MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia prowazekii str. Madrid E chromosome

Total Repeats: 30188

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_000963	ATT	2	6	462995	463000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12502	NC_000963	TGA	2	6	463013	463018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12503	NC_000963	AT	3	6	463047	463052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12504	NC_000963	ATTTG	2	10	463069	463078	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
12505	NC_000963	A	6	6	463099	463104	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12506	NC_000963	TCA	2	6	463105	463110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12507	NC_000963	T	6	6	463170	463175	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12508	NC_000963	TAT	2	6	463230	463235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12509	NC_000963	TAA	2	6	463237	463242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12510	NC_000963	A	6	6	463241	463246	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12511	NC_000963	TAA	2	6	463247	463252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12512	NC_000963	GTA	2	6	463258	463263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12513	NC_000963	CAA	2	6	463275	463280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12514	NC_000963	AT	3	6	463286	463291	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12515	NC_000963	ATT	2	6	463295	463300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604244
12516	NC_000963	TAT	2	6	463316	463321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604244
12517	NC_000963	ATA	2	6	463355	463360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604244
12518	NC_000963	ATA	2	6	463369	463374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604244
12519	NC_000963	TGAAT	2	10	463439	463448	40 %	40 %	20 %	0 %	15604244
12520	NC_000963	CTG	2	6	463493	463498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604244
12521	NC_000963	TAG	2	6	463550	463555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604244
12522	NC_000963	CCA	2	6	463603	463608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15604244
12523	NC_000963	GTT	2	6	463670	463675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604244
12524	NC_000963	TGAA	2	8	463685	463692	50 %	25 %	25 %	0 %	15604244
12525	NC_000963	A	7	7	463691	463697	100 %	0 %	0 %	0 %	15604244
12526	NC_000963	CAT	2	6	463716	463721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604244
12527	NC_000963	C	6	6	463739	463744	0 %	0 %	0 %	100 %	15604244
12528	NC_000963	ACT	2	6	463770	463775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604244
12529	NC_000963	ACTA	2	8	463788	463795	50 %	25 %	0 %	25 %	15604244
12530	NC_000963	TGATA	2	10	463831	463840	40 %	40 %	20 %	0 %	15604244
12531	NC_000963	GTT	2	6	463865	463870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604244
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12533	NC_000963	AT	3	6	464000	464005	50 %	50 %	0 %	0 %	15604244
12534	NC_000963	TGA	2	6	464111	464116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604244
12535	NC_000963	TAA	2	6	464166	464171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604244
12536	NC_000963	A	6	6	464170	464175	100 %	0 %	0 %	0 %	15604244
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12538	NC_000963	A	6	6	464244	464249	100 %	0 %	0 %	0 %	15604244
12539	NC_000963	CTT	2	6	464267	464272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604244
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12541	NC_000963	ATA	2	6	464354	464359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604244
12542	NC_000963	ATT	2	6	464380	464385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604244
12543	NC_000963	AT	3	6	464416	464421	50 %	50 %	0 %	0 %	15604244
12544	NC_000963	ATTA	2	8	464424	464431	50 %	50 %	0 %	0 %	15604244
12545	NC_000963	A	6	6	464448	464453	100 %	0 %	0 %	0 %	15604244
12546	NC_000963	AATAA	2	10	464467	464476	80 %	20 %	0 %	0 %	15604244
12547	NC_000963	ATA	2	6	464542	464547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604244
12548	NC_000963	TAAT	2	8	464633	464640	50 %	50 %	0 %	0 %	15604244
12549	NC_000963	AAC	2	6	464643	464648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15604244
12550	NC_000963	TAC	2	6	464663	464668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604244
12551	NC_000963	TAAAA	2	10	464688	464697	80 %	20 %	0 %	0 %	15604244
12552	NC_000963	A	6	6	464694	464699	100 %	0 %	0 %	0 %	15604244
12553	NC_000963	TAA	2	6	464703	464708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604244
12554	NC_000963	CTA	2	6	464810	464815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604244
12555	NC_000963	AGT	2	6	464853	464858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12556	NC_000963	TTA	2	6	464950	464955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12557	NC_000963	ATA	2	6	465006	465011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12558	NC_000963	T	6	6	465033	465038	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12559	NC_000963	ATT	2	6	465052	465057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604245
12560	NC_000963	GTT	2	6	465058	465063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604245
12561	NC_000963	TAT	2	6	465073	465078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604245
12562	NC_000963	TTG	2	6	465085	465090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604245
12563	NC_000963	TAA	2	6	465094	465099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604245
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12565	NC_000963	ATT	2	6	465192	465197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604245
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12571	NC_000963	T	6	6	465382	465387	0 %	100 %	0 %	0 %	15604245
12572	NC_000963	TA	3	6	465469	465474	50 %	50 %	0 %	0 %	15604245
12573	NC_000963	TTG	2	6	465544	465549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604245
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12575	NC_000963	T	6	6	465571	465576	0 %	100 %	0 %	0 %	15604245
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12583	NC_000963	ATA	2	6	465838	465843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604245
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12588	NC_000963	A	7	7	466025	466031	100 %	0 %	0 %	0 %	15604245
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12590	NC_000963	T	7	7	466089	466095	0 %	100 %	0 %	0 %	15604245
12591	NC_000963	AC	3	6	466187	466192	50 %	0 %	0 %	50 %	15604245
12592	NC_000963	AT	3	6	466195	466200	50 %	50 %	0 %	0 %	15604245
12593	NC_000963	GTTTT	2	10	466249	466258	0 %	80 %	20 %	0 %	15604245
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12597	NC_000963	TTA	2	6	466329	466334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604245
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12599	NC_000963	ACC	2	6	466388	466393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15604245
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12602	NC_000963	TA	3	6	466530	466535	50 %	50 %	0 %	0 %	15604245
12603	NC_000963	CAT	2	6	466621	466626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604245
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12605	NC_000963	GCA	2	6	466749	466754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15604245
12606	NC_000963	TGA	2	6	466772	466777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604245
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12608	NC_000963	ATT	2	6	466812	466817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604245
12609	NC_000963	T	7	7	466840	466846	0 %	100 %	0 %	0 %	15604246
12610	NC_000963	T	7	7	466862	466868	0 %	100 %	0 %	0 %	15604246
12611	NC_000963	TCT	2	6	466872	466877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604246
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12614	NC_000963	GTTT	2	8	466983	466990	0 %	75 %	25 %	0 %	15604246
12615	NC_000963	AT	3	6	467030	467035	50 %	50 %	0 %	0 %	15604246
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12621	NC_000963	TAC	2	6	467165	467170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604246
12622	NC_000963	T	6	6	467196	467201	0 %	100 %	0 %	0 %	15604246
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12624	NC_000963	TA	3	6	467267	467272	50 %	50 %	0 %	0 %	15604246
12625	NC_000963	ATT	2	6	467285	467290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604246
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