MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Pseudomonas putida BIRD-1 chromosome

Total Repeats: 13278

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_017530	GAGTGT	2	12	2699048	2699059	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
6502	NC_017530	GC	3	6	2699063	2699068	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6503	NC_017530	GGC	2	6	2699136	2699141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6504	NC_017530	GCCTGG	2	12	2699191	2699202	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
6505	NC_017530	CGT	2	6	2700946	2700951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6506	NC_017530	ACG	2	6	2701000	2701005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6507	NC_017530	CAC	2	6	2701651	2701656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6508	NC_017530	GAG	2	6	2701684	2701689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6509	NC_017530	CGG	2	6	2701705	2701710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6510	NC_017530	TAA	2	6	2703347	2703352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6511	NC_017530	CTG	2	6	2703364	2703369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6512	NC_017530	CTG	2	6	2703399	2703404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6513	NC_017530	TGC	2	6	2703415	2703420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6514	NC_017530	GCT	2	6	2703488	2703493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6515	NC_017530	GTT	2	6	2708216	2708221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6516	NC_017530	A	6	6	2708291	2708296	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6517	NC_017530	GCC	2	6	2708297	2708302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6518	NC_017530	CCT	2	6	2708852	2708857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6519	NC_017530	TGG	2	6	2708942	2708947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6520	NC_017530	GTG	2	6	2708955	2708960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6521	NC_017530	GCT	2	6	2708961	2708966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6522	NC_017530	AGT	2	6	2709032	2709037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6523	NC_017530	ACA	2	6	2709044	2709049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6524	NC_017530	CG	3	6	2710094	2710099	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6525	NC_017530	GCGT	2	8	2710154	2710161	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6526	NC_017530	GC	3	6	2710218	2710223	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6527	NC_017530	TTG	2	6	2715649	2715654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6528	NC_017530	GTT	2	6	2715717	2715722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6529	NC_017530	GCAG	2	8	2715728	2715735	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6530	NC_017530	GTT	2	6	2715770	2715775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6531	NC_017530	TGCC	2	8	2715782	2715789	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6532	NC_017530	CGGG	2	8	2715800	2715807	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6533	NC_017530	GCCC	2	8	2718167	2718174	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6534	NC_017530	TAC	2	6	2718261	2718266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6535	NC_017530	GCA	2	6	2718311	2718316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6536	NC_017530	CTG	2	6	2718333	2718338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6537	NC_017530	GGGC	2	8	2718413	2718420	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6538	NC_017530	GC	3	6	2718440	2718445	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6539	NC_017530	CAG	2	6	2718458	2718463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6540	NC_017530	TCT	2	6	2718489	2718494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6541	NC_017530	CAG	2	6	2718497	2718502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6542	NC_017530	AAAG	2	8	2719118	2719125	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6543	NC_017530	ATGC	2	8	2720673	2720680	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6544	NC_017530	CAT	2	6	2720708	2720713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6545	NC_017530	AG	3	6	2720734	2720739	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6546	NC_017530	TTG	2	6	2721648	2721653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6547	NC_017530	TCT	2	6	2721682	2721687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6548	NC_017530	TCG	2	6	2721739	2721744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6549	NC_017530	CCCG	2	8	2721877	2721884	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6550	NC_017530	ACA	2	6	2721903	2721908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6551	NC_017530	AG	3	6	2721920	2721925	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6552	NC_017530	GCC	2	6	2722901	2722906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6553	NC_017530	GAA	2	6	2723232	2723237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6554	NC_017530	GGC	2	6	2723277	2723282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6555	NC_017530	GCCG	2	8	2724087	2724094	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6556	NC_017530	ATG	2	6	2724101	2724106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6557	NC_017530	GA	3	6	2724148	2724153	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6558	NC_017530	TCC	2	6	2729732	2729737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6559	NC_017530	GAG	2	6	2729770	2729775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6560	NC_017530	GCA	3	9	2730483	2730491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6561	NC_017530	GTT	2	6	2730493	2730498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6562	NC_017530	GGGA	2	8	2730516	2730523	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6563	NC_017530	CAGG	2	8	2730728	2730735	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6564	NC_017530	GCAG	2	8	2730769	2730776	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6565	NC_017530	AAG	2	6	2730839	2730844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6566	NC_017530	ATT	2	6	2730887	2730892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6567	NC_017530	TCT	2	6	2730899	2730904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6568	NC_017530	TGG	2	6	2730905	2730910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6569	NC_017530	TCA	2	6	2735013	2735018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6571	NC_017530	CAA	2	6	2737875	2737880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6572	NC_017530	ACA	2	6	2737883	2737888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6573	NC_017530	CTG	2	6	2741589	2741594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6574	NC_017530	AGC	2	6	2741700	2741705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6575	NC_017530	GCA	2	6	2744100	2744105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6576	NC_017530	AGC	2	6	2744123	2744128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6577	NC_017530	CGGG	2	8	2744143	2744150	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6578	NC_017530	GGC	2	6	2744200	2744205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6579	NC_017530	C	7	7	2744238	2744244	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6580	NC_017530	GTGA	2	8	2747227	2747234	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6581	NC_017530	GGGTA	2	10	2748186	2748195	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
6582	NC_017530	GGC	2	6	2749340	2749345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6583	NC_017530	G	6	6	2749380	2749385	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6584	NC_017530	ATA	2	6	2749443	2749448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6587	NC_017530	CA	3	6	2749637	2749642	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6588	NC_017530	CAT	2	6	2751246	2751251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6589	NC_017530	AT	3	6	2751256	2751261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6590	NC_017530	TTA	4	12	2751262	2751273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6591	NC_017530	GC	3	6	2751291	2751296	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6592	NC_017530	TAA	2	6	2751333	2751338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6593	NC_017530	GTA	2	6	2751365	2751370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6595	NC_017530	CTG	3	9	2753129	2753137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6598	NC_017530	CGG	2	6	2757104	2757109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6599	NC_017530	GC	3	6	2757138	2757143	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6600	NC_017530	TGA	2	6	2757152	2757157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6601	NC_017530	GCG	2	6	2760246	2760251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6602	NC_017530	CAC	2	6	2761486	2761491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6603	NC_017530	CTGA	2	8	2761498	2761505	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6604	NC_017530	TTC	2	6	2761523	2761528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6605	NC_017530	ACGC	2	8	2761583	2761590	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6606	NC_017530	CGA	2	6	2761632	2761637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6607	NC_017530	TGGA	2	8	2761704	2761711	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6608	NC_017530	CGG	2	6	2762746	2762751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6609	NC_017530	CTGA	2	8	2762779	2762786	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6610	NC_017530	GCC	2	6	2762865	2762870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6611	NC_017530	CCT	2	6	2762920	2762925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6612	NC_017530	GGT	2	6	2762987	2762992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6613	NC_017530	CAC	2	6	2763013	2763018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6614	NC_017530	GGC	2	6	2765737	2765742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6616	NC_017530	TCT	2	6	2766209	2766214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6618	NC_017530	GCA	2	6	2766284	2766289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6619	NC_017530	GCA	2	6	2766343	2766348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6620	NC_017530	ACAA	2	8	2766391	2766398	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6621	NC_017530	CG	3	6	2766400	2766405	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6622	NC_017530	GA	3	6	2766446	2766451	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6623	NC_017530	GCC	2	6	2766476	2766481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6624	NC_017530	TGT	2	6	2766487	2766492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6625	NC_017530	GTG	2	6	2766506	2766511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6626	NC_017530	ATG	2	6	2766538	2766543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6627	NC_017530	GA	3	6	2767464	2767469	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6628	NC_017530	AAG	2	6	2767631	2767636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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