MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Pseudomonas putida ND6 chromosome

Total Repeats: 10715

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017986	CA	3	6	552396	552401	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1002	NC_017986	ACG	2	6	552785	552790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_017986	TCCC	2	8	552865	552872	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1004	NC_017986	CAG	2	6	553066	553071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_017986	GC	3	6	554363	554368	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1006	NC_017986	CGG	2	6	556560	556565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_017986	GGC	2	6	560893	560898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_017986	CAC	2	6	560931	560936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1009	NC_017986	TCC	2	6	560941	560946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1010	NC_017986	TGA	2	6	561774	561779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_017986	ATC	2	6	562969	562974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_017986	CTG	2	6	563080	563085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_017986	AGA	2	6	563111	563116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_017986	GCT	2	6	564373	564378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_017986	CGC	2	6	565200	565205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1016	NC_017986	CCTG	2	8	565232	565239	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1017	NC_017986	ACA	2	6	565281	565286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_017986	AGC	2	6	566485	566490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_017986	CGG	2	6	566504	566509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_017986	CCG	2	6	566528	566533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1021	NC_017986	CGT	2	6	569825	569830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_017986	CA	3	6	569846	569851	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1023	NC_017986	TCC	2	6	569873	569878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1024	NC_017986	TTCA	2	8	569892	569899	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1025	NC_017986	GTTC	2	8	571755	571762	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1026	NC_017986	TGG	2	6	572341	572346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_017986	T	7	7	572953	572959	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_017986	A	7	7	572990	572996	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_017986	ACGG	2	8	573116	573123	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1030	NC_017986	GCC	2	6	575872	575877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1031	NC_017986	AGG	2	6	578296	578301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_017986	GC	3	6	578309	578314	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1033	NC_017986	A	6	6	578321	578326	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_017986	GGC	2	6	578395	578400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_017986	CTG	2	6	578434	578439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_017986	TGC	2	6	578480	578485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_017986	GTT	2	6	578515	578520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_017986	AAC	2	6	578543	578548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_017986	C	6	6	578567	578572	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1040	NC_017986	A	8	8	578577	578584	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_017986	A	6	6	578590	578595	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_017986	CCGT	2	8	578630	578637	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1043	NC_017986	CCGC	2	8	578644	578651	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1044	NC_017986	AGG	2	6	578711	578716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_017986	AAG	2	6	578999	579004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1047	NC_017986	TTG	2	6	582148	582153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_017986	AGC	2	6	582301	582306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1050	NC_017986	TCCG	2	8	584398	584405	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1051	NC_017986	GA	3	6	584408	584413	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_017986	G	6	6	584434	584439	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_017986	G	6	6	584452	584457	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_017986	A	6	6	584473	584478	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_017986	T	7	7	584496	584502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_017986	GC	3	6	584530	584535	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1057	NC_017986	AC	3	6	584545	584550	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1058	NC_017986	TTC	2	6	587233	587238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_017986	TC	3	6	587237	587242	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1060	NC_017986	GGC	2	6	587313	587318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_017986	CGC	2	6	587334	587339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1062	NC_017986	TGC	2	6	587375	587380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_017986	GT	3	6	587407	587412	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_017986	GCT	2	6	587424	587429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_017986	GC	3	6	588548	588553	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1066	NC_017986	ATT	2	6	588554	588559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_017986	CA	3	6	588564	588569	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1068	NC_017986	A	6	6	589748	589753	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_017986	AGAA	2	8	589784	589791	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1073	NC_017986	TGT	2	6	593326	593331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1075	NC_017986	GCT	2	6	594863	594868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1077	NC_017986	GTG	2	6	595000	595005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_017986	GCC	2	6	596287	596292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1079	NC_017986	CAG	2	6	599014	599019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1081	NC_017986	CTGT	2	8	602083	602090	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1082	NC_017986	CTC	2	6	605434	605439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1083	NC_017986	T	8	8	606821	606828	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_017986	CTA	2	6	606841	606846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1089	NC_017986	AAAT	2	8	608837	608844	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1091	NC_017986	AGC	2	6	609433	609438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_017986	GC	3	6	609437	609442	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1093	NC_017986	CGCT	2	8	609447	609454	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1094	NC_017986	GC	3	6	609465	609470	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1095	NC_017986	GCC	2	6	609472	609477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1096	NC_017986	CCG	2	6	609493	609498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1097	NC_017986	ATT	2	6	610628	610633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1101	NC_017986	T	8	8	611811	611818	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_017986	TAG	2	6	612265	612270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_017986	GGT	2	6	612294	612299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_017986	A	6	6	612307	612312	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_017986	CGC	2	6	612321	612326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1106	NC_017986	CAA	2	6	612413	612418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_017986	A	6	6	612417	612422	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_017986	T	7	7	612458	612464	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_017986	T	8	8	612508	612515	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_017986	TACT	2	8	612539	612546	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1111	NC_017986	GA	3	6	612590	612595	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_017986	AAG	2	6	612902	612907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_017986	T	6	6	612929	612934	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_017986	CAG	2	6	612962	612967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_017986	AGGC	2	8	612988	612995	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1116	NC_017986	GT	3	6	613000	613005	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_017986	GAT	2	6	614085	614090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_017986	G	6	6	614414	614419	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_017986	CTGG	2	8	618266	618273	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1120	NC_017986	GGGT	2	8	619069	619076	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_017986	GCCG	2	8	619081	619088	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1122	NC_017986	CTGG	2	8	619118	619125	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1123	NC_017986	TC	3	6	619175	619180	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1124	NC_017986	GCAA	2	8	619349	619356	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1125	NC_017986	GCGGG	2	10	622343	622352	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
1126	NC_017986	AGG	2	6	622385	622390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_017986	ATG	2	6	622402	622407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_017986	AGA	2	6	622441	622446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_017986	AGC	2	6	624402	624407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_017986	CCTG	2	8	625225	625232	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1131	NC_017986	TTA	2	6	626452	626457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_017986	ATG	2	6	626516	626521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_017986	GCG	2	6	626576	626581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_017986	GGC	2	6	627669	627674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_017986	TTC	2	6	627679	627684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1136	NC_017986	AAAG	2	8	629635	629642	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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