MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia prowazekii str. Madrid E chromosome

Total Repeats: 30188

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11003	NC_000963	GTA	2	6	408795	408800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604200
11004	NC_000963	AAAG	2	8	408854	408861	75 %	0 %	25 %	0 %	15604200
11005	NC_000963	TAT	2	6	408949	408954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604200
11006	NC_000963	AGCA	2	8	408967	408974	50 %	0 %	25 %	25 %	15604200
11007	NC_000963	TAA	2	6	408984	408989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604200
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11009	NC_000963	AAT	2	6	409072	409077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604200
11010	NC_000963	TAA	2	6	409141	409146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604200
11011	NC_000963	AT	3	6	409175	409180	50 %	50 %	0 %	0 %	15604200
11012	NC_000963	GAAATT	2	12	409187	409198	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	15604200
11013	NC_000963	TAG	2	6	409218	409223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604200
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11015	NC_000963	TA	4	8	409343	409350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11016	NC_000963	GGT	2	6	409381	409386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15604201
11017	NC_000963	ATT	2	6	409435	409440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604201
11018	NC_000963	A	7	7	409478	409484	100 %	0 %	0 %	0 %	15604201
11019	NC_000963	AAG	2	6	409487	409492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604201
11020	NC_000963	TGA	2	6	409563	409568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604201
11021	NC_000963	TGC	2	6	409599	409604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604201
11022	NC_000963	TGC	2	6	409689	409694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604201
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11024	NC_000963	TAGCAA	2	12	409793	409804	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15604201
11025	NC_000963	TCA	2	6	409899	409904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604201
11026	NC_000963	T	6	6	409953	409958	0 %	100 %	0 %	0 %	15604201
11027	NC_000963	GTA	2	6	410090	410095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604201
11028	NC_000963	GA	3	6	410129	410134	50 %	0 %	50 %	0 %	15604201
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11030	NC_000963	GAT	2	6	410179	410184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604201
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11032	NC_000963	A	6	6	410257	410262	100 %	0 %	0 %	0 %	15604201
11033	NC_000963	GAT	2	6	410275	410280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604201
11034	NC_000963	ATA	2	6	410291	410296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604201
11035	NC_000963	TTTAAA	2	12	410304	410315	50 %	50 %	0 %	0 %	15604201
11036	NC_000963	TTA	3	9	410329	410337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604201
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11038	NC_000963	TTA	2	6	410409	410414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604202
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11044	NC_000963	TGTTT	2	10	410635	410644	0 %	80 %	20 %	0 %	15604202
11045	NC_000963	CGT	2	6	410687	410692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604202
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11051	NC_000963	AAAGC	2	10	410945	410954	60 %	0 %	20 %	20 %	15604202
11052	NC_000963	GAA	2	6	410981	410986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604202
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11057	NC_000963	A	7	7	411089	411095	100 %	0 %	0 %	0 %	15604202
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11065	NC_000963	TTA	2	6	411566	411571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604203
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11092	NC_000963	ATG	3	9	412614	412622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604203
11093	NC_000963	TAA	2	6	412632	412637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11094	NC_000963	AAAT	2	8	412663	412670	75 %	25 %	0 %	0 %	15604204
11095	NC_000963	A	7	7	412724	412730	100 %	0 %	0 %	0 %	15604204
11096	NC_000963	TATAT	2	10	412865	412874	40 %	60 %	0 %	0 %	15604204
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11099	NC_000963	TCATA	2	10	412934	412943	40 %	40 %	0 %	20 %	15604204
11100	NC_000963	TATC	2	8	413042	413049	25 %	50 %	0 %	25 %	15604204
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11103	NC_000963	ATA	2	6	413125	413130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604204
11104	NC_000963	TTTA	2	8	413138	413145	25 %	75 %	0 %	0 %	15604204
11105	NC_000963	TTC	2	6	413222	413227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604204
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11107	NC_000963	TAA	2	6	413353	413358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604204
11108	NC_000963	AT	3	6	413396	413401	50 %	50 %	0 %	0 %	15604204
11109	NC_000963	GCA	2	6	413406	413411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15604204
11110	NC_000963	ATA	2	6	413464	413469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604204
11111	NC_000963	TTGG	2	8	413509	413516	0 %	50 %	50 %	0 %	15604204
11112	NC_000963	ATG	3	9	413521	413529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604204
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11115	NC_000963	A	6	6	413831	413836	100 %	0 %	0 %	0 %	15604204
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11239	NC_000963	TAT	2	6	417879	417884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604208
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11242	NC_000963	CAG	3	9	418016	418024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15604208
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11244	NC_000963	TTA	2	6	418055	418060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11245	NC_000963	TTCA	2	8	418062	418069	25 %	50 %	0 %	25 %	15604209
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11500	NC_000963	TTA	3	9	427466	427474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604215

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