MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Pseudomonas putida ND6 plasmid pND6-2

Total Repeats: 194

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018746	ACG	2	6	1412	1417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018746	CAA	2	6	1438	1443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_018746	CTT	2	6	1475	1480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_018746	GACCT	2	10	1494	1503	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_018746	GTC	2	6	1541	1546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_018746	GTC	2	6	1558	1563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_018746	GGAG	2	8	1630	1637	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018746	T	6	6	2021	2026	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018746	AAG	2	6	2054	2059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018746	TTG	2	6	4375	4380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018746	GGGA	2	8	4397	4404	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018746	GGC	2	6	4493	4498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_018746	CGG	2	6	4499	4504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_018746	GC	3	6	4508	4513	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_018746	GCTC	2	8	4546	4553	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_018746	TGA	2	6	4568	4573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018746	AGA	2	6	4630	4635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018746	TGC	2	6	6810	6815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_018746	AGC	2	6	6837	6842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_018746	GCA	2	6	6865	6870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_018746	CAC	2	6	7895	7900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_018746	T	8	8	8240	8247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018746	AGG	2	6	8253	8258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018746	CGG	2	6	9494	9499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_018746	AAG	2	6	10665	10670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018746	CTA	2	6	11682	11687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_018746	TGG	2	6	11692	11697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018746	AAT	2	6	11813	11818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018746	ATA	2	6	11821	11826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018746	TAACA	2	10	11841	11850	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_018746	AGGTT	2	10	11874	11883	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018746	TC	3	6	12325	12330	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_018746	AGG	2	6	13873	13878	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018746	GA	3	6	13890	13895	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018746	GGCA	2	8	15848	15855	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_018746	T	7	7	17731	17737	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018746	TTTG	2	8	17758	17765	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018746	TCG	2	6	20524	20529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_018746	AAT	2	6	26150	26155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018746	CCCTT	2	10	26640	26649	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
41	NC_018746	CTTCT	2	10	26691	26700	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
42	NC_018746	GTTT	2	8	26754	26761	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018746	AAAG	2	8	29796	29803	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018746	T	6	6	29832	29837	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018746	ATG	2	6	31170	31175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018746	ATGAG	2	10	31810	31819	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018746	ATG	2	6	31856	31861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018746	CAA	2	6	31876	31881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_018746	GAAT	2	8	40078	40085	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018746	GGA	2	6	40091	40096	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018746	GCT	2	6	41620	41625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_018746	CCA	2	6	42409	42414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_018746	TC	3	6	42430	42435	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_018746	TCA	2	6	42438	42443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_018746	ATA	2	6	42546	42551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018746	GCC	2	6	42571	42576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_018746	GTT	2	6	42721	42726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018746	ATTTT	2	10	48476	48485	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018746	TAA	2	6	48536	48541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018746	TAC	2	6	48548	48553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_018746	AGC	2	6	48630	48635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_018746	G	6	6	48750	48755	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018746	CCACC	2	10	48791	48800	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
64	NC_018746	CTGG	2	8	49904	49911	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_018746	AGC	2	6	49941	49946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_018746	TA	3	6	49968	49973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018746	ACC	2	6	51713	51718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_018746	A	7	7	52222	52228	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018746	CCA	2	6	52305	52310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_018746	CTT	2	6	52364	52369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_018746	TGC	2	6	52404	52409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_018746	CAG	2	6	52895	52900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_018746	CTC	2	6	54262	54267	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_018746	CAA	3	9	54310	54318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_018746	TAA	2	6	55462	55467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018746	TTA	2	6	55473	55478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018746	CAA	2	6	58651	58656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_018746	ACC	2	6	58803	58808	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_018746	GCA	2	6	58857	58862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_018746	CA	3	6	58926	58931	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_018746	CCA	2	6	58962	58967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_018746	CCA	2	6	58984	58989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_018746	TCGC	2	8	59001	59008	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_018746	ACG	2	6	59367	59372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_018746	AAAAT	2	10	59412	59421	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018746	GC	3	6	59455	59460	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_018746	ACG	2	6	59480	59485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_018746	CAT	3	9	59707	59715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_018746	TCG	2	6	60094	60099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_018746	GGC	2	6	60113	60118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_018746	GGC	2	6	60179	60184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_018746	CCT	2	6	60267	60272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_018746	ACC	2	6	60293	60298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_018746	CGAC	2	8	60310	60317	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
95	NC_018746	AG	3	6	60349	60354	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018746	GTC	2	6	61862	61867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_018746	TCG	2	6	62181	62186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_018746	C	6	6	62927	62932	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
99	NC_018746	TTA	2	6	63505	63510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018746	ATC	2	6	66424	66429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_018746	GGA	2	6	72350	72355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018746	A	7	7	72358	72364	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018746	GTG	2	6	73717	73722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018746	ATC	2	6	75290	75295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_018746	TGA	2	6	77712	77717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018746	A	7	7	78410	78416	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018746	CTG	2	6	78493	78498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_018746	CGG	2	6	79138	79143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_018746	GCG	2	6	79188	79193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_018746	AAC	2	6	79252	79257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_018746	ACT	2	6	79270	79275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_018746	CCA	2	6	79341	79346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_018746	AGC	2	6	79365	79370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_018746	AAAC	2	8	84968	84975	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_018746	CGAA	2	8	89334	89341	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_018746	GCC	2	6	89458	89463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_018746	CAA	2	6	90229	90234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_018746	CCAC	2	8	90276	90283	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
119	NC_018746	GCC	2	6	90304	90309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_018746	GCT	2	6	90392	90397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_018746	CTGC	2	8	90422	90429	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
122	NC_018746	GCC	2	6	90506	90511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_018746	T	6	6	90517	90522	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018746	CCT	2	6	90658	90663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_018746	AGG	2	6	90751	90756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018746	TTCAC	2	10	90768	90777	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
127	NC_018746	C	6	6	90823	90828	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
128	NC_018746	C	6	6	90911	90916	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
129	NC_018746	AT	4	8	90917	90924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018746	TCACCC	2	12	90925	90936	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_018746	TGTT	3	12	91003	91014	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018746	A	6	6	91016	91021	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018746	ATCCA	2	10	91044	91053	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
134	NC_018746	TG	4	8	91067	91074	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018746	AT	3	6	91078	91083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018746	ACCGG	2	10	91143	91152	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
137	NC_018746	TGTC	2	8	91186	91193	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_018746	G	6	6	91269	91274	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018746	TCCCC	2	10	92648	92657	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
140	NC_018746	CCT	2	6	92675	92680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_018746	TGC	2	6	92721	92726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_018746	CAA	2	6	92743	92748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_018746	A	7	7	92769	92775	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018746	TTG	2	6	92839	92844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018746	GCA	2	6	92854	92859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_018746	A	7	7	92945	92951	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018746	TTGG	2	8	92969	92976	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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150	NC_018746	A	7	7	95250	95256	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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193	NC_018746	CCAC	2	8	116638	116645	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
194	NC_018746	CCG	2	6	116954	116959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.