MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Paenibacillus polymyxa M1 plasmid pPPM1a

Total Repeats: 2388

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017543	ATT	2	6	3	8	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017543	AGC	2	6	148	153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017543	ATCAAT	2	12	279	290	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_017543	GCA	2	6	407	412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017543	A	7	7	445	451	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017543	A	7	7	464	470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017543	CAG	2	6	541	546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017543	AT	3	6	573	578	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017543	A	7	7	586	592	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017543	AGT	2	6	626	631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017543	TAAG	2	8	642	649	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017543	CAC	2	6	704	709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_017543	TAA	2	6	720	725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017543	TAC	2	6	758	763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017543	CTC	2	6	780	785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_017543	TCC	2	6	835	840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_017543	ATT	2	6	842	847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017543	AATC	2	8	1780	1787	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017543	AGG	2	6	1833	1838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017543	TTC	2	6	1856	1861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017543	CTT	2	6	1872	1877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017543	A	6	6	1953	1958	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017543	CCT	2	6	2030	2035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_017543	CAA	2	6	2089	2094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017543	TCT	2	6	2112	2117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017543	TTC	2	6	2233	2238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017543	TCG	2	6	3322	3327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017543	TCC	2	6	3350	3355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_017543	ATG	2	6	3390	3395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017543	TAT	2	6	3489	3494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017543	CTT	2	6	3497	3502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017543	GTCC	2	8	3517	3524	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_017543	TGT	2	6	3805	3810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017543	TCC	2	6	4649	4654	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_017543	CTC	2	6	4669	4674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_017543	A	7	7	4715	4721	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017543	ACTG	2	8	4727	4734	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017543	ATG	2	6	4777	4782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017543	CTT	2	6	4840	4845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017543	GTA	2	6	4864	4869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017543	GTT	2	6	4907	4912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017543	TCT	2	6	4979	4984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017543	T	6	6	5763	5768	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017543	T	6	6	5851	5856	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017543	CCCA	2	8	5860	5867	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
46	NC_017543	TTGT	2	8	5916	5923	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017543	CAA	2	6	6452	6457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017543	CTT	2	6	6509	6514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017543	TGC	3	9	6519	6527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017543	ACC	2	6	7128	7133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_017543	TAC	2	6	7144	7149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017543	TACT	2	8	7198	7205	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_017543	CCT	2	6	8235	8240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_017543	CAC	2	6	9048	9053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_017543	CAA	2	6	9133	9138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017543	TGT	2	6	9168	9173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017543	TTC	2	6	9215	9220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017543	ATA	2	6	9292	9297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017543	GAAA	2	8	9345	9352	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017543	CAT	2	6	9355	9360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017543	TTTC	2	8	9371	9378	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_017543	CTTG	2	8	9633	9640	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_017543	TCT	2	6	9659	9664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017543	CTT	2	6	9738	9743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017543	ATTAT	2	10	10073	10082	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017543	TTAAA	2	10	10094	10103	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017543	ACTC	2	8	10123	10130	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_017543	ATT	2	6	10481	10486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017543	AAT	2	6	10496	10501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017543	TA	3	6	10558	10563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017543	AAAT	2	8	10570	10577	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017543	TGT	2	6	10614	10619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017543	ATT	2	6	11434	11439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017543	CGA	2	6	11457	11462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017543	AG	3	6	11529	11534	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017543	TACT	2	8	11639	11646	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017543	ATC	2	6	11661	11666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017543	TCT	2	6	11707	11712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017543	TA	3	6	11720	11725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017543	CTT	2	6	11734	11739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017543	ATGT	2	8	11751	11758	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017543	CTT	2	6	11770	11775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017543	TCA	2	6	11811	11816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017543	CTTT	2	8	11825	11832	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_017543	ACA	2	6	11842	11847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017543	AGAGA	2	10	11850	11859	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017543	A	6	6	11879	11884	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017543	A	7	7	11886	11892	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017543	ATA	2	6	11965	11970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017543	TGTT	2	8	12003	12010	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017543	AT	4	8	12027	12034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017543	GTA	2	6	12057	12062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017543	AAC	2	6	12131	12136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017543	A	7	7	12215	12221	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017543	GCT	2	6	12265	12270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017543	AT	3	6	12303	12308	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017543	ATT	2	6	12376	12381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017543	TAT	2	6	12384	12389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017543	CAT	2	6	13042	13047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017543	T	7	7	13061	13067	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017543	GCGA	2	8	13263	13270	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_017543	T	6	6	13273	13278	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017543	CAG	2	6	13287	13292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017543	GAT	2	6	13346	13351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017543	TTG	2	6	13444	13449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017543	A	8	8	13456	13463	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017543	AAT	2	6	13473	13478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017543	GTT	2	6	13583	13588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017543	TA	3	6	13593	13598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017543	TTAAT	2	10	13607	13616	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017543	CATA	2	8	13644	13651	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_017543	TG	3	6	13682	13687	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017543	ATAAA	2	10	13699	13708	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017543	CAA	2	6	13710	13715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017543	AAG	2	6	13731	13736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017543	CATA	2	8	13996	14003	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_017543	GAT	2	6	14009	14014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017543	AGA	2	6	14072	14077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017543	T	6	6	14158	14163	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017543	AGTT	2	8	14182	14189	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017543	ATTT	2	8	14247	14254	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017543	ACA	2	6	15269	15274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017543	TAT	2	6	15323	15328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017543	TTCA	2	8	15349	15356	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_017543	A	6	6	15366	15371	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017543	GTG	2	6	15372	15377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017543	ATTTT	2	10	15464	15473	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017543	ACA	2	6	15474	15479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017543	AGC	2	6	15516	15521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017543	A	7	7	15552	15558	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017543	GATA	2	8	15590	15597	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017543	ATG	2	6	15610	15615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017543	AT	3	6	15616	15621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017543	CTA	2	6	15622	15627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017543	A	7	7	20123	20129	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017543	ATT	2	6	20175	20180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017543	CAA	2	6	20189	20194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017543	CCT	2	6	20257	20262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_017543	A	6	6	20309	20314	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017543	A	6	6	20316	20321	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017543	TAAA	2	8	20388	20395	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017543	ATT	3	9	20433	20441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017543	CTC	2	6	21200	21205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
144	NC_017543	ACT	2	6	21240	21245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_017543	CA	3	6	21336	21341	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_017543	GCA	2	6	21344	21349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_017543	TCCTC	2	10	22725	22734	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
148	NC_017543	TTAAA	2	10	22749	22758	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017543	TTG	2	6	22808	22813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017543	CAT	2	6	22894	22899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_017543	ACC	2	6	22952	22957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
152	NC_017543	AT	3	6	22977	22982	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017543	TAAA	2	8	22994	23001	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017543	AAAAC	2	10	23004	23013	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
155	NC_017543	GTT	2	6	23025	23030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
156	NC_017543	AT	3	6	23037	23042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_017543	AAAT	2	8	23076	23083	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_017543	CGC	2	6	23086	23091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
159	NC_017543	TCA	2	6	23096	23101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_017543	ATTC	2	8	23119	23126	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
161	NC_017543	A	6	6	23803	23808	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_017543	T	7	7	23832	23838	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_017543	TCAA	2	8	23851	23858	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
164	NC_017543	TACA	2	8	23884	23891	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
165	NC_017543	ATA	2	6	23893	23898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_017543	CAG	2	6	23938	23943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
167	NC_017543	TTC	2	6	23944	23949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
168	NC_017543	AACC	2	8	23996	24003	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
169	NC_017543	GAA	2	6	24122	24127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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171	NC_017543	GGTG	2	8	24291	24298	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
172	NC_017543	CTT	2	6	24299	24304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
173	NC_017543	ATG	2	6	24421	24426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
174	NC_017543	TCG	2	6	24477	24482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
175	NC_017543	ATAG	2	8	24496	24503	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
176	NC_017543	CTT	2	6	24910	24915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
177	NC_017543	TCC	2	6	25265	25270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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179	NC_017543	TAT	2	6	25333	25338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
180	NC_017543	CTTA	2	8	25348	25355	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
181	NC_017543	GTTAC	2	10	26096	26105	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
182	NC_017543	T	6	6	26141	26146	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_017543	ATT	2	6	26175	26180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_017543	GA	3	6	26215	26220	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
185	NC_017543	GTTA	2	8	26252	26259	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
186	NC_017543	GACT	2	8	26277	26284	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
187	NC_017543	CAA	2	6	26337	26342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
188	NC_017543	A	6	6	26341	26346	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_017543	TTG	2	6	26347	26352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
190	NC_017543	C	8	8	26436	26443	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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194	NC_017543	TCC	2	6	27978	27983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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197	NC_017543	T	7	7	28126	28132	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
198	NC_017543	TCA	2	6	28142	28147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
199	NC_017543	TTA	2	6	28167	28172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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202	NC_017543	CAT	2	6	28233	28238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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285	NC_017543	CATG	2	8	34398	34405	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
286	NC_017543	AT	3	6	34491	34496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
287	NC_017543	AAC	2	6	34535	34540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
288	NC_017543	T	6	6	34554	34559	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_017543	TAA	2	6	34571	34576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_017543	A	7	7	34575	34581	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_017543	TTA	2	6	34615	34620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_017543	GCT	2	6	34665	34670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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294	NC_017543	CAG	2	6	35323	35328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
295	NC_017543	TTA	2	6	35442	35447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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313	NC_017543	TA	3	6	36341	36346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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