MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Phaeobacter gallaeciensis DSM 17395 plasmid pPGA1_65

Total Repeats: 166

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018288	G	6	6	70	75	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018288	GCAGA	2	10	79	88	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_018288	TTG	2	6	1188	1193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018288	CCCG	2	8	1280	1287	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5	NC_018288	GGAT	2	8	1311	1318	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018288	C	7	7	1327	1333	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7	NC_018288	C	6	6	4548	4553	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8	NC_018288	C	7	7	4656	4662	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9	NC_018288	GGC	2	6	4667	4672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_018288	GGCT	2	8	7251	7258	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_018288	CT	3	6	7301	7306	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_018288	CT	3	6	7311	7316	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_018288	CAGG	2	8	7321	7328	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_018288	CAG	2	6	7338	7343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_018288	CCTG	2	8	7346	7353	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_018288	TTA	2	6	7396	7401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018288	TAT	2	6	7407	7412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018288	C	6	6	9470	9475	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
19	NC_018288	TGA	2	6	9585	9590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018288	TCA	2	6	9626	9631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_018288	TCT	2	6	9681	9686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_018288	TA	3	6	9704	9709	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018288	TGT	2	6	9743	9748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018288	GA	3	6	9761	9766	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018288	AGA	2	6	9775	9780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018288	AAT	2	6	9848	9853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018288	GA	3	6	9983	9988	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018288	AGG	2	6	10014	10019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018288	T	6	6	10024	10029	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018288	GGAT	2	8	10039	10046	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018288	ACC	2	6	10154	10159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_018288	AGGAC	2	10	10227	10236	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_018288	AAGAC	2	10	10245	10254	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_018288	TCAT	2	8	10355	10362	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_018288	T	6	6	10392	10397	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018288	GCAGG	2	10	11233	11242	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
37	NC_018288	G	6	6	11273	11278	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018288	ATC	2	6	11300	11305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_018288	TGT	2	6	11323	11328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018288	CGC	2	6	12601	12606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_018288	GGGC	2	8	12663	12670	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
42	NC_018288	GC	3	6	12714	12719	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_018288	GCA	2	6	12723	12728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_018288	GGCTGC	2	12	12737	12748	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_018288	CAC	2	6	14855	14860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_018288	AAC	2	6	14878	14883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_018288	TC	3	6	14894	14899	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_018288	ATT	2	6	14948	14953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018288	AGG	2	6	14970	14975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018288	GGC	2	6	15010	15015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_018288	GCA	2	6	15017	15022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_018288	GGT	2	6	15045	15050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018288	TTGC	2	8	15057	15064	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_018288	GCG	2	6	15094	15099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_018288	GAT	2	6	15170	15175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018288	CAG	2	6	15188	15193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_018288	GCA	2	6	15221	15226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_018288	GCT	2	6	15230	15235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_018288	GCC	2	6	15246	15251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_018288	GTG	2	6	15285	15290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018288	GCA	2	6	15338	15343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_018288	TGC	2	6	15364	15369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_018288	TGC	2	6	15379	15384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_018288	ACC	2	6	15392	15397	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_018288	CGC	2	6	15408	15413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_018288	TGG	2	6	15426	15431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018288	GCG	2	6	16110	16115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_018288	GCCT	2	8	16146	16153	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_018288	CGGG	2	8	16159	16166	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
70	NC_018288	CCGGC	2	10	18479	18488	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
71	NC_018288	AAG	2	6	18518	18523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018288	CTT	2	6	18539	18544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_018288	CCCTG	2	10	18595	18604	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
74	NC_018288	GC	3	6	18610	18615	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_018288	AGC	2	6	18939	18944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_018288	CGG	2	6	18952	18957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_018288	T	8	8	18964	18971	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018288	CCG	2	6	21927	21932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_018288	CAGA	2	8	21935	21942	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_018288	TTG	2	6	22002	22007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018288	CGGG	2	8	22023	22030	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
82	NC_018288	CCG	2	6	22047	22052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_018288	GGC	2	6	24220	24225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_018288	TGG	2	6	24328	24333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018288	A	7	7	24335	24341	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018288	GCC	2	6	24371	24376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_018288	GA	3	6	24392	24397	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018288	CAG	2	6	24420	24425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_018288	GCG	2	6	24457	24462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_018288	GCT	2	6	27321	27326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_018288	GCAC	2	8	27335	27342	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
92	NC_018288	CTC	2	6	27346	27351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_018288	GAA	2	6	27409	27414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018288	GTC	2	6	27550	27555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_018288	TTA	2	6	27556	27561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018288	CTT	2	6	27588	27593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_018288	GCA	2	6	30293	30298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_018288	C	6	6	30371	30376	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
99	NC_018288	GCC	2	6	30384	30389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_018288	GCA	2	6	30424	30429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_018288	GCACCG	2	12	30485	30496	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
102	NC_018288	TGA	3	9	30538	30546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018288	AGA	2	6	30710	30715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018288	CGG	2	6	30723	30728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_018288	TGCC	2	8	32448	32455	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
106	NC_018288	TCTGA	2	10	34054	34063	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
107	NC_018288	GGCC	2	8	34081	34088	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_018288	CGGG	2	8	36361	36368	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
109	NC_018288	CGG	2	6	36371	36376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_018288	ACG	2	6	36484	36489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_018288	GGC	2	6	36503	36508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_018288	GC	5	10	36507	36516	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_018288	GCC	2	6	36573	36578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_018288	GACCCA	2	12	37845	37856	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
115	NC_018288	T	6	6	39381	39386	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018288	GCG	2	6	39387	39392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_018288	C	6	6	41654	41659	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
118	NC_018288	C	6	6	46038	46043	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
119	NC_018288	GC	3	6	46133	46138	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_018288	C	6	6	46177	46182	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
121	NC_018288	CTG	2	6	46211	46216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_018288	CGGG	2	8	46217	46224	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
123	NC_018288	CCCCG	2	10	46307	46316	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
124	NC_018288	ACC	2	6	46324	46329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_018288	GGT	2	6	46343	46348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018288	GAAA	2	8	46449	46456	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018288	CA	3	6	46531	46536	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_018288	AAGA	2	8	46594	46601	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018288	CGC	2	6	46685	46690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_018288	AG	3	6	46878	46883	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018288	AG	3	6	46886	46891	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018288	AGGC	2	8	46914	46921	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_018288	CGA	2	6	46940	46945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_018288	TAC	2	6	46950	46955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_018288	CTTTT	2	10	48611	48620	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_018288	TGT	2	6	48632	48637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018288	TGCA	2	8	48641	48648	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_018288	G	6	6	48674	48679	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018288	TGA	2	6	48680	48685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018288	CTGC	2	8	51458	51465	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
141	NC_018288	TG	3	6	51471	51476	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018288	TA	3	6	51495	51500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018288	TCA	2	6	53754	53759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_018288	GCC	2	6	53816	53821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_018288	CAGCG	2	10	53827	53836	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
146	NC_018288	TC	3	6	57325	57330	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_018288	ATA	2	6	57331	57336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018288	GCGG	2	8	59358	59365	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
149	NC_018288	CGC	2	6	59447	59452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
150	NC_018288	GCC	2	6	59479	59484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
151	NC_018288	AGGG	2	8	60526	60533	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
152	NC_018288	CGC	2	6	60586	60591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
153	NC_018288	CTC	2	6	60630	60635	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
154	NC_018288	CAT	2	6	62184	62189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_018288	GT	3	6	63416	63421	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
156	NC_018288	CTGC	2	8	64861	64868	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
157	NC_018288	AGG	2	6	64881	64886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
158	NC_018288	TGA	2	6	64924	64929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
159	NC_018288	AT	3	6	64955	64960	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_018288	TCG	2	6	65051	65056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_018288	T	6	6	65058	65063	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_018288	TTA	2	6	65071	65076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_018288	TA	4	8	65083	65090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_018288	T	6	6	65124	65129	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_018288	T	6	6	65147	65152	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_018288	GACT	2	8	65182	65189	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.