MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia prowazekii str. Madrid E chromosome

Total Repeats: 30188

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_000963	TTC	3	9	241889	241897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604072
6502	NC_000963	TAACA	2	10	241898	241907	60 %	20 %	0 %	20 %	15604072
6503	NC_000963	CAAG	2	8	241920	241927	50 %	0 %	25 %	25 %	15604072
6504	NC_000963	TTCT	2	8	242011	242018	0 %	75 %	0 %	25 %	15604072
6505	NC_000963	TCA	2	6	242022	242027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604072
6506	NC_000963	TAA	2	6	242032	242037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604072
6507	NC_000963	ATT	2	6	242107	242112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604073
6508	NC_000963	T	7	7	242174	242180	0 %	100 %	0 %	0 %	15604073
6509	NC_000963	TTAA	2	8	242211	242218	50 %	50 %	0 %	0 %	15604073
6510	NC_000963	GATCT	2	10	242219	242228	20 %	40 %	20 %	20 %	15604073
6511	NC_000963	TAT	2	6	242251	242256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604073
6512	NC_000963	ATTA	2	8	242267	242274	50 %	50 %	0 %	0 %	15604073
6513	NC_000963	TAT	2	6	242312	242317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604073
6514	NC_000963	CTT	2	6	242362	242367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604073
6515	NC_000963	TAA	2	6	242369	242374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604073
6516	NC_000963	TAG	2	6	242377	242382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604073
6517	NC_000963	T	6	6	242412	242417	0 %	100 %	0 %	0 %	15604073
6518	NC_000963	TTA	2	6	242439	242444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604073
6519	NC_000963	TAT	2	6	242470	242475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604073
6520	NC_000963	AT	3	6	242479	242484	50 %	50 %	0 %	0 %	15604073
6521	NC_000963	T	6	6	242491	242496	0 %	100 %	0 %	0 %	15604073
6522	NC_000963	ATA	2	6	242512	242517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604073
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6524	NC_000963	AGCTA	2	10	242600	242609	40 %	20 %	20 %	20 %	15604073
6525	NC_000963	CTG	2	6	242617	242622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604073
6526	NC_000963	AT	3	6	242644	242649	50 %	50 %	0 %	0 %	15604073
6527	NC_000963	TTA	2	6	242695	242700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604073
6528	NC_000963	T	6	6	242734	242739	0 %	100 %	0 %	0 %	15604073
6529	NC_000963	TAC	2	6	242780	242785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604073
6530	NC_000963	ATCA	2	8	242786	242793	50 %	25 %	0 %	25 %	15604073
6531	NC_000963	TGT	2	6	242808	242813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604073
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6533	NC_000963	TA	3	6	242902	242907	50 %	50 %	0 %	0 %	15604073
6534	NC_000963	GTC	2	6	242934	242939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604073
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6536	NC_000963	GTTC	2	8	243012	243019	0 %	50 %	25 %	25 %	15604073
6537	NC_000963	GTT	2	6	243037	243042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604073
6538	NC_000963	TTA	2	6	243054	243059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604073
6539	NC_000963	ATA	2	6	243066	243071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604073
6540	NC_000963	ATT	2	6	243074	243079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604073
6541	NC_000963	CT	3	6	243084	243089	0 %	50 %	0 %	50 %	15604073
6542	NC_000963	T	7	7	243113	243119	0 %	100 %	0 %	0 %	15604073
6543	NC_000963	TTA	2	6	243159	243164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604073
6544	NC_000963	TAC	2	6	243182	243187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604073
6545	NC_000963	GTC	2	6	243194	243199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604073
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6547	NC_000963	CTT	2	6	243247	243252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604073
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6549	NC_000963	TGC	2	6	243422	243427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604073
6550	NC_000963	TTA	2	6	243451	243456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604073
6551	NC_000963	ATT	2	6	243470	243475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604073
6552	NC_000963	T	6	6	243474	243479	0 %	100 %	0 %	0 %	15604073
6553	NC_000963	T	6	6	243498	243503	0 %	100 %	0 %	0 %	15604073
6554	NC_000963	TAAA	2	8	243507	243514	75 %	25 %	0 %	0 %	15604073
6555	NC_000963	TTA	2	6	243549	243554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604073
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6559	NC_000963	TAAC	2	8	243601	243608	50 %	25 %	0 %	25 %	15604073
6560	NC_000963	A	6	6	243610	243615	100 %	0 %	0 %	0 %	15604073
6561	NC_000963	TAT	2	6	243682	243687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604073
6562	NC_000963	TAT	2	6	243692	243697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604073
6563	NC_000963	TAA	2	6	243757	243762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604073
6564	NC_000963	TAG	2	6	243802	243807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604073
6565	NC_000963	TAT	2	6	243878	243883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604073
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6567	NC_000963	T	6	6	243897	243902	0 %	100 %	0 %	0 %	161729089
6568	NC_000963	AT	3	6	243929	243934	50 %	50 %	0 %	0 %	161729089
6569	NC_000963	TTG	2	6	243954	243959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161729089
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6572	NC_000963	GTA	2	6	244064	244069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161729089
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6576	NC_000963	AGAGT	2	10	244202	244211	40 %	20 %	40 %	0 %	161729089
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6582	NC_000963	TTA	2	6	244408	244413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6583	NC_000963	AACAA	2	10	244454	244463	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
6584	NC_000963	AT	3	6	244472	244477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6589	NC_000963	AG	3	6	244758	244763	50 %	0 %	50 %	0 %	15604075
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6593	NC_000963	A	6	6	244859	244864	100 %	0 %	0 %	0 %	15604075
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6600	NC_000963	CAT	2	6	245185	245190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6605	NC_000963	TTA	2	6	245403	245408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604076
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6612	NC_000963	CT	3	6	245696	245701	0 %	50 %	0 %	50 %	15604076
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6622	NC_000963	TAT	2	6	246097	246102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604076
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