MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Prevotella intermedia 17 chromosome chromosome I

Total Repeats: 2715

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017860	GTT	2	6	151	156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017860	A	7	7	272	278	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017860	TAAAAA	2	12	300	311	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017860	ATA	2	6	330	335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017860	TAAC	2	8	339	346	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017860	ACT	2	6	433	438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017860	ACTT	2	8	453	460	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017860	CAC	2	6	514	519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_017860	GCAGGC	2	12	523	534	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017860	CA	3	6	564	569	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017860	TGC	2	6	600	605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017860	GAC	2	6	662	667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017860	CCA	2	6	674	679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_017860	GCA	2	6	809	814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017860	GAT	2	6	872	877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017860	AGGC	2	8	888	895	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017860	CAA	2	6	934	939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017860	GGC	2	6	1001	1006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017860	CAA	2	6	1030	1035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017860	CCCTCG	2	12	1083	1094	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_017860	GAA	3	9	1121	1129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017860	ACC	2	6	1229	1234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_017860	GTTA	2	8	1300	1307	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017860	ACA	3	9	1353	1361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017860	CAA	2	6	1378	1383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017860	CCA	2	6	1386	1391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_017860	GGT	2	6	1537	1542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017860	CAA	2	6	1762	1767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017860	GAC	2	6	1853	1858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017860	CTAT	2	8	1863	1870	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_017860	CTG	2	6	2064	2069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017860	AGT	2	6	2116	2121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017860	GGT	2	6	2131	2136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017860	AAG	2	6	2273	2278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017860	TAG	2	6	2387	2392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017860	T	7	7	2418	2424	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017860	TTGC	2	8	2454	2461	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017860	ACCACG	2	12	2500	2511	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017860	TCT	2	6	2541	2546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017860	AAT	2	6	2683	2688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017860	GTT	2	6	2702	2707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017860	CTT	2	6	2759	2764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017860	T	6	6	2763	2768	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017860	TAT	2	6	2779	2784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017860	ATTT	2	8	2805	2812	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017860	T	6	6	2834	2839	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017860	T	7	7	3274	3280	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017860	ATA	2	6	3298	3303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017860	CAAA	2	8	3320	3327	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017860	ATT	2	6	3337	3342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017860	GAT	2	6	3401	3406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017860	CTTA	2	8	3431	3438	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_017860	ATT	2	6	3446	3451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017860	AATA	2	8	3459	3466	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017860	T	6	6	3474	3479	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017860	TCTA	2	8	3499	3506	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017860	GTT	2	6	3530	3535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017860	TAT	2	6	3555	3560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017860	AT	3	6	3559	3564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017860	AGA	2	6	3565	3570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017860	A	6	6	3572	3577	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017860	GAT	2	6	4312	4317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017860	AGT	2	6	4318	4323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017860	ATG	2	6	4337	4342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017860	A	6	6	4551	4556	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017860	ATA	2	6	4560	4565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017860	ACT	2	6	4658	4663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017860	GAC	2	6	4674	4679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017860	GAAA	2	8	4721	4728	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017860	ACA	2	6	4731	4736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017860	CTC	2	6	7606	7611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_017860	GCA	2	6	7615	7620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017860	AAG	2	6	7683	7688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017860	GCA	2	6	7770	7775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017860	TAG	2	6	7835	7840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017860	TC	3	6	7942	7947	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_017860	ATA	2	6	7973	7978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017860	T	8	8	8008	8015	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017860	T	6	6	8023	8028	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017860	AAAAT	2	10	8124	8133	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017860	GAA	2	6	8292	8297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017860	T	6	6	8306	8311	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017860	TGC	2	6	8357	8362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017860	TATT	2	8	8441	8448	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017860	ATT	2	6	8453	8458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017860	AAAAT	2	10	8515	8524	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017860	CTTT	3	12	8550	8561	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_017860	TAA	2	6	9350	9355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017860	TA	4	8	9422	9429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017860	AGGC	2	8	9436	9443	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_017860	AAATA	2	10	17035	17044	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017860	AGA	2	6	18379	18384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017860	AC	3	6	18397	18402	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_017860	ACC	2	6	18423	18428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_017860	CAA	2	6	18439	18444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017860	A	7	7	18443	18449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017860	TTCG	2	8	18484	18491	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_017860	TCC	2	6	18502	18507	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_017860	GT	3	6	18508	18513	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017860	CAG	2	6	18558	18563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017860	ACG	2	6	18589	18594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017860	CCCT	2	8	18658	18665	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
103	NC_017860	AT	3	6	18739	18744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017860	AC	3	6	18958	18963	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_017860	ATT	2	6	19018	19023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017860	AGG	2	6	19156	19161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017860	ACA	2	6	19194	19199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017860	TA	3	6	19245	19250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017860	T	7	7	19289	19295	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017860	A	7	7	19305	19311	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017860	ATT	2	6	19347	19352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017860	AAAGA	2	10	19379	19388	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017860	ACAA	2	8	20543	20550	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_017860	AGC	2	6	20553	20558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017860	TA	3	6	22293	22298	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017860	TTAAAA	2	12	22301	22312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017860	GTT	2	6	23978	23983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017860	T	6	6	23992	23997	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017860	T	6	6	24016	24021	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017860	TTCT	2	8	24077	24084	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_017860	GTT	2	6	24085	24090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017860	TTG	3	9	24093	24101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017860	GTTCC	2	10	24121	24130	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
124	NC_017860	GTTA	2	8	26424	26431	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017860	TGTA	2	8	26462	26469	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017860	TGT	2	6	26476	26481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017860	TA	4	8	26486	26493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017860	GTG	2	6	26511	26516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017860	CCA	2	6	26530	26535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_017860	TGTT	2	8	30327	30334	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017860	ATTT	2	8	30369	30376	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017860	C	6	6	30596	30601	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
133	NC_017860	TTC	2	6	30672	30677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017860	GTT	2	6	30783	30788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017860	AGT	2	6	30807	30812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017860	AT	3	6	30834	30839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017860	TGT	2	6	31680	31685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017860	AATA	2	8	31827	31834	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017860	TTGC	2	8	31845	31852	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_017860	CTG	2	6	31898	31903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_017860	TCTTT	2	10	32712	32721	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_017860	T	6	6	33927	33932	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017860	CTGC	2	8	33968	33975	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
144	NC_017860	TGGG	2	8	34023	34030	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017860	TGT	2	6	34099	34104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017860	TTG	2	6	34214	34219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017860	ATTT	2	8	34220	34227	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017860	AGA	2	6	34237	34242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017860	GTA	2	6	34246	34251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017860	TAAA	2	8	34287	34294	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017860	T	6	6	34367	34372	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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