MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Pseudomonas protegens CHA0

Total Repeats: 14116

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021237	CAA	2	6	814802	814807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1502	NC_021237	GGC	2	6	814827	814832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_021237	AGC	2	6	814876	814881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_021237	GGT	2	6	814960	814965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_021237	CTG	2	6	814981	814986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1506	NC_021237	GGC	2	6	815476	815481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_021237	A	7	7	815482	815488	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_021237	GA	3	6	817315	817320	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_021237	TC	3	6	817331	817336	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1510	NC_021237	CGTT	2	8	819034	819041	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1511	NC_021237	TTGG	2	8	819193	819200	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_021237	GT	3	6	819209	819214	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_021237	TA	4	8	819284	819291	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_021237	CCT	2	6	822161	822166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1515	NC_021237	GGA	2	6	822172	822177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_021237	GCC	2	6	823539	823544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1517	NC_021237	T	6	6	825538	825543	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_021237	TC	3	6	825692	825697	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1519	NC_021237	GCAG	2	8	825733	825740	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1520	NC_021237	A	7	7	825741	825747	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_021237	GGC	2	6	825829	825834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_021237	GGT	2	6	825878	825883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_021237	CGT	2	6	825898	825903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_021237	GGA	2	6	825905	825910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_021237	A	7	7	826873	826879	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_021237	CAAG	2	8	827020	827027	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1527	NC_021237	GGC	2	6	827080	827085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1528	NC_021237	GCT	2	6	829990	829995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1529	NC_021237	CAG	2	6	830009	830014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1530	NC_021237	GC	3	6	830473	830478	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1531	NC_021237	TA	3	6	830777	830782	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_021237	CCT	2	6	832244	832249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1533	NC_021237	CAGC	2	8	832337	832344	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1534	NC_021237	CGTT	2	8	832367	832374	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1535	NC_021237	TGA	3	9	833405	833413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_021237	A	6	6	833420	833425	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_021237	GGGA	2	8	833749	833756	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_021237	T	7	7	833813	833819	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_021237	TGG	2	6	834796	834801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_021237	G	7	7	836270	836276	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_021237	GTC	2	6	837298	837303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_021237	TCA	2	6	837304	837309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_021237	GGCG	2	8	837316	837323	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1544	NC_021237	GCC	2	6	837417	837422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1545	NC_021237	GGC	2	6	837434	837439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_021237	G	8	8	837464	837471	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_021237	CGT	2	6	838468	838473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1548	NC_021237	TTG	2	6	839605	839610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_021237	G	6	6	839612	839617	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_021237	GGC	2	6	839622	839627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_021237	ACA	2	6	839665	839670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1552	NC_021237	GC	3	6	839717	839722	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1553	NC_021237	GGC	2	6	842034	842039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1554	NC_021237	TCC	2	6	842053	842058	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1555	NC_021237	CTC	2	6	843486	843491	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1556	NC_021237	CTG	2	6	843532	843537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1557	NC_021237	CGC	2	6	843547	843552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1558	NC_021237	C	6	6	843611	843616	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1559	NC_021237	GC	3	6	844631	844636	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1560	NC_021237	AGC	2	6	844652	844657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_021237	CCTG	2	8	848792	848799	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1562	NC_021237	CAC	2	6	848822	848827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1563	NC_021237	AGC	2	6	848925	848930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_021237	TG	3	6	848967	848972	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_021237	GCG	2	6	848978	848983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_021237	CAC	2	6	848996	849001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1567	NC_021237	A	6	6	849054	849059	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_021237	A	6	6	849082	849087	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_021237	CCGGG	2	10	849214	849223	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1570	NC_021237	T	6	6	852040	852045	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_021237	TGCGG	2	10	852052	852061	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1572	NC_021237	TTA	2	6	853047	853052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_021237	CAA	2	6	853095	853100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1574	NC_021237	CGC	2	6	853116	853121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1575	NC_021237	TA	3	6	854509	854514	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1577	NC_021237	GGCC	2	8	856093	856100	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1578	NC_021237	CAGT	2	8	856294	856301	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1579	NC_021237	TTA	2	6	856309	856314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_021237	CAG	2	6	856360	856365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1582	NC_021237	CTT	2	6	856448	856453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1583	NC_021237	A	7	7	856454	856460	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_021237	GCT	2	6	856480	856485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1585	NC_021237	GC	3	6	856493	856498	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1586	NC_021237	AACC	2	8	856521	856528	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1598	NC_021237	GGA	2	6	857131	857136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_021237	CAG	2	6	857204	857209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1602	NC_021237	GTG	2	6	857353	857358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1609	NC_021237	TCGTG	2	10	857755	857764	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1610	NC_021237	TGG	2	6	857824	857829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_021237	GGA	2	6	857860	857865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1615	NC_021237	GGA	2	6	858140	858145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1618	NC_021237	GCT	2	6	858242	858247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1622	NC_021237	GCCT	2	8	858464	858471	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1623	NC_021237	AGG	2	6	858479	858484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1625	NC_021237	TTAA	2	8	858680	858687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1629	NC_021237	TAG	2	6	858987	858992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_021237	GCGA	2	8	858995	859002	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1631	NC_021237	G	6	6	859144	859149	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_021237	TCC	2	6	859154	859159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1633	NC_021237	TAC	2	6	859169	859174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1634	NC_021237	TGAC	2	8	859175	859182	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1635	NC_021237	ACTG	2	8	859456	859463	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1637	NC_021237	AC	3	6	859681	859686	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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