MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Propionibacterium acnes HL096PA1 plasmid

Total Repeats: 212

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021086	GCA	2	6	102	107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_021086	TC	3	6	162	167	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_021086	TCAAG	2	10	177	186	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_021086	ATT	2	6	195	200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021086	TA	3	6	234	239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021086	GA	3	6	254	259	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021086	C	6	6	985	990	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8	NC_021086	CGC	2	6	1008	1013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_021086	TAC	2	6	1038	1043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_021086	GAG	2	6	1052	1057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021086	GTA	2	6	1077	1082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021086	TAC	2	6	1088	1093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_021086	CGG	2	6	1732	1737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_021086	CGCC	2	8	1787	1794	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15	NC_021086	TCGACG	2	12	1816	1827	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_021086	CGAA	2	8	1838	1845	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_021086	ACC	2	6	1860	1865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_021086	TAT	2	6	1939	1944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021086	CG	4	8	1954	1961	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_021086	GCC	2	6	2027	2032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_021086	GGGT	2	8	2047	2054	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021086	ATCCA	2	10	2107	2116	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
23	NC_021086	CGC	2	6	2130	2135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_021086	GACG	2	8	2257	2264	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_021086	GGC	2	6	2277	2282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_021086	CGC	2	6	2291	2296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_021086	TGG	2	6	2328	2333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021086	CGCGGG	2	12	3356	3367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_021086	G	6	6	3365	3370	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021086	ACGA	2	8	3374	3381	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_021086	C	6	6	3384	3389	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
32	NC_021086	TGT	2	6	3396	3401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021086	GTG	2	6	4369	4374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021086	GGC	2	6	4420	4425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_021086	GGT	2	6	4436	4441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021086	TAA	2	6	4548	4553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021086	GAC	2	6	4622	4627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_021086	AG	3	6	4837	4842	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021086	CCG	2	6	4934	4939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_021086	CCA	2	6	4967	4972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_021086	GGCG	2	8	4978	4985	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
42	NC_021086	GGTC	2	8	4986	4993	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_021086	CCCG	2	8	5005	5012	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
44	NC_021086	GCCGAG	2	12	5049	5060	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_021086	TTG	2	6	5074	5079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021086	GCT	2	6	5161	5166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_021086	CTG	2	6	5208	5213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_021086	CTC	2	6	5218	5223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_021086	ACT	2	6	5263	5268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_021086	GC	4	8	5330	5337	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_021086	AGA	2	6	5362	5367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021086	CG	3	6	5433	5438	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_021086	CT	3	6	5461	5466	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_021086	TCA	3	9	5543	5551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_021086	TGCG	2	8	5563	5570	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_021086	TAT	2	6	5589	5594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021086	ATC	2	6	5632	5637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_021086	TAG	2	6	5730	5735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021086	CCG	2	6	5754	5759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_021086	TGAC	2	8	5766	5773	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_021086	CTG	2	6	5778	5783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_021086	AGC	2	6	5818	5823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_021086	GGTG	2	8	5885	5892	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021086	ATG	2	6	5971	5976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021086	AGAA	2	8	6308	6315	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021086	G	6	6	6318	6323	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021086	AAGA	2	8	6328	6335	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021086	TCA	2	6	6343	6348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_021086	CA	3	6	6548	6553	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_021086	ACCG	2	8	6557	6564	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_021086	CCT	2	6	6595	6600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_021086	TAG	2	6	6623	6628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021086	ATT	2	6	6631	6636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021086	TG	3	6	6638	6643	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021086	CGC	2	6	6677	6682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_021086	GGT	2	6	6690	6695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021086	CGC	2	6	6978	6983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_021086	GGC	2	6	7000	7005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_021086	GCC	2	6	7017	7022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_021086	TCG	2	6	7041	7046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_021086	CAT	2	6	7890	7895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_021086	TA	3	6	7920	7925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021086	CCA	2	6	7980	7985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_021086	TC	3	6	7997	8002	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_021086	CAC	2	6	8047	8052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_021086	CCA	2	6	8077	8082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_021086	AGG	2	6	8533	8538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021086	ACC	2	6	8791	8796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_021086	CA	3	6	8809	8814	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_021086	GGCC	2	8	9332	9339	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_021086	CA	3	6	9343	9348	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_021086	GGGCC	2	10	9356	9365	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
93	NC_021086	GCCCC	2	10	9373	9382	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
94	NC_021086	GCC	2	6	9403	9408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_021086	GAGC	2	8	9456	9463	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_021086	GTG	2	6	9822	9827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021086	ACA	2	6	9931	9936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_021086	CGT	2	6	10043	10048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_021086	GCG	3	9	10153	10161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_021086	CG	3	6	10189	10194	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_021086	GCC	2	6	10234	10239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_021086	GTC	2	6	10291	10296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_021086	ACG	2	6	10297	10302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_021086	TC	3	6	14389	14394	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_021086	CAC	2	6	14477	14482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_021086	AC	4	8	14539	14546	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_021086	CGC	2	6	14554	14559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_021086	CAT	2	6	14572	14577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_021086	CCA	2	6	14591	14596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_021086	TCA	2	6	15620	15625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_021086	GT	3	6	16754	16759	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021086	CTTC	2	8	16760	16767	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_021086	TTAG	2	8	16849	16856	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021086	GCC	2	6	16914	16919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_021086	TCT	2	6	16923	16928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_021086	TCA	2	6	17602	17607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_021086	CAT	2	6	17613	17618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_021086	TTCC	2	8	19932	19939	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_021086	CCT	2	6	28166	28171	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_021086	AGG	2	6	28191	28196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021086	T	6	6	28233	28238	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021086	CAT	2	6	28271	28276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_021086	GGT	2	6	28352	28357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021086	GTG	2	6	28407	28412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021086	GCTGT	2	10	28455	28464	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
126	NC_021086	CCT	2	6	28583	28588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_021086	TCTG	2	8	28650	28657	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_021086	TG	3	6	28712	28717	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021086	GACT	2	8	28763	28770	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_021086	GAC	2	6	28900	28905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_021086	ACA	2	6	28916	28921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_021086	GGT	2	6	28929	28934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021086	CT	3	6	29669	29674	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_021086	TGCC	2	8	29681	29688	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
135	NC_021086	CCCTAC	2	12	29693	29704	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_021086	TCT	2	6	29748	29753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_021086	TA	3	6	29773	29778	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021086	TGA	2	6	29781	29786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021086	ATG	2	6	36189	36194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021086	CAC	2	6	36203	36208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_021086	A	6	6	43231	43236	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021086	GTCCG	2	10	43332	43341	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
143	NC_021086	TGA	2	6	43689	43694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021086	CGA	2	6	43740	43745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_021086	TGA	2	6	43749	43754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021086	GAT	3	9	43767	43775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021086	CCT	2	6	43795	43800	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
148	NC_021086	GTT	2	6	43899	43904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_021086	ATCC	2	8	43955	43962	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_021086	ACC	2	6	43967	43972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
151	NC_021086	GGTGC	2	10	44011	44020	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
152	NC_021086	CTA	2	6	45256	45261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_021086	A	6	6	45509	45514	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_021086	AC	3	6	45581	45586	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
155	NC_021086	AAC	3	9	45589	45597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_021086	CAA	2	6	45647	45652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_021086	GCC	2	6	46023	46028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
158	NC_021086	TCAA	2	8	46043	46050	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
159	NC_021086	TTC	2	6	46095	46100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_021086	AGG	3	9	46106	46114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
161	NC_021086	AGA	2	6	46132	46137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
162	NC_021086	AGA	2	6	46141	46146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
163	NC_021086	CGT	2	6	46202	46207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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165	NC_021086	AAC	2	6	46276	46281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
166	NC_021086	ACA	2	6	48825	48830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
167	NC_021086	ATG	2	6	48840	48845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
168	NC_021086	CAG	2	6	48871	48876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
169	NC_021086	CAA	2	6	48882	48887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
170	NC_021086	AC	3	6	48920	48925	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
171	NC_021086	CTA	2	6	48966	48971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
172	NC_021086	CCA	2	6	49912	49917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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174	NC_021086	CA	3	6	49955	49960	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
175	NC_021086	GGC	2	6	49961	49966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
176	NC_021086	AGGAA	2	10	49987	49996	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
177	NC_021086	CGG	2	6	50144	50149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
178	NC_021086	ACT	2	6	50174	50179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
179	NC_021086	ACC	2	6	50552	50557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
180	NC_021086	CGC	2	6	50830	50835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
181	NC_021086	ACA	2	6	51185	51190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
182	NC_021086	AC	4	8	51194	51201	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
183	NC_021086	AGC	2	6	52092	52097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
184	NC_021086	GCT	2	6	52145	52150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
185	NC_021086	GCT	2	6	52167	52172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
186	NC_021086	CCG	2	6	52217	52222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
187	NC_021086	TGAT	2	8	52230	52237	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
188	NC_021086	GAC	2	6	52258	52263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
189	NC_021086	GCT	2	6	52301	52306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
190	NC_021086	GCCA	2	8	52354	52361	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
191	NC_021086	CGA	2	6	52390	52395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
192	NC_021086	TGA	2	6	52401	52406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
193	NC_021086	AAG	2	6	52439	52444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
194	NC_021086	ATG	2	6	53928	53933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
195	NC_021086	AC	3	6	53943	53948	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
196	NC_021086	CAC	2	6	53986	53991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
197	NC_021086	ACG	2	6	54046	54051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
198	NC_021086	CA	3	6	54914	54919	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
199	NC_021086	CGA	2	6	54950	54955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
200	NC_021086	GAC	2	6	54956	54961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
201	NC_021086	CCGC	2	8	54966	54973	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
202	NC_021086	GCCACG	2	12	54990	55001	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
203	NC_021086	GTGACC	2	12	55002	55013	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
204	NC_021086	GCCAA	2	10	55044	55053	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
205	NC_021086	CAG	2	6	55393	55398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
206	NC_021086	CGGTGT	2	12	55436	55447	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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208	NC_021086	GGT	2	6	55473	55478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
209	NC_021086	GTC	2	6	55482	55487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
210	NC_021086	TGG	2	6	55498	55503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
211	NC_021086	TAG	2	6	55566	55571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
212	NC_021086	TGG	2	6	55580	55585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.