MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Pseudomonas putida BIRD-1 chromosome

Total Repeats: 13278

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017530	GC	3	6	2604	2609	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017530	CAA	2	6	2616	2621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017530	GCC	2	6	2713	2718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_017530	CTG	2	6	2777	2782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017530	GCA	2	6	2800	2805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017530	GC	3	6	4395	4400	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_017530	GCTT	2	8	6056	6063	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017530	T	8	8	6070	6077	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017530	TGG	2	6	7272	7277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017530	GGGCC	2	10	7307	7316	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
11	NC_017530	GCC	2	6	7349	7354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_017530	CGA	2	6	7368	7373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017530	CAC	2	6	7387	7392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_017530	CGT	2	6	7441	7446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017530	CTG	2	6	7453	7458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017530	AAC	2	6	7499	7504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017530	GCT	2	6	9666	9671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017530	CCT	2	6	9678	9683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_017530	GCCT	2	8	11265	11272	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_017530	A	6	6	13134	13139	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017530	TGC	2	6	16695	16700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017530	GGA	2	6	16701	16706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017530	CG	3	6	17645	17650	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017530	ACG	2	6	17663	17668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017530	CTG	2	6	17681	17686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017530	GTTGG	2	10	17702	17711	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017530	TAC	2	6	18866	18871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017530	AACG	2	8	18895	18902	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017530	GTG	2	6	18909	18914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017530	CAG	3	9	20395	20403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017530	CAGC	2	8	20459	20466	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_017530	GCC	2	6	20508	20513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_017530	CG	3	6	22857	22862	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_017530	TTTTGC	2	12	23788	23799	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_017530	CTA	2	6	23809	23814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017530	T	6	6	26210	26215	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017530	GAGC	2	8	26254	26261	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017530	GCA	2	6	26285	26290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017530	CGC	2	6	26333	26338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_017530	GAC	2	6	26405	26410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017530	GC	3	6	26412	26417	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017530	CAG	2	6	26470	26475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017530	GCGCA	2	10	27914	27923	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
44	NC_017530	GGC	2	6	29378	29383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017530	ACAAT	2	10	31296	31305	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_017530	GACG	2	8	31323	31330	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_017530	CCT	2	6	31734	31739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_017530	CTG	2	6	31760	31765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017530	ACG	2	6	31964	31969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017530	CCA	2	6	31976	31981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_017530	A	6	6	32544	32549	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017530	CTC	2	6	34143	34148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_017530	CCT	2	6	35375	35380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_017530	ACG	2	6	35395	35400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017530	AGT	2	6	35429	35434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017530	GCA	2	6	35496	35501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017530	GCC	2	6	37004	37009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_017530	GGCT	2	8	37019	37026	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_017530	ACT	2	6	38902	38907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017530	A	7	7	41141	41147	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017530	TGAA	2	8	41180	41187	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017530	GCGA	2	8	41211	41218	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_017530	GC	4	8	41316	41323	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_017530	TGA	2	6	42153	42158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017530	GGTT	2	8	42253	42260	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017530	GCT	2	6	42264	42269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017530	TGT	2	6	43370	43375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017530	CAAG	2	8	43390	43397	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_017530	TCG	2	6	43398	43403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017530	ACT	2	6	45271	45276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017530	CAG	2	6	46287	46292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017530	TTC	2	6	46310	46315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017530	CAA	2	6	46396	46401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017530	CAT	2	6	47842	47847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017530	AAAC	2	8	47906	47913	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_017530	AGC	2	6	47981	47986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017530	TGCG	2	8	48010	48017	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_017530	GCACT	2	10	48033	48042	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
79	NC_017530	GCT	2	6	48167	48172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017530	ATG	2	6	48320	48325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017530	TGT	2	6	49591	49596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017530	TTG	2	6	49612	49617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017530	TCA	2	6	49623	49628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017530	GTT	2	6	49671	49676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017530	GT	3	6	49678	49683	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017530	CTTGG	2	10	49782	49791	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
87	NC_017530	AC	3	6	50779	50784	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_017530	TGC	2	6	50803	50808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017530	CCG	2	6	50820	50825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_017530	TAT	2	6	52251	52256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017530	CAC	2	6	52351	52356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_017530	T	6	6	52370	52375	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017530	CTG	2	6	52407	52412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017530	GAT	2	6	52553	52558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017530	GA	3	6	52614	52619	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017530	TGC	3	9	52627	52635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017530	TGT	2	6	52677	52682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017530	TCTT	2	8	52699	52706	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_017530	T	6	6	52719	52724	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017530	T	7	7	52737	52743	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017530	T	6	6	52789	52794	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017530	T	6	6	52810	52815	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017530	C	6	6	52833	52838	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
104	NC_017530	GTT	2	6	52866	52871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017530	CT	3	6	52889	52894	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_017530	ATC	2	6	52942	52947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017530	TGGT	2	8	52948	52955	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017530	TGCGC	2	10	53070	53079	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
109	NC_017530	AAACCG	2	12	53224	53235	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017530	ATC	2	6	53256	53261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017530	GGC	3	9	53289	53297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017530	CAGA	2	8	53322	53329	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_017530	TGA	2	6	53605	53610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017530	AAG	2	6	53652	53657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017530	ATG	2	6	53744	53749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017530	CGCTCT	2	12	53786	53797	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
117	NC_017530	AGA	2	6	53830	53835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017530	CGA	2	6	53869	53874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_017530	AAG	2	6	53882	53887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017530	TTG	2	6	53906	53911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017530	ATT	2	6	54025	54030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017530	GCTG	2	8	54079	54086	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NC_017530	CG	3	6	54117	54122	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_017530	GCG	2	6	54255	54260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017530	T	6	6	55757	55762	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017530	CAA	2	6	55820	55825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017530	GCT	2	6	55840	55845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017530	GAA	2	6	55846	55851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017530	GCA	2	6	55865	55870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017530	GGA	2	6	56742	56747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017530	ACG	2	6	56774	56779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017530	TTC	2	6	56820	56825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_017530	CCT	2	6	56831	56836	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_017530	AGG	2	6	56850	56855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017530	GCA	2	6	56884	56889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017530	C	6	6	56944	56949	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
137	NC_017530	AAC	2	6	56995	57000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017530	GAAG	2	8	58620	58627	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017530	GAG	2	6	58680	58685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017530	AGCG	2	8	58687	58694	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
141	NC_017530	CGA	2	6	58727	58732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_017530	GCA	2	6	58760	58765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_017530	CCT	2	6	58768	58773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
144	NC_017530	TTCGA	2	10	61406	61415	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
145	NC_017530	A	6	6	61534	61539	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017530	TCGA	2	8	61566	61573	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_017530	AGAAAA	2	12	63006	63017	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017530	CTG	2	6	67401	67406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_017530	CTCG	2	8	68446	68453	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
150	NC_017530	GTG	2	6	68480	68485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017530	AACG	2	8	68512	68519	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
152	NC_017530	GAA	2	6	68533	68538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017530	GCA	2	6	68607	68612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_017530	AGC	2	6	68635	68640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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156	NC_017530	CAG	2	6	68707	68712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_017530	TCC	2	6	68755	68760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
158	NC_017530	CGT	2	6	68770	68775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_017530	C	6	6	68852	68857	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
160	NC_017530	CAGG	2	8	68861	68868	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
161	NC_017530	CTC	2	6	70198	70203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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167	NC_017530	AG	3	6	74700	74705	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
168	NC_017530	AAT	2	6	74780	74785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_017530	AG	3	6	74796	74801	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
170	NC_017530	CTT	2	6	74870	74875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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179	NC_017530	GAA	2	6	78360	78365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_017530	CCG	2	6	78402	78407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
182	NC_017530	CGA	2	6	78435	78440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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184	NC_017530	CAC	2	6	78454	78459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
185	NC_017530	CGA	2	6	79157	79162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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188	NC_017530	ACA	2	6	79318	79323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
189	NC_017530	A	8	8	79326	79333	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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269	NC_017530	AGGC	2	8	127917	127924	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
270	NC_017530	CTG	2	6	127928	127933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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272	NC_017530	GCC	2	6	130333	130338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
273	NC_017530	CTA	2	6	130423	130428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
274	NC_017530	CCA	2	6	133583	133588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
275	NC_017530	CACAA	2	10	133605	133614	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
276	NC_017530	TAA	2	6	133616	133621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
277	NC_017530	AAT	2	6	133627	133632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
278	NC_017530	T	7	7	133660	133666	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
279	NC_017530	TAT	2	6	133669	133674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
280	NC_017530	CGTG	2	8	133790	133797	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
281	NC_017530	AC	3	6	133851	133856	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
282	NC_017530	GCT	2	6	134605	134610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
283	NC_017530	CTGCC	2	10	134679	134688	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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285	NC_017530	GC	3	6	134715	134720	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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424	NC_017530	GTG	2	6	200926	200931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
425	NC_017530	AGGA	2	8	200966	200973	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
426	NC_017530	ACC	2	6	200992	200997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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428	NC_017530	TGC	2	6	201307	201312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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430	NC_017530	TCGTG	2	10	201328	201337	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
431	NC_017530	TGG	2	6	201397	201402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
432	NC_017530	GGA	2	6	201433	201438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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436	NC_017530	GGA	2	6	201713	201718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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441	NC_017530	CTG	2	6	201982	201987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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451	NC_017530	ACTG	2	8	202802	202809	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
452	NC_017530	ACCGA	2	10	202814	202823	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
453	NC_017530	AC	3	6	203027	203032	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
454	NC_017530	CGTC	2	8	203045	203052	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
455	NC_017530	AAC	2	6	203064	203069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
456	NC_017530	AGG	2	6	203138	203143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
457	NC_017530	AGC	2	6	203154	203159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
458	NC_017530	AAAG	2	8	203168	203175	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
459	NC_017530	AGTCG	2	10	203190	203199	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
460	NC_017530	ATC	2	6	203251	203256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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463	NC_017530	GGT	2	6	203554	203559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
464	NC_017530	TGA	2	6	203603	203608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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467	NC_017530	GA	3	6	203734	203739	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
468	NC_017530	TTA	2	6	203860	203865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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484	NC_017530	GGT	2	6	205020	205025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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