MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Phaeobacter gallaeciensis 2.10 plasmid pPGA2_71

Total Repeats: 200

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018422	GACT	2	8	33	40	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_018422	GTG	2	6	81	86	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018422	CAGA	2	8	1262	1269	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_018422	GCC	2	6	1349	1354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_018422	CCCG	2	8	1380	1387	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6	NC_018422	C	8	8	1427	1434	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7	NC_018422	C	6	6	4643	4648	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8	NC_018422	C	7	7	4751	4757	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9	NC_018422	GGC	2	6	4762	4767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_018422	GGA	2	6	4777	4782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018422	TCC	2	6	7124	7129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_018422	TAAT	2	8	7130	7137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018422	C	6	6	7157	7162	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14	NC_018422	CGGG	2	8	7264	7271	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15	NC_018422	GGCT	2	8	7342	7349	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_018422	CT	3	6	7392	7397	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_018422	CT	3	6	7402	7407	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_018422	CAGG	2	8	7412	7419	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_018422	CAG	2	6	7429	7434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_018422	CCTG	2	8	7437	7444	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_018422	C	6	6	9564	9569	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
22	NC_018422	TGA	2	6	9679	9684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018422	TCA	2	6	9720	9725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_018422	TA	3	6	9798	9803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018422	TGT	2	6	9837	9842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018422	GA	3	6	9855	9860	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018422	AGA	2	6	9869	9874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018422	AAT	2	6	9942	9947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018422	GTT	2	6	9958	9963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018422	AGG	2	6	10075	10080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018422	AGG	2	6	10108	10113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018422	T	6	6	10118	10123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018422	GGAT	2	8	10133	10140	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018422	TCGG	2	8	10252	10259	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_018422	AGGAC	2	10	10321	10330	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_018422	AAGAC	2	10	10339	10348	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_018422	CG	3	6	10384	10389	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_018422	TCAT	2	8	10449	10456	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_018422	T	6	6	10486	10491	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018422	GCAGG	2	10	11339	11348	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
41	NC_018422	G	6	6	11379	11384	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018422	ATC	2	6	11406	11411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_018422	TGT	2	6	11429	11434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018422	CGC	2	6	12707	12712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_018422	GCAGGC	2	12	12735	12746	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_018422	GGGC	2	8	12769	12776	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
47	NC_018422	GC	3	6	12820	12825	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_018422	GCA	2	6	12829	12834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_018422	GGCTGC	2	12	12843	12854	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_018422	CAC	2	6	14961	14966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_018422	AAC	2	6	14984	14989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_018422	TC	3	6	15000	15005	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_018422	ATT	2	6	15054	15059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018422	AGG	2	6	15076	15081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018422	CAC	2	6	15113	15118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_018422	AGC	2	6	15205	15210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_018422	GAT	2	6	15333	15338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018422	ATTCT	2	10	15443	15452	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_018422	AC	3	6	15458	15463	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_018422	GC	4	8	15522	15529	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_018422	TG	3	6	15554	15559	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018422	GC	3	6	15591	15596	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_018422	CG	3	6	15745	15750	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_018422	ACG	2	6	15783	15788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_018422	ACC	2	6	15849	15854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_018422	GTT	2	6	15861	15866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018422	TGC	2	6	15870	15875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_018422	CTG	2	6	16167	16172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_018422	TGA	2	6	16201	16206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018422	GCTT	2	8	16336	16343	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_018422	CACT	2	8	16366	16373	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_018422	GAT	2	6	16388	16393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018422	CAA	2	6	16406	16411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_018422	CACGC	2	10	16412	16421	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
75	NC_018422	CGG	2	6	16446	16451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_018422	GAT	2	6	16467	16472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018422	GC	3	6	16514	16519	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_018422	TTGC	2	8	16548	16555	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_018422	GCG	2	6	16585	16590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_018422	GAT	2	6	16661	16666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018422	GCG	2	6	21252	21257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_018422	CCCG	2	8	21278	21285	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
83	NC_018422	CGGG	2	8	21301	21308	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
84	NC_018422	CCGGC	3	15	23621	23635	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
85	NC_018422	AAG	2	6	23665	23670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018422	CTT	2	6	23686	23691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_018422	CGCCC	2	10	23740	23749	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
88	NC_018422	GC	3	6	23757	23762	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_018422	AGC	2	6	24086	24091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_018422	T	9	9	24111	24119	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018422	TTG	2	6	27176	27181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018422	GCC	2	6	27230	27235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_018422	GC	3	6	27312	27317	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_018422	GCC	2	6	29285	29290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_018422	GGC	2	6	29301	29306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_018422	CGT	2	6	29438	29443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_018422	TCC	2	6	29469	29474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_018422	GCA	2	6	29565	29570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_018422	A	6	6	29570	29575	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018422	GCG	2	6	29616	29621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_018422	GCC	3	9	29668	29676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_018422	GGGCA	2	10	29691	29700	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
103	NC_018422	CCCG	2	8	29703	29710	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
104	NC_018422	GGAA	2	8	29715	29722	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018422	CCA	2	6	32645	32650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_018422	CTT	2	6	32689	32694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_018422	CAGT	2	8	32710	32717	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_018422	CAA	2	6	32744	32749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_018422	TC	3	6	32780	32785	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_018422	T	6	6	32788	32793	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018422	GCT	2	6	32794	32799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_018422	AAAT	2	8	32835	32842	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018422	CTG	2	6	32843	32848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_018422	AGAGA	2	10	32882	32891	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018422	G	8	8	32915	32922	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018422	TTTCA	2	10	32961	32970	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_018422	AGA	2	6	33054	33059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018422	TC	4	8	33091	33098	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_018422	A	6	6	33288	33293	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018422	CATT	2	8	33332	33339	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_018422	CGATA	2	10	33364	33373	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_018422	GGC	2	6	33420	33425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_018422	GCT	2	6	33509	33514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_018422	GCA	2	6	35357	35362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_018422	C	6	6	35435	35440	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
126	NC_018422	GCC	2	6	35448	35453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_018422	AGC	2	6	35512	35517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_018422	C	6	6	35567	35572	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
129	NC_018422	TGA	3	9	35602	35610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018422	TGC	2	6	35612	35617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_018422	GCA	2	6	35657	35662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_018422	GCG	2	6	35677	35682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_018422	CAG	2	6	35688	35693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_018422	GAA	2	6	35773	35778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018422	TGCC	2	8	37575	37582	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
136	NC_018422	GCC	2	6	39158	39163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_018422	TCTGA	2	10	39181	39190	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
138	NC_018422	GGCC	2	8	39208	39215	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_018422	GCG	2	6	41497	41502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_018422	ACG	2	6	41611	41616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_018422	GGC	2	6	41630	41635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_018422	GC	5	10	41634	41643	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_018422	GCC	2	6	41700	41705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
144	NC_018422	GACCCA	2	12	42972	42983	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
145	NC_018422	T	6	6	44509	44514	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018422	GCG	2	6	44515	44520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_018422	GA	3	6	50053	50058	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018422	C	7	7	50431	50437	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
149	NC_018422	GCC	2	6	51278	51283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
150	NC_018422	TGA	2	6	51304	51309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_018422	CCGCG	2	10	51373	51382	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
152	NC_018422	C	7	7	51389	51395	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
153	NC_018422	C	6	6	51424	51429	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
154	NC_018422	CTG	2	6	51453	51458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_018422	CGGG	2	8	51459	51466	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
156	NC_018422	C	6	6	51504	51509	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
157	NC_018422	ACC	2	6	51566	51571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
158	NC_018422	GGT	2	6	51585	51590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
159	NC_018422	A	7	7	51639	51645	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_018422	GAAA	2	8	51690	51697	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
161	NC_018422	CA	3	6	51772	51777	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
162	NC_018422	CAGGT	2	10	51800	51809	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
163	NC_018422	AAGA	2	8	51835	51842	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
164	NC_018422	CGC	2	6	51926	51931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
165	NC_018422	GCC	2	6	52010	52015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
166	NC_018422	AG	3	6	52119	52124	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
167	NC_018422	AG	3	6	52127	52132	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
168	NC_018422	AGGC	2	8	52155	52162	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
169	NC_018422	CGA	2	6	52181	52186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
170	NC_018422	TAC	2	6	52191	52196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
171	NC_018422	CTTTT	2	10	53925	53934	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
172	NC_018422	TGA	2	6	53944	53949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
173	NC_018422	CG	4	8	53952	53959	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
174	NC_018422	A	6	6	53963	53968	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_018422	C	6	6	53970	53975	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
176	NC_018422	G	7	7	53989	53995	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
177	NC_018422	TG	3	6	54024	54029	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
178	NC_018422	CTGC	2	8	56739	56746	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
179	NC_018422	TG	3	6	56752	56757	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
180	NC_018422	TA	3	6	56776	56781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
181	NC_018422	TCA	2	6	59023	59028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
182	NC_018422	GCC	2	6	59085	59090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
183	NC_018422	A	6	6	60397	60402	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_018422	TC	3	6	62590	62595	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
185	NC_018422	ATA	2	6	62596	62601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_018422	GCGG	2	8	64611	64618	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
187	NC_018422	GCC	2	6	64732	64737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
188	NC_018422	CGC	2	6	65824	65829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
189	NC_018422	CG	3	6	65942	65947	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
190	NC_018422	ACCC	2	8	67357	67364	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
191	NC_018422	GTC	2	6	67366	67371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
192	NC_018422	CAT	2	6	67420	67425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
193	NC_018422	GT	3	6	68652	68657	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
194	NC_018422	CTGC	2	8	70097	70104	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
195	NC_018422	AT	3	6	70190	70195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
196	NC_018422	GTG	2	6	70271	70276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
197	NC_018422	T	6	6	70293	70298	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
198	NC_018422	TTA	2	6	70306	70311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
199	NC_018422	TA	4	8	70318	70325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
200	NC_018422	T	6	6	70359	70364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.