MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Prevotella intermedia 17 chromosome chromosome I

Total Repeats: 2715

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017860	TTC	2	6	220472	220477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_017860	TTG	2	6	220495	220500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_017860	GGT	2	6	220515	220520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_017860	A	6	6	220526	220531	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_017860	CT	3	6	220533	220538	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1006	NC_017860	ATT	2	6	220551	220556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_017860	GTTTG	2	10	220705	220714	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_017860	CTTT	2	8	220731	220738	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1009	NC_017860	AT	3	6	220829	220834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_017860	A	6	6	220846	220851	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_017860	TTTTAT	2	12	220876	220887	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_017860	TTA	2	6	221802	221807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_017860	ATA	2	6	221821	221826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_017860	ATAA	2	8	221858	221865	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_017860	ATT	2	6	221929	221934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_017860	TGT	3	9	225191	225199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_017860	T	6	6	225199	225204	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_017860	TTAAG	2	10	225232	225241	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_017860	TCA	2	6	225259	225264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_017860	AAG	2	6	225355	225360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_017860	AAG	2	6	225457	225462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_017860	TGT	2	6	225498	225503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_017860	AAC	2	6	225506	225511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_017860	T	6	6	225635	225640	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_017860	ATA	2	6	225735	225740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_017860	TTC	2	6	227849	227854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_017860	TAT	2	6	227880	227885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_017860	GTC	2	6	227906	227911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_017860	TAAATG	2	12	228628	228639	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_017860	TAT	2	6	229649	229654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_017860	TGAAT	2	10	229656	229665	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_017860	AGT	2	6	229685	229690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_017860	TAA	2	6	230589	230594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_017860	A	6	6	231600	231605	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_017860	CAG	2	6	232333	232338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_017860	GAAA	2	8	232354	232361	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_017860	TTCT	2	8	232366	232373	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1038	NC_017860	T	6	6	232377	232382	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_017860	CGAA	2	8	232395	232402	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1040	NC_017860	GGA	2	6	232409	232414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_017860	T	6	6	232517	232522	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_017860	CTT	2	6	232538	232543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_017860	ATAC	2	8	232641	232648	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1044	NC_017860	A	6	6	232649	232654	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_017860	CTAAAA	2	12	232700	232711	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1046	NC_017860	TTTA	2	8	232745	232752	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_017860	TATGT	2	10	235742	235751	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_017860	TAT	2	6	235757	235762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_017860	AGG	2	6	235815	235820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_017860	AAG	2	6	235821	235826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_017860	ATTG	2	8	235842	235849	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_017860	ATA	3	9	235861	235869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_017860	A	7	7	235869	235875	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_017860	AAAT	2	8	235887	235894	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_017860	ATT	2	6	235907	235912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_017860	TAA	2	6	235929	235934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_017860	GCA	2	6	235939	235944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_017860	AAATA	2	10	236244	236253	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_017860	TA	4	8	236281	236288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_017860	TG	3	6	236290	236295	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_017860	TATT	2	8	238464	238471	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_017860	T	8	8	238470	238477	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_017860	ATTT	2	8	238479	238486	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_017860	TAA	2	6	238540	238545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_017860	GAA	2	6	238551	238556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_017860	TAT	2	6	239802	239807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1068	NC_017860	TTA	2	6	241855	241860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_017860	A	9	9	241860	241868	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_017860	TA	3	6	241886	241891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_017860	TAA	2	6	241905	241910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_017860	CAAA	2	8	241949	241956	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1073	NC_017860	AT	3	6	241973	241978	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_017860	CA	3	6	243568	243573	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1075	NC_017860	ACAA	2	8	243601	243608	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1076	NC_017860	CAT	2	6	247002	247007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1078	NC_017860	GGT	2	6	247109	247114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_017860	TGT	2	6	247170	247175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_017860	ACAG	2	8	247185	247192	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1081	NC_017860	GCA	2	6	247208	247213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_017860	GTTTTC	2	12	247237	247248	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1083	NC_017860	TGT	2	6	247260	247265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_017860	TTG	2	6	247274	247279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_017860	GTT	2	6	247289	247294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_017860	TAAA	2	8	247353	247360	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_017860	A	8	8	247370	247377	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_017860	TGGT	2	8	247390	247397	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1090	NC_017860	AAG	2	6	247676	247681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_017860	AATA	2	8	247692	247699	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_017860	A	7	7	247699	247705	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_017860	GTTT	2	8	247817	247824	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1095	NC_017860	CGGTA	2	10	247864	247873	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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1098	NC_017860	T	6	6	248006	248011	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_017860	T	6	6	248018	248023	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_017860	TAAG	2	8	248059	248066	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_017860	GAA	2	6	248073	248078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_017860	A	6	6	248140	248145	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_017860	CAA	2	6	248193	248198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_017860	AT	3	6	248331	248336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_017860	GCA	2	6	248367	248372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_017860	CTT	2	6	248411	248416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_017860	TACC	2	8	248421	248428	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1108	NC_017860	TGG	2	6	248438	248443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_017860	TTA	2	6	250934	250939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_017860	TTG	2	6	250966	250971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_017860	CTCG	2	8	251072	251079	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1112	NC_017860	TAA	2	6	251080	251085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_017860	GAA	2	6	251142	251147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_017860	CCCA	2	8	251190	251197	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1115	NC_017860	TAA	2	6	251198	251203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_017860	AAG	2	6	251359	251364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_017860	ATAC	2	8	251421	251428	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1118	NC_017860	AAGC	2	8	251432	251439	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1119	NC_017860	CTT	2	6	251550	251555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_017860	TA	3	6	251835	251840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_017860	GTC	2	6	251883	251888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1127	NC_017860	ATG	2	6	252238	252243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_017860	TTG	3	9	252256	252264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_017860	CTG	2	6	252295	252300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_017860	CGA	2	6	252366	252371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_017860	TTG	2	6	252403	252408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_017860	CTG	2	6	252541	252546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_017860	TA	3	6	252603	252608	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_017860	TA	3	6	252630	252635	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_017860	TCA	2	6	252791	252796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1136	NC_017860	CGT	2	6	252887	252892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1138	NC_017860	TCG	2	6	252921	252926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1266	NC_017860	TA	3	6	268955	268960	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1267	NC_017860	T	6	6	268991	268996	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1269	NC_017860	AAC	2	6	269231	269236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1270	NC_017860	ACC	2	6	269242	269247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1271	NC_017860	CCT	2	6	269871	269876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1272	NC_017860	AGA	2	6	272395	272400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1273	NC_017860	AAGG	2	8	275748	275755	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1413	NC_017860	TAAA	2	8	310032	310039	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1414	NC_017860	GTTT	2	8	310101	310108	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1415	NC_017860	CTGTAA	2	12	310111	310122	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1416	NC_017860	TCA	2	6	310158	310163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1418	NC_017860	GATT	2	8	310237	310244	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1419	NC_017860	TGA	2	6	310247	310252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1421	NC_017860	TATT	2	8	310284	310291	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1422	NC_017860	GAT	2	6	310294	310299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1427	NC_017860	T	6	6	310719	310724	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1428	NC_017860	ATT	2	6	310731	310736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1429	NC_017860	TAT	2	6	310753	310758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1430	NC_017860	TTC	2	6	310824	310829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1431	NC_017860	TTCG	2	8	310876	310883	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1432	NC_017860	TTA	2	6	312755	312760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1433	NC_017860	TA	4	8	312759	312766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1434	NC_017860	TGG	2	6	312781	312786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1436	NC_017860	A	6	6	312899	312904	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1442	NC_017860	TTG	2	6	314217	314222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1443	NC_017860	T	6	6	314275	314280	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1444	NC_017860	TAA	2	6	314482	314487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1445	NC_017860	ACC	2	6	314559	314564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1446	NC_017860	T	6	6	316076	316081	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1447	NC_017860	AGA	2	6	316108	316113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1450	NC_017860	AAAG	2	8	316172	316179	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1451	NC_017860	AAG	2	6	317535	317540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1452	NC_017860	AATA	2	8	318804	318811	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1453	NC_017860	ACA	2	6	318816	318821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1454	NC_017860	TCGT	2	8	318841	318848	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1455	NC_017860	AAC	2	6	318894	318899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1457	NC_017860	TTG	2	6	319474	319479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1472	NC_017860	AATA	2	8	320218	320225	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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