MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Paracoccus aminophilus JCM 7686 plasmid pAMI5

Total Repeats: 664

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_022043	GCG	2	6	206363	206368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_022043	GCC	2	6	206380	206385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
503	NC_022043	GGA	2	6	213432	213437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
504	NC_022043	GTCA	2	8	213469	213476	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
505	NC_022043	CG	4	8	213520	213527	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
506	NC_022043	GCTT	2	8	214080	214087	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
507	NC_022043	CG	3	6	216778	216783	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
508	NC_022043	GAA	2	6	216812	216817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
509	NC_022043	A	6	6	216830	216835	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_022043	ATT	2	6	216844	216849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_022043	GAAAAG	2	12	216884	216895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_022043	ACC	2	6	217706	217711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
513	NC_022043	TCGAAA	2	12	217788	217799	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
514	NC_022043	TGG	2	6	217848	217853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
515	NC_022043	GCC	2	6	217897	217902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
516	NC_022043	CT	3	6	219477	219482	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
517	NC_022043	CAC	2	6	219500	219505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
518	NC_022043	TGC	2	6	219534	219539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_022043	ACGGC	2	10	219599	219608	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
520	NC_022043	GC	3	6	219625	219630	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
521	NC_022043	GAA	2	6	219653	219658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
522	NC_022043	CCCG	2	8	219720	219727	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
523	NC_022043	CTG	2	6	219846	219851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_022043	GAT	2	6	219866	219871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
525	NC_022043	CG	4	8	219886	219893	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
526	NC_022043	TTC	2	6	227712	227717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_022043	CCA	2	6	227750	227755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
528	NC_022043	AGA	2	6	227838	227843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
529	NC_022043	CT	3	6	227862	227867	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
530	NC_022043	GGC	2	6	228993	228998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_022043	CGC	2	6	229008	229013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
532	NC_022043	CGC	2	6	229958	229963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
533	NC_022043	GGC	2	6	231063	231068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_022043	AAG	2	6	232145	232150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
535	NC_022043	GATT	2	8	232189	232196	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
536	NC_022043	AAAT	2	8	232220	232227	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_022043	AAT	2	6	232229	232234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_022043	AAG	2	6	232246	232251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
539	NC_022043	GC	3	6	232276	232281	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
540	NC_022043	TTC	2	6	232300	232305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_022043	CGC	2	6	233338	233343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
542	NC_022043	CGC	2	6	233362	233367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
543	NC_022043	CG	4	8	234089	234096	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
544	NC_022043	CTT	2	6	234240	234245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_022043	CGG	2	6	234285	234290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_022043	TGA	2	6	234291	234296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
547	NC_022043	CCT	2	6	235551	235556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
548	NC_022043	CG	3	6	235602	235607	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
549	NC_022043	GCG	2	6	235755	235760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_022043	AAGC	2	8	235782	235789	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
551	NC_022043	GGC	2	6	235920	235925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_022043	ATG	2	6	237224	237229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
553	NC_022043	GC	3	6	237232	237237	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
554	NC_022043	GC	3	6	237247	237252	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
555	NC_022043	ATC	2	6	238890	238895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_022043	CG	3	6	238905	238910	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
557	NC_022043	CG	3	6	238931	238936	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
558	NC_022043	TGTT	2	8	238946	238953	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
559	NC_022043	GTTT	2	8	239596	239603	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
560	NC_022043	GGA	2	6	241265	241270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
561	NC_022043	TTC	2	6	242023	242028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_022043	TGG	2	6	242037	242042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
563	NC_022043	TGAAA	2	10	244127	244136	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
564	NC_022043	TCC	2	6	245239	245244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
565	NC_022043	CGC	2	6	245288	245293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
566	NC_022043	CGGCAC	2	12	245333	245344	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
567	NC_022043	GAC	2	6	245408	245413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_022043	CCA	2	6	245459	245464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
569	NC_022043	CT	3	6	245474	245479	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
570	NC_022043	GA	3	6	245548	245553	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
571	NC_022043	CGG	2	6	246590	246595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_022043	CG	4	8	246599	246606	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
573	NC_022043	CAA	2	6	253058	253063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_022043	CGC	2	6	254156	254161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
575	NC_022043	GA	3	6	254260	254265	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
576	NC_022043	ACG	2	6	254959	254964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_022043	CCCG	2	8	255464	255471	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
578	NC_022043	CGG	2	6	256951	256956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_022043	CG	3	6	257376	257381	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
580	NC_022043	CGTCT	2	10	261837	261846	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
581	NC_022043	CTCAA	2	10	266815	266824	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
582	NC_022043	CCGG	2	8	267658	267665	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
583	NC_022043	ACG	2	6	267727	267732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_022043	GCG	2	6	269059	269064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_022043	CA	3	6	270582	270587	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
586	NC_022043	AAT	2	6	270597	270602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_022043	T	6	6	270602	270607	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_022043	AAG	2	6	270634	270639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
589	NC_022043	GAG	2	6	270679	270684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
590	NC_022043	CAT	2	6	270692	270697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_022043	AAGAT	2	10	270709	270718	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
592	NC_022043	TACTA	2	10	270728	270737	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
593	NC_022043	ATC	2	6	270809	270814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_022043	TGC	2	6	270836	270841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_022043	CAG	2	6	270856	270861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_022043	AAT	2	6	270998	271003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_022043	AGCG	2	8	271040	271047	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
598	NC_022043	GGA	2	6	271095	271100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
599	NC_022043	T	6	6	271101	271106	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_022043	AGCA	2	8	271129	271136	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
601	NC_022043	TC	3	6	271153	271158	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
602	NC_022043	CA	3	6	271189	271194	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
603	NC_022043	CAAT	2	8	271197	271204	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
604	NC_022043	ATA	2	6	271212	271217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_022043	CGA	2	6	271271	271276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_022043	A	6	6	271278	271283	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_022043	GAAT	2	8	271394	271401	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
608	NC_022043	ATTT	2	8	271436	271443	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_022043	CCG	2	6	271444	271449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
610	NC_022043	AGG	2	6	271477	271482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
611	NC_022043	TGT	2	6	272683	272688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
612	NC_022043	GT	3	6	272771	272776	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
613	NC_022043	GAT	2	6	272792	272797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
614	NC_022043	GAGC	2	8	273509	273516	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
615	NC_022043	GCG	2	6	273556	273561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_022043	C	8	8	273641	273648	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
617	NC_022043	TTCGC	2	10	273671	273680	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
618	NC_022043	AGGCA	2	10	273954	273963	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
619	NC_022043	GCA	2	6	273995	274000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_022043	ACA	2	6	274059	274064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_022043	ACA	2	6	274152	274157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_022043	CGG	2	6	274216	274221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_022043	AAC	2	6	274237	274242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_022043	TCT	3	9	274262	274270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_022043	GCC	2	6	274335	274340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
626	NC_022043	TAA	2	6	275711	275716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_022043	CGC	2	6	275777	275782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
628	NC_022043	GAA	2	6	275856	275861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
629	NC_022043	CAG	2	6	275869	275874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_022043	CG	3	6	275880	275885	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
631	NC_022043	TGG	2	6	275890	275895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
632	NC_022043	CGGGT	2	10	275906	275915	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
633	NC_022043	TCT	2	6	275950	275955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_022043	GA	3	6	276081	276086	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
635	NC_022043	GCC	2	6	277159	277164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
636	NC_022043	CGG	2	6	277177	277182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_022043	CTCATT	2	12	277188	277199	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_022043	CGAA	2	8	277212	277219	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
639	NC_022043	CGA	2	6	280279	280284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
640	NC_022043	CGCGC	2	10	280290	280299	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
641	NC_022043	TTAA	2	8	281218	281225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
642	NC_022043	CTAAG	2	10	281232	281241	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
643	NC_022043	ATG	2	6	281243	281248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
644	NC_022043	GCG	2	6	281276	281281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
645	NC_022043	AT	3	6	281349	281354	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
646	NC_022043	TTTTCT	2	12	281386	281397	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
647	NC_022043	CG	3	6	282842	282847	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
648	NC_022043	GGA	2	6	282867	282872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
649	NC_022043	TAA	2	6	284710	284715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
650	NC_022043	ATC	2	6	284730	284735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
651	NC_022043	GTC	2	6	288699	288704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
652	NC_022043	AC	3	6	288717	288722	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
653	NC_022043	TCC	2	6	288723	288728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
654	NC_022043	CCG	2	6	288842	288847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
655	NC_022043	ACG	2	6	288957	288962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
656	NC_022043	CG	3	6	289885	289890	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
657	NC_022043	GCA	2	6	289998	290003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
658	NC_022043	T	6	6	290167	290172	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
659	NC_022043	GGC	2	6	291395	291400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
660	NC_022043	CGCA	2	8	291414	291421	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
661	NC_022043	CCGA	2	8	291432	291439	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
662	NC_022043	GGT	2	6	292182	292187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
663	NC_022043	ATG	2	6	293941	293946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
664	NC_022043	AAG	2	6	294000	294005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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