MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Pseudomonas fluorescens A506 chromosome

Total Repeats: 12573

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_017911	CTG	2	6	5907434	5907439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12502	NC_017911	AT	3	6	5907453	5907458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12503	NC_017911	GC	3	6	5907473	5907478	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12504	NC_017911	GCC	2	6	5907489	5907494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12505	NC_017911	C	6	6	5907553	5907558	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12506	NC_017911	GCG	2	6	5908081	5908086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12507	NC_017911	A	7	7	5908096	5908102	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12508	NC_017911	TTG	2	6	5909180	5909185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12509	NC_017911	TCA	2	6	5912453	5912458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12510	NC_017911	CGC	2	6	5912948	5912953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12511	NC_017911	ATT	2	6	5914680	5914685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12512	NC_017911	AGC	2	6	5920472	5920477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12513	NC_017911	AAATA	2	10	5920492	5920501	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12514	NC_017911	CGT	2	6	5920554	5920559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12515	NC_017911	TGG	2	6	5922127	5922132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12516	NC_017911	AGT	2	6	5923319	5923324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12517	NC_017911	C	6	6	5923325	5923330	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12518	NC_017911	CTG	2	6	5923344	5923349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12519	NC_017911	CAAA	2	8	5923366	5923373	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12520	NC_017911	GAAT	2	8	5923387	5923394	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12521	NC_017911	ACTC	2	8	5925031	5925038	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12522	NC_017911	GGCA	2	8	5925062	5925069	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12523	NC_017911	GCC	2	6	5925070	5925075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12524	NC_017911	AGT	2	6	5925368	5925373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12525	NC_017911	GT	3	6	5931432	5931437	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12526	NC_017911	TTC	2	6	5931508	5931513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12527	NC_017911	GGT	2	6	5937364	5937369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12528	NC_017911	TAT	2	6	5937449	5937454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12529	NC_017911	A	6	6	5937873	5937878	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12530	NC_017911	GTTTC	2	10	5940543	5940552	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
12531	NC_017911	AAC	2	6	5940641	5940646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12532	NC_017911	GCG	2	6	5940672	5940677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12533	NC_017911	CAT	2	6	5940688	5940693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12534	NC_017911	AAG	2	6	5942176	5942181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12535	NC_017911	A	6	6	5942190	5942195	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12536	NC_017911	AATC	2	8	5942225	5942232	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12537	NC_017911	TGA	2	6	5942692	5942697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12538	NC_017911	CTG	2	6	5946585	5946590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12539	NC_017911	TCC	2	6	5947939	5947944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12540	NC_017911	CGT	2	6	5947954	5947959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12541	NC_017911	T	6	6	5947970	5947975	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12542	NC_017911	GCT	2	6	5949145	5949150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12543	NC_017911	GCA	2	6	5949197	5949202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12544	NC_017911	GCG	2	6	5949271	5949276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12545	NC_017911	CTC	2	6	5949371	5949376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12546	NC_017911	GC	3	6	5949429	5949434	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12547	NC_017911	CTTG	2	8	5951192	5951199	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12548	NC_017911	TTGT	2	8	5953780	5953787	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
12549	NC_017911	AG	3	6	5953899	5953904	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12550	NC_017911	TTA	2	6	5953909	5953914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12551	NC_017911	TTTA	2	8	5953931	5953938	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12552	NC_017911	TAA	2	6	5954245	5954250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12553	NC_017911	AAT	2	6	5955741	5955746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12554	NC_017911	T	7	7	5955763	5955769	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12555	NC_017911	ACG	2	6	5955796	5955801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12556	NC_017911	GAA	3	9	5961427	5961435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12557	NC_017911	ACC	2	6	5961468	5961473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12558	NC_017911	ACG	2	6	5961501	5961506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12559	NC_017911	CAGC	2	8	5961513	5961520	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12560	NC_017911	AGA	2	6	5961529	5961534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12561	NC_017911	AAC	2	6	5961569	5961574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12562	NC_017911	TGGC	2	8	5961592	5961599	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12563	NC_017911	GCG	2	6	5962103	5962108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12564	NC_017911	GACAG	2	10	5962113	5962122	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
12565	NC_017911	TTGG	2	8	5962186	5962193	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12566	NC_017911	GTT	2	6	5962211	5962216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12567	NC_017911	AAGC	2	8	5962279	5962286	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12568	NC_017911	GATA	2	8	5962378	5962385	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12569	NC_017911	GAAG	2	8	5962396	5962403	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12570	NC_017911	ATC	2	6	5962448	5962453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12571	NC_017911	ACA	2	6	5962502	5962507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12572	NC_017911	TGC	2	6	5962533	5962538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12573	NC_017911	TG	4	8	5962553	5962560	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.