MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Pseudomonas putida BIRD-1 chromosome

Total Repeats: 13278

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017530	AC	3	6	1356120	1356125	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3002	NC_017530	AC	3	6	1356289	1356294	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3003	NC_017530	G	6	6	1356348	1356353	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_017530	CCT	2	6	1356430	1356435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3005	NC_017530	CGA	2	6	1356440	1356445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3006	NC_017530	CTG	2	6	1356453	1356458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3007	NC_017530	GATA	2	8	1356590	1356597	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_017530	CTG	2	6	1356618	1356623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3009	NC_017530	GTC	2	6	1356691	1356696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3010	NC_017530	GAA	2	6	1356738	1356743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_017530	CAGC	2	8	1356859	1356866	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3012	NC_017530	TAG	2	6	1356969	1356974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_017530	GCGA	2	8	1356977	1356984	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3014	NC_017530	G	6	6	1357126	1357131	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_017530	TCC	2	6	1357136	1357141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3016	NC_017530	TAC	2	6	1357151	1357156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3017	NC_017530	TGAC	2	8	1357157	1357164	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3018	NC_017530	ACTG	2	8	1357438	1357445	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3019	NC_017530	ACCGA	2	10	1357450	1357459	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3020	NC_017530	AC	3	6	1357663	1357668	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3021	NC_017530	CGTC	2	8	1357681	1357688	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3022	NC_017530	AAC	2	6	1357700	1357705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3023	NC_017530	AGG	2	6	1357774	1357779	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_017530	AGC	2	6	1357790	1357795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3025	NC_017530	AAAG	2	8	1357804	1357811	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_017530	AGTCG	2	10	1357826	1357835	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3027	NC_017530	ATC	2	6	1357887	1357892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3029	NC_017530	GTTG	2	8	1358171	1358178	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_017530	GGT	2	6	1358190	1358195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_017530	TGA	2	6	1358239	1358244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_017530	CGA	2	6	1358260	1358265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3033	NC_017530	GGT	2	6	1358340	1358345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_017530	GA	3	6	1358370	1358375	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_017530	TTA	2	6	1358496	1358501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_017530	CGG	2	6	1358620	1358625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3037	NC_017530	GGC	2	6	1358701	1358706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3038	NC_017530	TGAAAT	2	12	1358729	1358740	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_017530	ACC	2	6	1358891	1358896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3040	NC_017530	TGG	2	6	1358951	1358956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_017530	TCC	2	6	1358977	1358982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3042	NC_017530	GGA	2	6	1358994	1358999	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_017530	GC	3	6	1359055	1359060	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3044	NC_017530	GGT	2	6	1359114	1359119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_017530	CGG	2	6	1359201	1359206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3046	NC_017530	TCA	2	6	1359229	1359234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3047	NC_017530	CGT	2	6	1359309	1359314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3048	NC_017530	GCT	2	6	1359363	1359368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3049	NC_017530	ACG	2	6	1359544	1359549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3050	NC_017530	GT	3	6	1359562	1359567	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_017530	TGG	2	6	1359654	1359659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_017530	GAC	2	6	1359768	1359773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3053	NC_017530	ACC	2	6	1359788	1359793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3054	NC_017530	ATCCC	2	10	1359796	1359805	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
3055	NC_017530	AGT	2	6	1359812	1359817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_017530	A	6	6	1359937	1359942	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_017530	GCA	2	6	1360046	1360051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3058	NC_017530	C	7	7	1360071	1360077	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3059	NC_017530	TGC	2	6	1360138	1360143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3060	NC_017530	AGCA	2	8	1360179	1360186	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3061	NC_017530	GAC	2	6	1361837	1361842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3062	NC_017530	GGC	2	6	1361856	1361861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3063	NC_017530	GTG	2	6	1361899	1361904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_017530	TG	3	6	1363950	1363955	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_017530	AAC	2	6	1364031	1364036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3066	NC_017530	GCC	2	6	1364049	1364054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3067	NC_017530	CG	3	6	1367113	1367118	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3068	NC_017530	CG	3	6	1367125	1367130	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3069	NC_017530	CA	3	6	1367163	1367168	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3070	NC_017530	GCGCA	2	10	1367780	1367789	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3071	NC_017530	ATT	2	6	1367804	1367809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_017530	CTG	2	6	1367848	1367853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3073	NC_017530	GCA	2	6	1367868	1367873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3074	NC_017530	CGC	2	6	1368569	1368574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3075	NC_017530	CGT	2	6	1371618	1371623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3076	NC_017530	ATGA	2	8	1372576	1372583	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_017530	GCC	2	6	1373537	1373542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3078	NC_017530	CGG	3	9	1375393	1375401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3079	NC_017530	GTC	2	6	1375415	1375420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3080	NC_017530	TAT	2	6	1376428	1376433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_017530	GTGTGG	2	12	1376452	1376463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3083	NC_017530	TTG	2	6	1378193	1378198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_017530	GTT	2	6	1378202	1378207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_017530	ATT	2	6	1378232	1378237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_017530	GGT	2	6	1378241	1378246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_017530	TG	3	6	1378249	1378254	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_017530	GGC	2	6	1378271	1378276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3089	NC_017530	GGCC	2	8	1378355	1378362	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3090	NC_017530	CCG	2	6	1378381	1378386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3091	NC_017530	CCG	2	6	1378397	1378402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3092	NC_017530	TGG	2	6	1378444	1378449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_017530	GGT	2	6	1378459	1378464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_017530	CGT	2	6	1378476	1378481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3095	NC_017530	GGCC	2	8	1378507	1378514	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3096	NC_017530	CTG	2	6	1378515	1378520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3097	NC_017530	CGC	2	6	1378534	1378539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3098	NC_017530	CCG	2	6	1378549	1378554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3099	NC_017530	GATG	2	8	1380017	1380024	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_017530	TTG	2	6	1380047	1380052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_017530	ATT	2	6	1380086	1380091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_017530	GAG	2	6	1380101	1380106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_017530	TAC	2	6	1380195	1380200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3104	NC_017530	CACG	2	8	1380219	1380226	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3105	NC_017530	CAAAT	2	10	1380316	1380325	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3106	NC_017530	CCT	2	6	1380436	1380441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3107	NC_017530	A	7	7	1380530	1380536	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_017530	GT	3	6	1382063	1382068	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_017530	T	6	6	1382085	1382090	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_017530	GCGT	2	8	1382101	1382108	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3111	NC_017530	CTT	2	6	1382128	1382133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3112	NC_017530	TGT	2	6	1382164	1382169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_017530	CAT	2	6	1382191	1382196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3114	NC_017530	GCCA	2	8	1382258	1382265	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3115	NC_017530	T	6	6	1382413	1382418	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_017530	CG	3	6	1382499	1382504	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3117	NC_017530	TG	4	8	1385781	1385788	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_017530	TGG	2	6	1385907	1385912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_017530	T	7	7	1385980	1385986	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_017530	A	6	6	1386006	1386011	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_017530	GCC	2	6	1386073	1386078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3122	NC_017530	CG	3	6	1386079	1386084	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3123	NC_017530	CCCA	2	8	1386103	1386110	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3124	NC_017530	AAC	2	6	1386151	1386156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3125	NC_017530	GTG	2	6	1389135	1389140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_017530	GCA	2	6	1389153	1389158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3127	NC_017530	GT	3	6	1389167	1389172	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_017530	GTG	2	6	1389251	1389256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_017530	AAG	2	6	1389318	1389323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3131	NC_017530	GTTC	2	8	1390240	1390247	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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3395	NC_017530	GAT	2	6	1514355	1514360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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