MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Pantoea ananatis PA13 chromosome

Total Repeats: 12847

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017554	CTTT	2	8	18	25	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017554	GGTGC	2	10	2684	2693	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3	NC_017554	GACA	2	8	6278	6285	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017554	T	9	9	6307	6315	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017554	CTGC	2	8	6327	6334	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017554	CG	3	6	7335	7340	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_017554	A	6	6	9104	9109	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017554	TGT	2	6	9133	9138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017554	GCC	2	6	9172	9177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_017554	TGG	2	6	9213	9218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017554	T	8	8	9731	9738	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017554	ACTG	2	8	9787	9794	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017554	A	6	6	9795	9800	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017554	ATA	2	6	10794	10799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017554	CCCGG	2	10	10810	10819	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
16	NC_017554	T	7	7	10852	10858	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017554	TGG	2	6	10874	10879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017554	CGG	2	6	10899	10904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017554	ATT	2	6	10918	10923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017554	T	6	6	10922	10927	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017554	GAG	2	6	10930	10935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017554	CTG	2	6	10954	10959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017554	CGT	2	6	10963	10968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017554	TAA	2	6	10969	10974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017554	AAT	2	6	11021	11026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017554	TG	3	6	11036	11041	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017554	CATG	2	8	11075	11082	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017554	TCA	2	6	11113	11118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017554	TCA	2	6	11151	11156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017554	CA	3	6	11167	11172	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_017554	ATTT	2	8	11180	11187	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017554	ACG	2	6	11260	11265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017554	AAT	2	6	14653	14658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017554	ACC	2	6	14665	14670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_017554	CGG	2	6	14685	14690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017554	ACGCTT	2	12	15747	15758	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017554	CTC	2	6	17046	17051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_017554	CAAAG	2	10	18846	18855	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_017554	ACA	2	6	19994	19999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017554	TTA	2	6	21092	21097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017554	A	6	6	21111	21116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017554	TCA	2	6	21840	21845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017554	TAG	2	6	22541	22546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017554	TCC	2	6	22553	22558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_017554	CG	3	6	23405	23410	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_017554	A	6	6	23413	23418	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017554	TTACC	2	10	24795	24804	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
48	NC_017554	TC	3	6	24846	24851	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017554	TAA	2	6	24918	24923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017554	TGG	2	6	24935	24940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017554	CTG	2	6	24946	24951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017554	ATC	2	6	27138	27143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017554	T	6	6	27165	27170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017554	TCT	2	6	27192	27197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017554	TTTA	2	8	27249	27256	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017554	ATG	2	6	27266	27271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017554	TATCA	2	10	27314	27323	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_017554	AGG	2	6	27354	27359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017554	CGA	2	6	30430	30435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017554	A	7	7	30742	30748	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017554	A	6	6	30774	30779	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017554	ATA	2	6	30794	30799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017554	TCA	2	6	30820	30825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017554	AC	3	6	30862	30867	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017554	CAT	2	6	30886	30891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017554	CAA	2	6	32359	32364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017554	TGT	2	6	32432	32437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017554	GTC	2	6	32446	32451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017554	GCCAG	2	10	32508	32517	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
70	NC_017554	TGT	2	6	32648	32653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017554	GGC	2	6	35878	35883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017554	GACGG	2	10	35901	35910	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
73	NC_017554	TAA	2	6	37400	37405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017554	TGA	2	6	37443	37448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017554	AGA	2	6	37522	37527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017554	A	9	9	37555	37563	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017554	TTA	2	6	37889	37894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017554	CTAT	2	8	37933	37940	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017554	TGC	2	6	37957	37962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017554	GAA	2	6	37985	37990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017554	ATTG	2	8	38101	38108	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017554	GTG	2	6	38110	38115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017554	ACA	2	6	38133	38138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017554	GCC	2	6	38142	38147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_017554	ATA	2	6	38390	38395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017554	GCA	2	6	38488	38493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017554	ACT	2	6	38532	38537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017554	TAAGA	2	10	38599	38608	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017554	AAT	2	6	38609	38614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017554	T	6	6	38614	38619	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017554	CAA	2	6	38684	38689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017554	A	8	8	38688	38695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017554	CT	3	6	38697	38702	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_017554	TC	3	6	38753	38758	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_017554	TAT	2	6	38789	38794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017554	GAT	2	6	38809	38814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017554	CAA	2	6	38827	38832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017554	TAA	2	6	38882	38887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017554	TGCGC	2	10	38984	38993	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
100	NC_017554	GAG	2	6	38998	39003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017554	AT	3	6	39020	39025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017554	AATT	2	8	39113	39120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017554	TAA	2	6	39167	39172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017554	T	6	6	39358	39363	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017554	T	6	6	39414	39419	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017554	A	7	7	39423	39429	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017554	CTT	2	6	40458	40463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017554	CCA	2	6	40471	40476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_017554	CAGCAT	2	12	45513	45524	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017554	ATG	2	6	46573	46578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017554	TCT	2	6	46582	46587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017554	GAC	2	6	46627	46632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017554	AATA	2	8	46637	46644	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017554	TAA	2	6	46673	46678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017554	AAAC	2	8	46728	46735	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_017554	TACC	2	8	46791	46798	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_017554	CTT	2	6	46813	46818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017554	CA	3	6	46829	46834	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_017554	ATT	2	6	47980	47985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017554	T	6	6	47987	47992	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017554	ATT	2	6	48161	48166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017554	TAT	2	6	48169	48174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017554	AAT	2	6	48186	48191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017554	TTA	2	6	48205	48210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017554	TTA	2	6	48221	48226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017554	TAA	2	6	48230	48235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017554	T	7	7	48972	48978	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017554	CAG	2	6	49013	49018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017554	ATG	2	6	49050	49055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017554	CAC	2	6	50329	50334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_017554	CTG	2	6	54162	54167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017554	T	6	6	54201	54206	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017554	T	7	7	54304	54310	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017554	AATA	2	8	54325	54332	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017554	TG	3	6	54347	54352	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017554	GC	3	6	54368	54373	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_017554	CAA	2	6	57239	57244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017554	TC	3	6	57269	57274	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_017554	CAA	2	6	57285	57290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_017554	TCA	2	6	57325	57330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_017554	CG	3	6	57395	57400	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_017554	CAC	2	6	57464	57469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_017554	TCT	2	6	57478	57483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_017554	A	6	6	58773	58778	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017554	TGA	2	6	58804	58809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017554	TC	3	6	60397	60402	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_017554	GGC	2	6	62313	62318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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290	NC_017554	ATG	2	6	101274	101279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
291	NC_017554	TGAAAT	2	12	101307	101318	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
292	NC_017554	TAC	2	6	101372	101377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
293	NC_017554	ACC	2	6	101469	101474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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322	NC_017554	GAA	2	6	106198	106203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
323	NC_017554	CTGG	2	8	109006	109013	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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335	NC_017554	A	7	7	110176	110182	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
336	NC_017554	T	6	6	110222	110227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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376	NC_017554	A	7	7	125490	125496	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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406	NC_017554	AAAG	2	8	135643	135650	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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409	NC_017554	CGAT	2	8	136838	136845	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
410	NC_017554	GAAC	2	8	136859	136866	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
411	NC_017554	T	6	6	136886	136891	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
412	NC_017554	TGA	2	6	137062	137067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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414	NC_017554	CAT	2	6	137170	137175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
415	NC_017554	A	6	6	137198	137203	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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418	NC_017554	T	6	6	137564	137569	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
419	NC_017554	ATT	2	6	137574	137579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
420	NC_017554	GTGA	2	8	137592	137599	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
421	NC_017554	TTA	2	6	137617	137622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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423	NC_017554	T	6	6	137701	137706	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
424	NC_017554	AAT	2	6	137755	137760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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429	NC_017554	ATA	2	6	137983	137988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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431	NC_017554	TCTG	2	8	138073	138080	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
432	NC_017554	CAG	2	6	138120	138125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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434	NC_017554	T	6	6	138137	138142	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
435	NC_017554	AGC	2	6	138161	138166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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439	NC_017554	ATC	3	9	138296	138304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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450	NC_017554	GAA	2	6	146798	146803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
451	NC_017554	GCG	2	6	147612	147617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
452	NC_017554	TAC	2	6	147620	147625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
453	NC_017554	GGC	2	6	147711	147716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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457	NC_017554	A	6	6	151623	151628	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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460	NC_017554	ATA	2	6	154931	154936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
461	NC_017554	ATT	2	6	154999	155004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
462	NC_017554	T	7	7	155022	155028	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
463	NC_017554	ATTT	2	8	155061	155068	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
464	NC_017554	T	6	6	155066	155071	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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466	NC_017554	T	7	7	158476	158482	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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476	NC_017554	TTA	2	6	170970	170975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_017554	TCA	2	6	179626	179631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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