MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Pseudomonas protegens CHA0

Total Repeats: 14116

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_021237	TGGC	2	8	6196933	6196940	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13002	NC_021237	GGC	2	6	6196971	6196976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13003	NC_021237	TGG	2	6	6197075	6197080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13004	NC_021237	TGCT	2	8	6197086	6197093	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13005	NC_021237	CTC	2	6	6200621	6200626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13006	NC_021237	GAA	2	6	6200640	6200645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13007	NC_021237	CGCA	2	8	6202313	6202320	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13008	NC_021237	CGAG	2	8	6202402	6202409	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13009	NC_021237	AG	3	6	6202488	6202493	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13010	NC_021237	TCA	2	6	6202974	6202979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13011	NC_021237	CGG	2	6	6204635	6204640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13012	NC_021237	GGCC	2	8	6204641	6204648	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13013	NC_021237	T	6	6	6206156	6206161	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13014	NC_021237	GC	3	6	6206178	6206183	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13015	NC_021237	TA	3	6	6207390	6207395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13016	NC_021237	TATTGG	2	12	6208955	6208966	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13017	NC_021237	GGC	2	6	6210203	6210208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13018	NC_021237	GGAA	2	8	6210284	6210291	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13019	NC_021237	GCAG	2	8	6210337	6210344	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13020	NC_021237	GC	3	6	6211759	6211764	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13021	NC_021237	GGC	2	6	6211798	6211803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13022	NC_021237	GCC	2	6	6211821	6211826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13023	NC_021237	TC	3	6	6212666	6212671	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13024	NC_021237	ACC	2	6	6213954	6213959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13025	NC_021237	CGG	2	6	6213960	6213965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13026	NC_021237	TGA	2	6	6214021	6214026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13027	NC_021237	GCTC	2	8	6214042	6214049	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13028	NC_021237	GC	3	6	6216334	6216339	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13029	NC_021237	GA	3	6	6216354	6216359	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13030	NC_021237	GGGA	2	8	6216517	6216524	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
13031	NC_021237	TAT	2	6	6223204	6223209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13032	NC_021237	TAA	2	6	6223283	6223288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13033	NC_021237	CTA	2	6	6229267	6229272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13034	NC_021237	GCTTT	2	10	6229321	6229330	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
13035	NC_021237	T	7	7	6230957	6230963	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13037	NC_021237	GCA	2	6	6230998	6231003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13038	NC_021237	G	6	6	6231165	6231170	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13039	NC_021237	CAG	2	6	6231175	6231180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13040	NC_021237	TGAC	2	8	6231208	6231215	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13041	NC_021237	CGAG	2	8	6231240	6231247	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13042	NC_021237	AGC	2	6	6233179	6233184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13043	NC_021237	CTG	2	6	6233239	6233244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13044	NC_021237	T	7	7	6236190	6236196	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13045	NC_021237	GCA	2	6	6238345	6238350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13047	NC_021237	ATA	2	6	6240086	6240091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13048	NC_021237	CGA	2	6	6240181	6240186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13050	NC_021237	AATG	2	8	6240227	6240234	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13051	NC_021237	CGTT	2	8	6240472	6240479	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13052	NC_021237	GCC	2	6	6240555	6240560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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13054	NC_021237	CTT	2	6	6240602	6240607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13055	NC_021237	GCC	2	6	6240881	6240886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13056	NC_021237	GC	3	6	6240923	6240928	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13057	NC_021237	TGA	2	6	6240931	6240936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13058	NC_021237	T	6	6	6242951	6242956	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13059	NC_021237	CCCAG	2	10	6244846	6244855	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
13060	NC_021237	CTT	2	6	6244884	6244889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13063	NC_021237	CTTTC	2	10	6248848	6248857	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
13064	NC_021237	CA	3	6	6248862	6248867	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13065	NC_021237	CCG	2	6	6248932	6248937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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13070	NC_021237	CGT	2	6	6249083	6249088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13073	NC_021237	ACA	2	6	6249316	6249321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13075	NC_021237	AT	3	6	6249372	6249377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13076	NC_021237	CAA	2	6	6249401	6249406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13077	NC_021237	CAT	2	6	6249429	6249434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13079	NC_021237	A	6	6	6250590	6250595	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13081	NC_021237	AGTG	2	8	6250652	6250659	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13082	NC_021237	TATC	2	8	6250700	6250707	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13083	NC_021237	CCGA	2	8	6250738	6250745	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13084	NC_021237	GTA	2	6	6250775	6250780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13087	NC_021237	CGA	2	6	6250916	6250921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13089	NC_021237	T	6	6	6250935	6250940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13099	NC_021237	T	6	6	6251401	6251406	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13101	NC_021237	A	7	7	6254050	6254056	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13102	NC_021237	GCG	2	6	6254108	6254113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13103	NC_021237	ATAA	2	8	6254682	6254689	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13110	NC_021237	CCT	2	6	6259972	6259977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13111	NC_021237	CCG	2	6	6259995	6260000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13112	NC_021237	CCCA	2	8	6260032	6260039	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
13113	NC_021237	T	6	6	6260207	6260212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13115	NC_021237	AC	3	6	6261235	6261240	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13116	NC_021237	CTG	2	6	6262071	6262076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13117	NC_021237	GCC	2	6	6262110	6262115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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13122	NC_021237	A	7	7	6265626	6265632	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13123	NC_021237	T	6	6	6268473	6268478	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13124	NC_021237	A	6	6	6269445	6269450	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13131	NC_021237	A	6	6	6271589	6271594	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13132	NC_021237	GCA	2	6	6271598	6271603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13133	NC_021237	GCC	2	6	6271619	6271624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13134	NC_021237	GCA	2	6	6273442	6273447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13135	NC_021237	GCC	3	9	6273465	6273473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13136	NC_021237	CAT	2	6	6273511	6273516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13138	NC_021237	A	7	7	6274978	6274984	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13139	NC_021237	CGCT	2	8	6274986	6274993	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13140	NC_021237	CTG	2	6	6276851	6276856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13141	NC_021237	AAC	2	6	6276872	6276877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13144	NC_021237	TCG	2	6	6282942	6282947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13146	NC_021237	CGGC	2	8	6285767	6285774	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13147	NC_021237	ACC	2	6	6285824	6285829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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13153	NC_021237	TTC	2	6	6288064	6288069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13224	NC_021237	GAGC	2	8	6315239	6315246	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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13231	NC_021237	GC	3	6	6323061	6323066	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13232	NC_021237	TGCC	2	8	6323076	6323083	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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13241	NC_021237	ACA	2	6	6329032	6329037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13242	NC_021237	T	7	7	6329042	6329048	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13243	NC_021237	CACC	2	8	6329063	6329070	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
13244	NC_021237	TAAT	2	8	6329079	6329086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13245	NC_021237	GCCG	2	8	6329089	6329096	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13246	NC_021237	CGA	2	6	6331429	6331434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13247	NC_021237	GGCAAT	2	12	6331503	6331514	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13248	NC_021237	T	6	6	6331563	6331568	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13249	NC_021237	CATC	2	8	6331574	6331581	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13250	NC_021237	CGC	2	6	6331697	6331702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13251	NC_021237	T	6	6	6331755	6331760	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13252	NC_021237	CTG	2	6	6331850	6331855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13253	NC_021237	CAT	2	6	6331882	6331887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13254	NC_021237	A	6	6	6331890	6331895	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13255	NC_021237	A	6	6	6331902	6331907	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13256	NC_021237	GGC	2	6	6331938	6331943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13257	NC_021237	CA	3	6	6332002	6332007	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13258	NC_021237	C	6	6	6332027	6332032	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13259	NC_021237	TCCC	2	8	6332117	6332124	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
13260	NC_021237	GCA	2	6	6336185	6336190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13261	NC_021237	G	6	6	6339001	6339006	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13262	NC_021237	CGGA	2	8	6340128	6340135	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13263	NC_021237	CGC	2	6	6340182	6340187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13264	NC_021237	GGCC	2	8	6340646	6340653	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13265	NC_021237	TGG	2	6	6340682	6340687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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13274	NC_021237	GTCG	2	8	6346278	6346285	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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13303	NC_021237	GC	3	6	6354474	6354479	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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13349	NC_021237	AAG	2	6	6380488	6380493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13380	NC_021237	ATC	2	6	6395964	6395969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13387	NC_021237	TGCT	2	8	6400397	6400404	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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