MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Pseudomonas putida BIRD-1 chromosome

Total Repeats: 13278

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_017530	CGC	2	6	5309640	5309645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12502	NC_017530	CCGCC	2	10	5309646	5309655	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
12503	NC_017530	T	6	6	5311403	5311408	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12504	NC_017530	TGC	2	6	5311505	5311510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12505	NC_017530	CG	3	6	5311984	5311989	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12506	NC_017530	ACAGC	2	10	5312103	5312112	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
12507	NC_017530	GGC	2	6	5312601	5312606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12508	NC_017530	CTT	2	6	5315147	5315152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12509	NC_017530	AT	3	6	5315179	5315184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12510	NC_017530	G	6	6	5315193	5315198	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12511	NC_017530	GAA	2	6	5315223	5315228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12512	NC_017530	TCA	2	6	5315364	5315369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12513	NC_017530	ATG	2	6	5317211	5317216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12514	NC_017530	TCG	2	6	5317254	5317259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12515	NC_017530	CGG	2	6	5317290	5317295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12516	NC_017530	GCA	2	6	5317371	5317376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12517	NC_017530	GCTC	2	8	5317408	5317415	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12518	NC_017530	GCG	2	6	5318903	5318908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12519	NC_017530	ACG	2	6	5318951	5318956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12520	NC_017530	GCC	2	6	5319003	5319008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12521	NC_017530	TTG	2	6	5319015	5319020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12522	NC_017530	TGCC	2	8	5319967	5319974	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12523	NC_017530	AG	3	6	5321108	5321113	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12524	NC_017530	ATCG	2	8	5321169	5321176	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12525	NC_017530	TCC	2	6	5321249	5321254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12526	NC_017530	CCCG	2	8	5322030	5322037	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
12527	NC_017530	GCCCA	2	10	5322199	5322208	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
12528	NC_017530	TC	3	6	5322248	5322253	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12529	NC_017530	GCT	2	6	5324125	5324130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12530	NC_017530	TTCC	2	8	5324832	5324839	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12531	NC_017530	GAA	2	6	5325462	5325467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12532	NC_017530	A	6	6	5325474	5325479	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12533	NC_017530	TAG	2	6	5325546	5325551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12534	NC_017530	CA	3	6	5327616	5327621	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12535	NC_017530	GCA	2	6	5327721	5327726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12536	NC_017530	CCTGC	2	10	5327773	5327782	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
12537	NC_017530	CGC	2	6	5327813	5327818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12538	NC_017530	CAC	2	6	5329261	5329266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12539	NC_017530	TC	3	6	5329369	5329374	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12540	NC_017530	CCT	2	6	5330742	5330747	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12541	NC_017530	TGT	2	6	5330765	5330770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12542	NC_017530	TGA	2	6	5330776	5330781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12543	NC_017530	CCG	2	6	5330860	5330865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12544	NC_017530	CTG	2	6	5330869	5330874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12545	NC_017530	ACC	2	6	5330913	5330918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12546	NC_017530	GCG	2	6	5339741	5339746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12547	NC_017530	TCG	2	6	5339760	5339765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12548	NC_017530	ATCACC	2	12	5339766	5339777	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
12549	NC_017530	GTT	2	6	5339785	5339790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12550	NC_017530	AGC	2	6	5339849	5339854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12551	NC_017530	TTTC	2	8	5339988	5339995	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12552	NC_017530	GCC	2	6	5340014	5340019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12553	NC_017530	C	6	6	5340027	5340032	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12554	NC_017530	ATG	2	6	5341020	5341025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12556	NC_017530	GCC	2	6	5343158	5343163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12557	NC_017530	GAG	2	6	5343187	5343192	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12558	NC_017530	CAC	2	6	5346040	5346045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12559	NC_017530	C	7	7	5346132	5346138	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12560	NC_017530	C	6	6	5346152	5346157	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12561	NC_017530	CCG	2	6	5346234	5346239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12562	NC_017530	GTC	2	6	5346250	5346255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12563	NC_017530	GGGC	2	8	5348245	5348252	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12564	NC_017530	TCCC	2	8	5348275	5348282	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
12565	NC_017530	TCA	2	6	5348304	5348309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12566	NC_017530	GA	3	6	5348316	5348321	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12567	NC_017530	GTC	2	6	5348852	5348857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12568	NC_017530	GCA	2	6	5348867	5348872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12569	NC_017530	CACC	2	8	5348927	5348934	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
12570	NC_017530	CGT	2	6	5348968	5348973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12571	NC_017530	GGC	2	6	5350669	5350674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12572	NC_017530	GCT	2	6	5353302	5353307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12573	NC_017530	GTG	2	6	5353942	5353947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12574	NC_017530	CTCATG	2	12	5355251	5355262	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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12576	NC_017530	GAA	2	6	5355310	5355315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12577	NC_017530	GTC	2	6	5355337	5355342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12581	NC_017530	T	7	7	5360581	5360587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12595	NC_017530	TC	3	6	5368966	5368971	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12596	NC_017530	CTCG	2	8	5368973	5368980	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12597	NC_017530	GTG	2	6	5370997	5371002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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12602	NC_017530	TTG	2	6	5373741	5373746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12603	NC_017530	GGCCA	2	10	5373760	5373769	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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12607	NC_017530	CAG	2	6	5378369	5378374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12611	NC_017530	CGC	2	6	5380021	5380026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12612	NC_017530	GCT	2	6	5383513	5383518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12613	NC_017530	GCCC	2	8	5383540	5383547	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
12614	NC_017530	GCC	2	6	5383605	5383610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12615	NC_017530	TAC	2	6	5385164	5385169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12622	NC_017530	AC	3	6	5386998	5387003	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12623	NC_017530	TGTA	2	8	5387011	5387018	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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12626	NC_017530	G	8	8	5387076	5387083	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12627	NC_017530	AGCG	2	8	5387087	5387094	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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