MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Pseudonocardia dioxanivorans CB1190 plasmid pPSED02

Total Repeats: 83

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017772	G	6	6	1	6	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017772	TGAGCA	2	12	20	31	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_017772	GTC	2	6	47	52	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017772	AAG	2	6	53	58	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017772	ACG	2	6	166	171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017772	GGC	2	6	172	177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017772	ACG	2	6	190	195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017772	ATG	2	6	196	201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017772	CGGAT	2	10	218	227	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_017772	CCG	2	6	263	268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_017772	CTG	2	6	570	575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017772	CAC	2	6	593	598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_017772	GCC	2	6	601	606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_017772	ACG	2	6	629	634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017772	CGGTC	2	10	681	690	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
16	NC_017772	GGCGA	2	10	756	765	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
17	NC_017772	GGT	2	6	1243	1248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017772	GTG	2	6	1311	1316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017772	CG	3	6	1352	1357	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_017772	CG	3	6	1433	1438	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017772	GCG	2	6	1446	1451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017772	CGC	2	6	1507	1512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_017772	GCC	2	6	1526	1531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_017772	CCG	2	6	1555	1560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_017772	GCC	2	6	1652	1657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_017772	CGG	2	6	1712	1717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017772	GTC	2	6	2338	2343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017772	GTC	2	6	2350	2355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017772	TAG	2	6	2446	2451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017772	GGGA	2	8	2458	2465	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017772	AGC	2	6	2488	2493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017772	ACC	2	6	2497	2502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_017772	AGG	2	6	2503	2508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017772	GGC	2	6	4332	4337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017772	CGT	2	6	4340	4345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017772	CGG	2	6	4348	4353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017772	CCG	2	6	4377	4382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_017772	G	7	7	4543	4549	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017772	CGC	2	6	4556	4561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_017772	CGG	2	6	4565	4570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017772	GCCT	2	8	4606	4613	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017772	CCGT	2	8	4638	4645	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_017772	GC	3	6	4678	4683	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_017772	CAG	2	6	4701	4706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017772	GCT	2	6	4709	4714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017772	TCGAC	2	10	4730	4739	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
47	NC_017772	CGA	2	6	4761	4766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017772	CGG	2	6	4790	4795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017772	GCG	2	6	4796	4801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017772	GCGT	2	8	4824	4831	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017772	GCA	2	6	4832	4837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017772	GCCCG	2	10	4955	4964	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
53	NC_017772	TGG	2	6	5235	5240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017772	CGG	2	6	6694	6699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017772	GCC	2	6	6712	6717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_017772	GC	3	6	6753	6758	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_017772	CGG	2	6	6780	6785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017772	CGC	2	6	6831	6836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_017772	CAG	2	6	6850	6855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017772	CGG	2	6	6872	6877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017772	CTG	2	6	6895	6900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017772	GTC	2	6	6911	6916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017772	CGC	2	6	6941	6946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_017772	CGT	2	6	6984	6989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017772	GCG	2	6	7028	7033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017772	GAC	2	6	7046	7051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017772	GCGG	2	8	10683	10690	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
68	NC_017772	ACT	2	6	11609	11614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017772	GTT	2	6	11625	11630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017772	TGA	2	6	11706	11711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017772	CG	3	6	11736	11741	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_017772	GGA	2	6	11778	11783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017772	CAG	2	6	11808	11813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017772	GAACG	2	10	11818	11827	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
75	NC_017772	CGTC	2	8	11835	11842	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_017772	CCCGC	2	10	11876	11885	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
77	NC_017772	CAGC	2	8	11903	11910	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_017772	TCC	2	6	22720	22725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_017772	TGC	2	6	24238	24243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017772	CTG	2	6	24282	24287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017772	CGG	2	6	24311	24316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017772	CCGG	2	8	24328	24335	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_017772	CGC	2	6	24339	24344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.