MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Pseudomonas stutzeri RCH2 plasmid pPSEST01

Total Repeats: 83

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019937	T	8	8	87	94	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019937	A	7	7	101	107	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019937	GA	3	6	130	135	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019937	GCG	2	6	179	184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_019937	CAT	2	6	189	194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_019937	AG	3	6	202	207	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019937	GC	3	6	214	219	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_019937	TCG	2	6	231	236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_019937	GTCG	3	12	233	244	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_019937	CTGC	2	8	250	257	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_019937	CAAG	2	8	273	280	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_019937	CGG	2	6	310	315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_019937	CAG	2	6	350	355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_019937	GCG	2	6	356	361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_019937	CGAC	2	8	370	377	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_019937	AGCGC	2	10	455	464	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
17	NC_019937	AGCGA	2	10	475	484	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_019937	CAG	2	6	514	519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_019937	A	6	6	526	531	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019937	GCT	2	6	630	635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_019937	ATC	2	6	656	661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_019937	A	6	6	1312	1317	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019937	ACC	2	6	1398	1403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_019937	ATT	2	6	1456	1461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019937	GAT	2	6	1485	1490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019937	ATC	2	6	2170	2175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_019937	GCA	2	6	2194	2199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_019937	CTT	2	6	2341	2346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_019937	CAC	2	6	2453	2458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_019937	CAC	2	6	2533	2538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_019937	ACCT	2	8	2557	2564	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_019937	TCC	2	6	2699	2704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_019937	GCCT	2	8	2836	2843	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_019937	GGCCG	2	10	3239	3248	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
35	NC_019937	GGC	2	6	3259	3264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_019937	GAT	2	6	3323	3328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019937	TGA	2	6	3347	3352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019937	AT	3	6	3375	3380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019937	TTG	2	6	3386	3391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019937	CCTCCC	2	12	3403	3414	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
41	NC_019937	G	6	6	3443	3448	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019937	CATG	2	8	3917	3924	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_019937	ATG	2	6	4051	4056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019937	ATC	2	6	4081	4086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_019937	TCT	2	6	4364	4369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_019937	C	6	6	5026	5031	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
47	NC_019937	AGCC	2	8	5037	5044	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_019937	CT	3	6	6334	6339	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_019937	AGC	2	6	6361	6366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_019937	TAG	3	9	6394	6402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019937	CA	3	6	6404	6409	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_019937	GTGA	2	8	6437	6444	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019937	AGC	2	6	6506	6511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_019937	TAG	3	9	6539	6547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019937	CA	3	6	6549	6554	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_019937	CCA	2	6	7984	7989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_019937	TGA	2	6	7999	8004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019937	T	6	6	8143	8148	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019937	CTG	2	6	8153	8158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_019937	T	6	6	8160	8165	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019937	TTC	2	6	8168	8173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_019937	CAT	2	6	8197	8202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_019937	AGA	2	6	8225	8230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019937	TCT	2	6	10323	10328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_019937	TTG	2	6	10331	10336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019937	GCTTTT	2	12	10347	10358	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_019937	GAG	2	6	10436	10441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019937	TTG	2	6	10444	10449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019937	ATC	2	6	10475	10480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_019937	GTT	2	6	10489	10494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019937	ACA	2	6	10511	10516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_019937	ATA	2	6	10596	10601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019937	A	6	6	10611	10616	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019937	ACAAA	2	10	10673	10682	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_019937	GAAT	2	8	10716	10723	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019937	CTGA	2	8	10782	10789	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_019937	CTCG	2	8	10856	10863	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_019937	CGAGG	2	10	10871	10880	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
79	NC_019937	TTG	3	9	10934	10942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019937	CAGCG	2	10	10949	10958	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
81	NC_019937	TAT	2	6	10962	10967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019937	ATGAGT	2	12	10974	10985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019937	TAT	2	6	10993	10998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.