MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Pseudomonas putida BIRD-1 chromosome

Total Repeats: 13278

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_017530	CAT	2	6	3329341	3329346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8002	NC_017530	A	6	6	3329357	3329362	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8003	NC_017530	TCAT	2	8	3329383	3329390	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8004	NC_017530	TCAA	2	8	3329415	3329422	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8005	NC_017530	AATG	2	8	3331556	3331563	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8006	NC_017530	CACTC	2	10	3332095	3332104	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
8007	NC_017530	GAA	2	6	3332147	3332152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8008	NC_017530	GCGT	2	8	3333126	3333133	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8009	NC_017530	GC	3	6	3333158	3333163	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8010	NC_017530	T	8	8	3334096	3334103	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8011	NC_017530	TGC	2	6	3334117	3334122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8012	NC_017530	CAT	2	6	3334133	3334138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8013	NC_017530	CAA	2	6	3336631	3336636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8014	NC_017530	ATCC	2	8	3338222	3338229	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8015	NC_017530	ACA	3	9	3338234	3338242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8016	NC_017530	AAC	2	6	3340655	3340660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8017	NC_017530	GCC	2	6	3341084	3341089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8018	NC_017530	T	6	6	3341217	3341222	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8019	NC_017530	ACCGAG	2	12	3341352	3341363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8020	NC_017530	GCA	2	6	3341401	3341406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8021	NC_017530	CGG	2	6	3341448	3341453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8022	NC_017530	GGCT	2	8	3344608	3344615	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8023	NC_017530	CG	3	6	3344631	3344636	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8024	NC_017530	C	6	6	3345594	3345599	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8025	NC_017530	GCC	2	6	3345671	3345676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8026	NC_017530	CCATG	2	10	3345677	3345686	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
8027	NC_017530	GAG	2	6	3345712	3345717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8028	NC_017530	CAA	2	6	3345764	3345769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8029	NC_017530	TCG	2	6	3345861	3345866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8030	NC_017530	AGGA	2	8	3348560	3348567	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8031	NC_017530	CAG	2	6	3349538	3349543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8032	NC_017530	CAGC	2	8	3349546	3349553	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8033	NC_017530	CAC	2	6	3352463	3352468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8034	NC_017530	AGG	2	6	3352786	3352791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8035	NC_017530	GGCCG	2	10	3352811	3352820	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
8036	NC_017530	TCA	2	6	3352821	3352826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8037	NC_017530	CTT	2	6	3352908	3352913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8038	NC_017530	GGA	2	6	3352919	3352924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8039	NC_017530	GCGGA	2	10	3352952	3352961	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
8040	NC_017530	GCA	2	6	3354879	3354884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8041	NC_017530	GCA	2	6	3354941	3354946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8042	NC_017530	AGGC	2	8	3354956	3354963	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8043	NC_017530	T	9	9	3356768	3356776	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8044	NC_017530	GT	3	6	3356797	3356802	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8045	NC_017530	CCCGA	2	10	3356817	3356826	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
8046	NC_017530	CAA	2	6	3356831	3356836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8047	NC_017530	GATG	2	8	3356883	3356890	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8048	NC_017530	GCGG	2	8	3356912	3356919	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8049	NC_017530	CA	3	6	3360041	3360046	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8050	NC_017530	GCC	2	6	3360069	3360074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8051	NC_017530	GGC	2	6	3360094	3360099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8052	NC_017530	TGC	2	6	3360104	3360109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8053	NC_017530	TGG	2	6	3360112	3360117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8054	NC_017530	GTA	2	6	3360136	3360141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8056	NC_017530	CCG	2	6	3362955	3362960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8057	NC_017530	GCC	2	6	3362973	3362978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8058	NC_017530	GGT	2	6	3363017	3363022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8059	NC_017530	GGT	2	6	3363034	3363039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8060	NC_017530	CGT	2	6	3363051	3363056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8061	NC_017530	CTG	2	6	3363088	3363093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8062	NC_017530	CCG	2	6	3363106	3363111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8063	NC_017530	GCC	2	6	3363124	3363129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8064	NC_017530	AC	3	6	3363157	3363162	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8065	NC_017530	GGT	2	6	3363168	3363173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8066	NC_017530	TAC	2	6	3365223	3365228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8067	NC_017530	C	6	6	3365263	3365268	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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8099	NC_017530	TGA	2	6	3390218	3390223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8101	NC_017530	GCC	2	6	3390259	3390264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8102	NC_017530	C	6	6	3390284	3390289	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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8122	NC_017530	GC	3	6	3398228	3398233	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8123	NC_017530	GC	3	6	3398268	3398273	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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