MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia prowazekii str. Madrid E chromosome

Total Repeats: 30188

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7002	NC_000963	TTA	2	6	261832	261837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604083
7003	NC_000963	AAT	2	6	261846	261851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604083
7004	NC_000963	TTA	2	6	261856	261861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604083
7005	NC_000963	GTTT	2	8	261915	261922	0 %	75 %	25 %	0 %	15604083
7006	NC_000963	ATA	2	6	261948	261953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604083
7007	NC_000963	A	7	7	262052	262058	100 %	0 %	0 %	0 %	15604083
7008	NC_000963	TAAA	2	8	262100	262107	75 %	25 %	0 %	0 %	15604083
7009	NC_000963	T	6	6	262113	262118	0 %	100 %	0 %	0 %	15604083
7010	NC_000963	ATG	2	6	262121	262126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604083
7011	NC_000963	TAAA	2	8	262141	262148	75 %	25 %	0 %	0 %	15604083
7012	NC_000963	CTT	2	6	262165	262170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604083
7013	NC_000963	TAA	2	6	262193	262198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604083
7014	NC_000963	GTTT	2	8	262203	262210	0 %	75 %	25 %	0 %	15604083
7015	NC_000963	ATGA	2	8	262221	262228	50 %	25 %	25 %	0 %	15604083
7016	NC_000963	ATC	2	6	262242	262247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604083
7017	NC_000963	GGTA	2	8	262280	262287	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7018	NC_000963	TTTGT	2	10	262308	262317	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
7019	NC_000963	ATC	2	6	262354	262359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7020	NC_000963	TAA	2	6	262387	262392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7021	NC_000963	GTA	2	6	262423	262428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7022	NC_000963	CAACTG	2	12	262465	262476	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7023	NC_000963	TTA	2	6	262583	262588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7024	NC_000963	T	6	6	262599	262604	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7025	NC_000963	T	6	6	262613	262618	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7026	NC_000963	ATT	2	6	262621	262626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7027	NC_000963	TAA	2	6	262758	262763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7028	NC_000963	TTA	2	6	262764	262769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7029	NC_000963	TA	4	8	262801	262808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7030	NC_000963	TA	3	6	262840	262845	50 %	50 %	0 %	0 %	15604084
7031	NC_000963	T	6	6	262879	262884	0 %	100 %	0 %	0 %	15604084
7032	NC_000963	TA	3	6	262900	262905	50 %	50 %	0 %	0 %	15604084
7033	NC_000963	GCAT	2	8	262908	262915	25 %	25 %	25 %	25 %	15604084
7034	NC_000963	AATA	2	8	262946	262953	75 %	25 %	0 %	0 %	15604084
7035	NC_000963	GAAAAT	2	12	262966	262977	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15604084
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7039	NC_000963	CTTC	2	8	263121	263128	0 %	50 %	0 %	50 %	15604084
7040	NC_000963	TTGTT	2	10	263129	263138	0 %	80 %	20 %	0 %	15604084
7041	NC_000963	GTA	2	6	263163	263168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604084
7042	NC_000963	A	6	6	263226	263231	100 %	0 %	0 %	0 %	15604084
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7046	NC_000963	TAT	2	6	263434	263439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604084
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7048	NC_000963	TTGAT	2	10	263470	263479	20 %	60 %	20 %	0 %	15604084
7049	NC_000963	GT	3	6	263485	263490	0 %	50 %	50 %	0 %	15604084
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7052	NC_000963	TCA	2	6	263685	263690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604084
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7059	NC_000963	T	7	7	263834	263840	0 %	100 %	0 %	0 %	15604084
7060	NC_000963	TAT	2	6	263849	263854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604084
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7064	NC_000963	TAA	2	6	264082	264087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7065	NC_000963	AT	4	8	264096	264103	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7066	NC_000963	ATA	2	6	264142	264147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7073	NC_000963	CTAT	2	8	264284	264291	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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7076	NC_000963	TA	3	6	264320	264325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7077	NC_000963	AT	3	6	264345	264350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7078	NC_000963	T	6	6	264357	264362	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7099	NC_000963	TAA	2	6	265176	265181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7100	NC_000963	TAT	2	6	265286	265291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7102	NC_000963	AGTAA	2	10	265353	265362	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7103	NC_000963	T	6	6	265412	265417	0 %	100 %	0 %	0 %	15604085
7104	NC_000963	T	6	6	265431	265436	0 %	100 %	0 %	0 %	15604085
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7113	NC_000963	ATT	2	6	265694	265699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604085
7114	NC_000963	CA	3	6	265711	265716	50 %	0 %	0 %	50 %	15604085
7115	NC_000963	TGC	2	6	265763	265768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604085
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7120	NC_000963	TCT	2	6	265941	265946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604085
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7126	NC_000963	ATT	3	9	266060	266068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604085
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7129	NC_000963	CTT	2	6	266110	266115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604085
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