	GTTT	2	8	482229	482236	0 %	75 %	25 %	0 %	15604259
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13069	NC_000963	TTA	2	6	482403	482408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13070	NC_000963	GTA	2	6	482418	482423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13071	NC_000963	TGT	2	6	482450	482455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13072	NC_000963	TAA	2	6	482464	482469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13073	NC_000963	T	6	6	482476	482481	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13074	NC_000963	TCTATT	2	12	482502	482513	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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13076	NC_000963	TTA	2	6	482579	482584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13078	NC_000963	GATA	2	8	482622	482629	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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13094	NC_000963	CAT	2	6	483170	483175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604260
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13108	NC_000963	ATT	2	6	483660	483665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604260
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13110	NC_000963	CAAT	2	8	483724	483731	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13111	NC_000963	TAA	2	6	483736	483741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13112	NC_000963	AAT	2	6	483757	483762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13113	NC_000963	TAA	2	6	483768	483773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13114	NC_000963	AAT	2	6	483775	483780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13115	NC_000963	ATTTAG	2	12	483789	483800	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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13117	NC_000963	T	6	6	483846	483851	0 %	100 %	0 %	0 %	15604261
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