MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Pseudomonas stutzeri DSM 10701 chromosome

Total Repeats: 9989

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018177	AG	3	6	77	82	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018177	CT	3	6	91	96	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_018177	GAT	2	6	113	118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018177	CTG	2	6	159	164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_018177	GAGT	2	8	241	248	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018177	CGA	2	6	259	264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_018177	TGA	2	6	328	333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018177	TGA	2	6	339	344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018177	TTTC	2	8	6656	6663	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_018177	TTTC	2	8	6689	6696	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_018177	CA	3	6	6720	6725	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_018177	GGA	2	6	6790	6795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018177	GACGG	2	10	6810	6819	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
14	NC_018177	CAG	2	6	6863	6868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_018177	TGCGA	2	10	6885	6894	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_018177	CTT	2	6	6906	6911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_018177	AAAC	2	8	6914	6921	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_018177	CCCG	2	8	6936	6943	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
19	NC_018177	GCA	2	6	6946	6951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_018177	GGT	2	6	6956	6961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018177	AGA	2	6	7003	7008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018177	AGG	2	6	7021	7026	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018177	CCT	2	6	7032	7037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_018177	GAA	2	6	7083	7088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018177	GCCT	2	8	7139	7146	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_018177	GATG	2	8	7153	7160	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018177	A	6	6	7241	7246	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018177	ATC	2	6	7286	7291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_018177	AAC	2	6	7314	7319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_018177	A	6	6	7693	7698	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018177	ATC	2	6	7788	7793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_018177	TTGT	2	8	7853	7860	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018177	TGG	2	6	15076	15081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018177	TCGG	2	8	15105	15112	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_018177	TGG	2	6	15189	15194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018177	CAG	2	6	15233	15238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_018177	TGA	2	6	15338	15343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018177	CT	3	6	15430	15435	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_018177	AGCG	2	8	16501	16508	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_018177	CGC	2	6	16528	16533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_018177	C	6	6	16673	16678	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
42	NC_018177	TCG	2	6	16824	16829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_018177	TTG	2	6	17915	17920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018177	GGCT	2	8	17949	17956	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_018177	TTG	2	6	17970	17975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018177	GGCG	2	8	25067	25074	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
47	NC_018177	AGG	2	6	25118	25123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018177	CGG	2	6	26189	26194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_018177	CCT	2	6	27831	27836	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_018177	GGA	2	6	27909	27914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018177	GGCTT	2	10	27928	27937	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
52	NC_018177	A	6	6	27989	27994	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018177	ATT	2	6	28001	28006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018177	TCA	2	6	28064	28069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_018177	GCTA	2	8	28113	28120	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_018177	GCCC	2	8	28136	28143	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
57	NC_018177	A	6	6	28160	28165	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018177	TC	3	6	28190	28195	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_018177	CAG	2	6	29462	29467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_018177	GACG	2	8	29554	29561	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_018177	CT	3	6	29583	29588	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_018177	CGA	2	6	29708	29713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_018177	CAA	2	6	29744	29749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_018177	CG	3	6	29762	29767	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_018177	ATG	2	6	29786	29791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018177	TTG	2	6	29805	29810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018177	T	6	6	29857	29862	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018177	TCAT	2	8	29901	29908	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_018177	TCA	2	6	29977	29982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_018177	AAAG	2	8	31607	31614	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018177	GGT	2	6	33056	33061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018177	GCA	2	6	33069	33074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_018177	CCCTG	2	10	33076	33085	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
74	NC_018177	CGC	2	6	37459	37464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_018177	T	6	6	38116	38121	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018177	GA	3	6	38127	38132	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018177	AGG	2	6	39047	39052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018177	GAAT	2	8	39370	39377	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018177	GCC	2	6	39781	39786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_018177	CG	3	6	39790	39795	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_018177	GCT	2	6	39812	39817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_018177	CGAA	2	8	42068	42075	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_018177	AAC	2	6	42095	42100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_018177	TGCC	2	8	42136	42143	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_018177	AG	3	6	42176	42181	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018177	ACC	2	6	42219	42224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_018177	TGT	2	6	43218	43223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018177	GCCG	2	8	43231	43238	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_018177	AGG	2	6	43258	43263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018177	GCA	2	6	43283	43288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_018177	GGA	2	6	43367	43372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018177	TTC	2	6	44949	44954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_018177	A	6	6	47244	47249	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018177	GCT	2	6	47830	47835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_018177	CGC	2	6	47865	47870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_018177	GCG	2	6	47888	47893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_018177	CAT	2	6	47917	47922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_018177	CAC	2	6	47932	47937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_018177	TGC	2	6	49004	49009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_018177	CTG	3	9	50142	50150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_018177	CAG	2	6	50185	50190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_018177	TGA	2	6	50786	50791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018177	GAAT	2	8	50823	50830	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018177	GAT	2	6	51896	51901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018177	TCG	2	6	51933	51938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_018177	GAC	2	6	54709	54714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_018177	GCG	3	9	54754	54762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_018177	CCAC	2	8	54783	54790	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
109	NC_018177	CG	3	6	54810	54815	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_018177	GCG	2	6	54853	54858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_018177	T	6	6	54870	54875	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018177	T	7	7	54880	54886	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018177	ACG	2	6	55902	55907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_018177	CGT	2	6	55936	55941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_018177	CGGCA	2	10	58019	58028	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
116	NC_018177	CTG	2	6	58039	58044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_018177	CGC	2	6	58047	58052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_018177	CG	3	6	58079	58084	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_018177	AGC	2	6	58105	58110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_018177	TCG	2	6	58160	58165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_018177	GGAA	2	8	58171	58178	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018177	TCC	2	6	58190	58195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_018177	CT	3	6	58204	58209	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_018177	GTC	2	6	58223	58228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_018177	GGGCA	2	10	58839	58848	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
126	NC_018177	CGCC	2	8	58925	58932	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
127	NC_018177	GC	3	6	60821	60826	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_018177	GCC	2	6	60846	60851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_018177	AC	3	6	61224	61229	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_018177	CCA	2	6	61244	61249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_018177	GTC	2	6	61289	61294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_018177	CGG	2	6	61296	61301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_018177	ACG	2	6	61307	61312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_018177	TCA	2	6	61345	61350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_018177	GC	3	6	61768	61773	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_018177	CTGCG	3	15	61812	61826	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
137	NC_018177	GCG	2	6	61840	61845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_018177	TCG	2	6	61879	61884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_018177	TGC	2	6	61895	61900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_018177	GCG	2	6	61957	61962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_018177	TCAT	2	8	61970	61977	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_018177	TC	3	6	61994	61999	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_018177	TGCCT	2	10	62004	62013	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
144	NC_018177	ATGACG	2	12	62081	62092	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
145	NC_018177	GCG	2	6	62114	62119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_018177	GCG	2	6	62592	62597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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282	NC_018177	GC	4	8	132611	132618	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
283	NC_018177	GGT	2	6	132633	132638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
284	NC_018177	GCAGA	2	10	132719	132728	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
285	NC_018177	GACGC	2	10	132811	132820	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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287	NC_018177	TGG	2	6	134239	134244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
288	NC_018177	GGTC	2	8	134314	134321	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
289	NC_018177	CTT	2	6	136247	136252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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447	NC_018177	CGC	2	6	188923	188928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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462	NC_018177	GCCG	2	8	189536	189543	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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464	NC_018177	A	6	6	189681	189686	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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