MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Pseudomonas sp. UW4 chromosome

Total Repeats: 14766

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_019670	CACG	2	8	2471580	2471587	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6002	NC_019670	CAC	2	6	2471609	2471614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6003	NC_019670	T	6	6	2471676	2471681	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_019670	CTG	2	6	2473086	2473091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6005	NC_019670	TA	3	6	2475098	2475103	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_019670	TAA	2	6	2475218	2475223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_019670	TGTC	2	8	2475269	2475276	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6008	NC_019670	T	6	6	2475293	2475298	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_019670	GTC	2	6	2475312	2475317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6010	NC_019670	CTGG	2	8	2475377	2475384	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6011	NC_019670	GGTC	2	8	2475528	2475535	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6012	NC_019670	AAC	2	6	2475557	2475562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6013	NC_019670	TGA	2	6	2475662	2475667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_019670	CAT	2	6	2475716	2475721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6015	NC_019670	CTT	2	6	2475757	2475762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6016	NC_019670	CTG	2	6	2475882	2475887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6017	NC_019670	GAC	2	6	2475951	2475956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6018	NC_019670	GGT	2	6	2475959	2475964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_019670	A	7	7	2478660	2478666	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_019670	CTG	2	6	2478670	2478675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6021	NC_019670	A	6	6	2478685	2478690	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_019670	GGCT	2	8	2478697	2478704	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6023	NC_019670	TGG	2	6	2478743	2478748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_019670	TAT	2	6	2479672	2479677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_019670	TA	3	6	2479762	2479767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_019670	TGA	2	6	2479815	2479820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_019670	CTG	2	6	2479866	2479871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6028	NC_019670	ATT	2	6	2479881	2479886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6029	NC_019670	TC	3	6	2479900	2479905	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6030	NC_019670	AAG	2	6	2479929	2479934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_019670	AGA	2	6	2479964	2479969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_019670	CACG	2	8	2480116	2480123	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6033	NC_019670	CAC	2	6	2480145	2480150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6034	NC_019670	T	6	6	2480212	2480217	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_019670	GAA	2	6	2480260	2480265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_019670	GCA	2	6	2480296	2480301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6037	NC_019670	TCA	2	6	2480314	2480319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6038	NC_019670	GCAA	2	8	2480380	2480387	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6039	NC_019670	CTT	2	6	2480397	2480402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6040	NC_019670	GAT	2	6	2480565	2480570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_019670	GCCG	2	8	2480637	2480644	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6042	NC_019670	CAT	2	6	2480850	2480855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6043	NC_019670	GCG	2	6	2480980	2480985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6044	NC_019670	CACG	2	8	2481071	2481078	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6045	NC_019670	CGC	2	6	2481131	2481136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6046	NC_019670	TGA	2	6	2481158	2481163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_019670	CAGC	2	8	2481238	2481245	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6048	NC_019670	CCG	2	6	2481377	2481382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6049	NC_019670	ATC	2	6	2481426	2481431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6050	NC_019670	TGC	2	6	2481520	2481525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6051	NC_019670	CAT	2	6	2481605	2481610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6052	NC_019670	CTG	2	6	2481624	2481629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6053	NC_019670	CGTT	2	8	2481700	2481707	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6054	NC_019670	AG	4	8	2481748	2481755	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_019670	T	7	7	2481857	2481863	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_019670	TTC	2	6	2481909	2481914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6057	NC_019670	TTGT	2	8	2482747	2482754	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_019670	GGA	2	6	2483333	2483338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_019670	AGCC	2	8	2483351	2483358	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6060	NC_019670	CAG	2	6	2483482	2483487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6061	NC_019670	A	6	6	2484892	2484897	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_019670	CGTG	2	8	2484986	2484993	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6063	NC_019670	CCA	2	6	2485053	2485058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6064	NC_019670	GGCA	2	8	2485122	2485129	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6065	NC_019670	CGA	2	6	2485136	2485141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6066	NC_019670	GT	3	6	2487017	2487022	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_019670	CCCG	2	8	2487031	2487038	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6068	NC_019670	AAC	2	6	2489444	2489449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6069	NC_019670	TGA	2	6	2489450	2489455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_019670	CCCG	2	8	2489983	2489990	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6071	NC_019670	AGC	2	6	2490131	2490136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6072	NC_019670	CGC	2	6	2490153	2490158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6073	NC_019670	CGG	2	6	2490207	2490212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6074	NC_019670	TGA	2	6	2490372	2490377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6075	NC_019670	CAG	2	6	2490406	2490411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6076	NC_019670	TAT	2	6	2490413	2490418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6077	NC_019670	GAAA	2	8	2490452	2490459	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6078	NC_019670	C	7	7	2490475	2490481	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6079	NC_019670	GTT	2	6	2490495	2490500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6080	NC_019670	A	6	6	2490516	2490521	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6081	NC_019670	TGCG	2	8	2496366	2496373	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6082	NC_019670	GTC	2	6	2496378	2496383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6083	NC_019670	TGTC	2	8	2496417	2496424	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6084	NC_019670	TCGG	2	8	2496734	2496741	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6085	NC_019670	GTG	2	6	2499691	2499696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6086	NC_019670	ATCG	2	8	2499714	2499721	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6087	NC_019670	CGT	2	6	2499811	2499816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6088	NC_019670	GTTC	2	8	2499901	2499908	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6089	NC_019670	A	7	7	2499937	2499943	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6090	NC_019670	TCA	2	6	2499954	2499959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6091	NC_019670	AT	3	6	2499968	2499973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6092	NC_019670	CAA	2	6	2500037	2500042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6093	NC_019670	ATT	2	6	2503849	2503854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6094	NC_019670	GA	4	8	2503955	2503962	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6095	NC_019670	G	6	6	2504621	2504626	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6096	NC_019670	AAAACA	2	12	2504654	2504665	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6097	NC_019670	GCC	2	6	2505762	2505767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6098	NC_019670	CGG	2	6	2505795	2505800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6099	NC_019670	AAC	2	6	2505871	2505876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6100	NC_019670	CGC	2	6	2505911	2505916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6101	NC_019670	TCAG	2	8	2508839	2508846	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6102	NC_019670	ACA	2	6	2508857	2508862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6103	NC_019670	TCAA	2	8	2508863	2508870	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6104	NC_019670	AAG	2	6	2508885	2508890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6105	NC_019670	CAAC	2	8	2508921	2508928	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6106	NC_019670	CCCG	2	8	2510371	2510378	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6107	NC_019670	CGC	2	6	2511234	2511239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6108	NC_019670	GCT	2	6	2511368	2511373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6109	NC_019670	ATG	2	6	2511435	2511440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6110	NC_019670	GCC	2	6	2511957	2511962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6111	NC_019670	AGCC	2	8	2511996	2512003	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6112	NC_019670	CTG	2	6	2512035	2512040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6113	NC_019670	GAT	2	6	2512141	2512146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6114	NC_019670	CTG	2	6	2512149	2512154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6115	NC_019670	GTG	2	6	2513208	2513213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6116	NC_019670	G	7	7	2513232	2513238	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_019670	GC	3	6	2514181	2514186	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6118	NC_019670	CGCT	2	8	2514208	2514215	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6119	NC_019670	TC	3	6	2515020	2515025	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6120	NC_019670	TG	3	6	2515034	2515039	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6121	NC_019670	TTC	2	6	2516174	2516179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6122	NC_019670	GGT	2	6	2516200	2516205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6123	NC_019670	GT	3	6	2516204	2516209	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6124	NC_019670	GAT	3	9	2516218	2516226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6125	NC_019670	TATG	2	8	2516268	2516275	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6126	NC_019670	G	7	7	2516974	2516980	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6127	NC_019670	CACG	2	8	2517158	2517165	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6128	NC_019670	CAC	2	6	2517187	2517192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6129	NC_019670	T	6	6	2517254	2517259	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6130	NC_019670	CTG	2	6	2518664	2518669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6131	NC_019670	AGC	2	6	2518734	2518739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6132	NC_019670	TCG	2	6	2518750	2518755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6133	NC_019670	AGG	2	6	2518839	2518844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6134	NC_019670	CAC	2	6	2520246	2520251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6135	NC_019670	CACG	2	8	2520307	2520314	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6136	NC_019670	CAC	2	6	2520336	2520341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6137	NC_019670	T	6	6	2520403	2520408	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6138	NC_019670	CTG	2	6	2521813	2521818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6139	NC_019670	AGC	2	6	2521914	2521919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6140	NC_019670	TGC	2	6	2521952	2521957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6141	NC_019670	ATA	2	6	2522006	2522011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6142	NC_019670	TTCAAT	2	12	2522690	2522701	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6143	NC_019670	GGCCT	2	10	2522786	2522795	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6144	NC_019670	AAT	2	6	2523415	2523420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6145	NC_019670	TCC	2	6	2523433	2523438	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6146	NC_019670	GAGG	2	8	2523444	2523451	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6147	NC_019670	GTG	2	6	2523476	2523481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6148	NC_019670	TAT	2	6	2523603	2523608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6149	NC_019670	A	6	6	2523626	2523631	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6150	NC_019670	ACAG	2	8	2524667	2524674	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6151	NC_019670	CGAT	2	8	2524686	2524693	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6152	NC_019670	TTA	2	6	2524700	2524705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6153	NC_019670	GAGCA	2	10	2524802	2524811	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6154	NC_019670	GC	3	6	2524837	2524842	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6155	NC_019670	A	6	6	2524843	2524848	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6156	NC_019670	CAG	2	6	2524857	2524862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6162	NC_019670	GCCA	2	8	2526042	2526049	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6163	NC_019670	CTCA	2	8	2526144	2526151	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6164	NC_019670	AG	3	6	2526206	2526211	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6165	NC_019670	CCT	2	6	2526250	2526255	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6171	NC_019670	GC	3	6	2527703	2527708	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6172	NC_019670	TGC	2	6	2527735	2527740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6174	NC_019670	CAC	2	6	2527950	2527955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6192	NC_019670	GTCT	2	8	2541861	2541868	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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6202	NC_019670	CACG	2	8	2546052	2546059	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6203	NC_019670	TGC	2	6	2546110	2546115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6210	NC_019670	GGC	2	6	2546336	2546341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6243	NC_019670	AG	3	6	2547107	2547112	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6244	NC_019670	GGCA	2	8	2547224	2547231	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6245	NC_019670	A	8	8	2547272	2547279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6246	NC_019670	T	9	9	2547306	2547314	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6247	NC_019670	TAT	2	6	2548392	2548397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6251	NC_019670	A	6	6	2548484	2548489	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6252	NC_019670	CTT	2	6	2548530	2548535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6253	NC_019670	A	6	6	2548586	2548591	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6254	NC_019670	T	6	6	2548606	2548611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6255	NC_019670	CAGC	2	8	2548675	2548682	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6256	NC_019670	G	6	6	2548707	2548712	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6257	NC_019670	T	6	6	2548732	2548737	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6258	NC_019670	T	7	7	2548742	2548748	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6259	NC_019670	A	6	6	2548795	2548800	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6260	NC_019670	T	6	6	2548840	2548845	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6261	NC_019670	CAG	2	6	2548900	2548905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6395	NC_019670	CGGC	2	8	2610969	2610976	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6396	NC_019670	CCTG	2	8	2612499	2612506	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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6399	NC_019670	CG	4	8	2614318	2614325	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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