MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Pseudomonas fluorescens R124 plasmid pMP-R124

Total Repeats: 132

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022437	CTC	2	6	1300	1305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_022437	CAC	2	6	1308	1313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_022437	TGC	2	6	1400	1405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_022437	CCA	2	6	1408	1413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_022437	AAC	2	6	1425	1430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_022437	A	6	6	2152	2157	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022437	TGG	2	6	2219	2224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022437	AG	3	6	2230	2235	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022437	GT	3	6	2383	2388	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022437	TAC	2	6	2451	2456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_022437	CAC	2	6	2560	2565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_022437	A	6	6	3082	3087	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022437	AGCTG	2	10	3420	3429	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_022437	TAGG	2	8	3447	3454	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022437	CTC	2	6	3541	3546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_022437	AAAT	2	8	3586	3593	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022437	ACA	2	6	3594	3599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_022437	TGT	2	6	3604	3609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022437	TGT	2	6	3623	3628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022437	CGAGG	2	10	3649	3658	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
21	NC_022437	CGC	2	6	3851	3856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_022437	TA	3	6	4340	4345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022437	TAT	2	6	4371	4376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022437	TA	3	6	4388	4393	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022437	ATG	2	6	5405	5410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022437	TA	3	6	5436	5441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022437	ATT	2	6	5532	5537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022437	TA	3	6	5543	5548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022437	GTT	2	6	5559	5564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022437	AGC	2	6	5594	5599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_022437	CAA	2	6	5606	5611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_022437	A	8	8	5610	5617	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022437	GGATG	2	10	5630	5639	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022437	T	6	6	6796	6801	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022437	GC	3	6	6821	6826	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_022437	GTT	2	6	6864	6869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022437	CTG	2	6	6950	6955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_022437	GAT	2	6	6989	6994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022437	TAC	2	6	7131	7136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_022437	GTT	2	6	7188	7193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022437	C	6	6	7686	7691	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
42	NC_022437	G	6	6	7713	7718	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022437	T	6	6	7742	7747	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022437	GCTA	2	8	7770	7777	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_022437	TGG	2	6	7833	7838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022437	TCGAT	2	10	7879	7888	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_022437	A	7	7	7980	7986	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022437	CAC	2	6	8027	8032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_022437	CGC	2	6	8082	8087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_022437	GGT	2	6	8151	8156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022437	GCC	2	6	8316	8321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_022437	GGC	2	6	8388	8393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_022437	AGTT	2	8	8463	8470	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022437	TAA	2	6	8965	8970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022437	AC	3	6	8985	8990	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_022437	GT	3	6	9010	9015	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022437	GGA	2	6	9936	9941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022437	AAGA	2	8	9956	9963	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022437	GTG	2	6	10127	10132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022437	GAT	2	6	10166	10171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022437	TAC	2	6	10209	10214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_022437	GAG	2	6	13411	13416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022437	CCA	2	6	17260	17265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_022437	GTC	2	6	17287	17292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_022437	ATC	2	6	23290	23295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_022437	TAA	2	6	24634	24639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022437	GAA	2	6	24726	24731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022437	TGC	2	6	24776	24781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_022437	TTG	2	6	24794	24799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022437	CTT	2	6	24800	24805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_022437	A	6	6	24876	24881	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022437	TTG	2	6	24950	24955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022437	GAA	2	6	24966	24971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022437	AACG	2	8	24981	24988	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_022437	TGC	2	6	25046	25051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_022437	GGT	2	6	25074	25079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022437	GTT	2	6	25116	25121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022437	CCT	2	6	25149	25154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_022437	GC	3	6	25166	25171	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_022437	GAA	2	6	25649	25654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022437	AG	3	6	25685	25690	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022437	CTT	2	6	30254	30259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_022437	TGC	2	6	30260	30265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_022437	GCCT	2	8	30297	30304	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_022437	AAC	2	6	30339	30344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_022437	CAC	2	6	33105	33110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_022437	AAC	2	6	35681	35686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_022437	CGT	2	6	36206	36211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_022437	TCG	2	6	36242	36247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_022437	GCGAA	2	10	36283	36292	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
91	NC_022437	CA	3	6	36303	36308	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_022437	A	7	7	36312	36318	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022437	AACT	2	8	36418	36425	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_022437	CAC	2	6	37939	37944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_022437	GTG	2	6	37952	37957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022437	TGT	2	6	38556	38561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022437	GTT	2	6	38564	38569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022437	TGGT	2	8	38572	38579	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022437	AGG	2	6	38581	38586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022437	CGG	2	6	38936	38941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_022437	GAT	2	6	39056	39061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022437	CGGT	2	8	39346	39353	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
103	NC_022437	TTAC	2	8	39356	39363	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_022437	CAC	2	6	39424	39429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_022437	CGC	2	6	39458	39463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_022437	TGA	2	6	39488	39493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022437	CAAG	2	8	39518	39525	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_022437	CAC	2	6	39557	39562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_022437	GCC	2	6	39731	39736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_022437	AG	3	6	39828	39833	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022437	C	7	7	40318	40324	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
112	NC_022437	GCA	2	6	40351	40356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_022437	ACGG	2	8	40375	40382	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_022437	GATC	2	8	40433	40440	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_022437	GTT	2	6	40445	40450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022437	GCG	2	6	40493	40498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_022437	A	6	6	40521	40526	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022437	CCA	2	6	40542	40547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_022437	GAA	2	6	40625	40630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022437	GTC	2	6	40720	40725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_022437	TTA	2	6	40743	40748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022437	TTC	2	6	40788	40793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_022437	T	6	6	40810	40815	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022437	A	6	6	40898	40903	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022437	TGC	2	6	42704	42709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_022437	CCT	2	6	42710	42715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_022437	GAG	2	6	42729	42734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022437	C	6	6	43255	43260	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
129	NC_022437	TTA	2	6	43324	43329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022437	TCTTTC	2	12	43668	43679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_022437	GC	3	6	43725	43730	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_022437	CCG	2	6	43776	43781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.