MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Prevotella dentalis DSM 3688 plasmid pPREDE01

Total Repeats: 54

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019961	GAAA	2	8	13	20	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019961	CGT	2	6	88	93	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_019961	A	6	6	169	174	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019961	CAAATT	2	12	211	222	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_019961	TCAC	2	8	275	282	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_019961	A	6	6	1236	1241	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019961	ATT	2	6	1254	1259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019961	AAG	2	6	1263	1268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019961	AT	4	8	1281	1288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019961	A	6	6	1337	1342	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019961	CA	3	6	1375	1380	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_019961	CTT	2	6	1404	1409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_019961	T	7	7	1414	1420	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019961	TTTA	2	8	1467	1474	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019961	ATCTTT	2	12	1504	1515	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_019961	A	8	8	1808	1815	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019961	T	6	6	1825	1830	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019961	TCT	2	6	1842	1847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_019961	CAA	2	6	1850	1855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_019961	TAG	2	6	1861	1866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019961	A	6	6	1868	1873	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019961	T	6	6	1891	1896	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019961	AACTAA	2	12	1910	1921	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_019961	GCT	3	9	1987	1995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_019961	T	7	7	2015	2021	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019961	GTA	3	9	2086	2094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019961	ACC	2	6	2124	2129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_019961	T	7	7	2156	2162	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019961	T	6	6	2169	2174	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019961	AAT	2	6	2177	2182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019961	TTTTA	2	10	2196	2205	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019961	TTG	2	6	2228	2233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019961	GCTTGG	2	12	2251	2262	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_019961	TGT	2	6	2298	2303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019961	TAA	2	6	2322	2327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019961	T	7	7	2605	2611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019961	ATTT	2	8	2649	2656	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019961	T	6	6	2654	2659	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019961	T	7	7	2709	2715	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019961	TAAA	2	8	2728	2735	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019961	CTTT	2	8	2740	2747	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_019961	AT	3	6	2755	2760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019961	TTTA	2	8	2766	2773	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019961	T	6	6	2783	2788	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019961	T	6	6	2806	2811	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019961	ATT	2	6	2814	2819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019961	CGA	2	6	2837	2842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_019961	TGC	2	6	2843	2848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_019961	TAA	2	6	2855	2860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019961	TATTT	2	10	4404	4413	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019961	CCAA	2	8	4423	4430	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_019961	ACAA	2	8	4434	4441	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_019961	TAAG	2	8	4443	4450	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019961	AAAATC	2	12	4476	4487	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.