MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Pasteurella multocida subsp. multocida str. HN06 chromosome

Total Repeats: 7109

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017027	AG	3	6	484666	484671	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_017027	TGA	2	6	485816	485821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_017027	GTT	2	6	485856	485861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_017027	T	6	6	485872	485877	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_017027	AAGGC	2	10	485882	485891	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1506	NC_017027	ATTCA	2	10	485919	485928	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1507	NC_017027	T	6	6	485929	485934	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_017027	A	6	6	485978	485983	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_017027	AGA	2	6	485996	486001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_017027	CTTA	2	8	486638	486645	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1511	NC_017027	CAA	2	6	486721	486726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1512	NC_017027	ATT	2	6	486727	486732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_017027	A	6	6	486773	486778	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_017027	T	6	6	488722	488727	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_017027	T	6	6	488761	488766	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_017027	ATC	2	6	488813	488818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1517	NC_017027	GAT	2	6	489657	489662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_017027	T	7	7	491004	491010	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_017027	T	6	6	491041	491046	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_017027	CGA	2	6	491456	491461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_017027	GCAA	2	8	491502	491509	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1522	NC_017027	TAAA	2	8	491521	491528	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_017027	TCA	2	6	491553	491558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_017027	T	6	6	491656	491661	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_017027	ATG	2	6	491677	491682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_017027	AAT	2	6	491690	491695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_017027	AAT	2	6	491699	491704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_017027	AC	3	6	491729	491734	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1529	NC_017027	T	7	7	492528	492534	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_017027	T	6	6	493283	493288	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_017027	ATG	2	6	493976	493981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_017027	GGT	2	6	493995	494000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_017027	T	6	6	495481	495486	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_017027	TTTG	2	8	499412	499419	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_017027	CTA	2	6	499430	499435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_017027	ATT	2	6	502014	502019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_017027	T	8	8	502050	502057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_017027	CAA	2	6	502060	502065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1539	NC_017027	TGA	2	6	502078	502083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_017027	TTA	2	6	502110	502115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_017027	TGTGA	2	10	502161	502170	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_017027	CAA	2	6	502181	502186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_017027	TTTA	2	8	502196	502203	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_017027	TGCAT	2	10	502210	502219	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1545	NC_017027	GA	3	6	502223	502228	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_017027	TTTG	2	8	502990	502997	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_017027	TAA	2	6	503041	503046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_017027	GA	4	8	503047	503054	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_017027	A	6	6	503980	503985	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_017027	A	7	7	503988	503994	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_017027	TAT	2	6	507115	507120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_017027	TAA	2	6	507122	507127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_017027	CGAA	2	8	507187	507194	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1554	NC_017027	T	7	7	507212	507218	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_017027	T	6	6	508044	508049	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_017027	T	7	7	508056	508062	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_017027	GA	3	6	510706	510711	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_017027	T	7	7	510758	510764	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_017027	TGG	2	6	511534	511539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_017027	A	6	6	512972	512977	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_017027	A	6	6	513007	513012	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_017027	TTC	2	6	513025	513030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1563	NC_017027	ATTCAA	2	12	513035	513046	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1564	NC_017027	A	6	6	514978	514983	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_017027	TAC	2	6	514996	515001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_017027	A	6	6	515020	515025	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_017027	TAA	2	6	515031	515036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_017027	T	9	9	515038	515046	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_017027	A	6	6	515048	515053	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_017027	ACG	2	6	515097	515102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1571	NC_017027	GC	3	6	515178	515183	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1572	NC_017027	AG	3	6	515185	515190	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_017027	TGG	2	6	515219	515224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_017027	T	7	7	515299	515305	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_017027	T	7	7	515388	515394	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_017027	TG	3	6	515421	515426	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_017027	TTG	2	6	515432	515437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_017027	A	6	6	515451	515456	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_017027	TTGAA	2	10	515559	515568	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_017027	GGC	2	6	515598	515603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1582	NC_017027	GCTT	2	8	515643	515650	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1583	NC_017027	GAG	2	6	515750	515755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_017027	TGG	2	6	515815	515820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_017027	GCA	2	6	515913	515918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1586	NC_017027	G	6	6	515938	515943	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_017027	TGAA	2	8	515967	515974	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_017027	TGT	2	6	516019	516024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_017027	ATAG	2	8	516028	516035	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_017027	CAT	2	6	516036	516041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1591	NC_017027	AGA	2	6	516055	516060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_017027	CAG	2	6	516081	516086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1593	NC_017027	AGGG	2	8	516225	516232	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_017027	GGA	2	6	516272	516277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_017027	CGAAGG	2	12	516282	516293	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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1597	NC_017027	AAG	2	6	516561	516566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_017027	TGC	2	6	516609	516614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1599	NC_017027	GTC	2	6	516621	516626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1601	NC_017027	TCGG	2	8	516696	516703	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1602	NC_017027	GGA	2	6	516734	516739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_017027	TCA	2	6	516759	516764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1604	NC_017027	AC	3	6	516785	516790	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1605	NC_017027	AC	3	6	516954	516959	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1606	NC_017027	CCT	2	6	517095	517100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1607	NC_017027	CA	3	6	517129	517134	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1608	NC_017027	ATGA	2	8	517153	517160	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_017027	TGT	2	6	517192	517197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_017027	CGG	2	6	517234	517239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_017027	TGT	2	6	517287	517292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_017027	A	6	6	517307	517312	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_017027	GAAA	2	8	517346	517353	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_017027	ACA	2	6	517410	517415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_017027	TGA	2	6	517422	517427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1617	NC_017027	GAA	2	6	517633	517638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_017027	CTA	2	6	517640	517645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1619	NC_017027	GCG	2	6	517741	517746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1620	NC_017027	TAGC	2	8	517774	517781	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1621	NC_017027	TAAG	2	8	517867	517874	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_017027	G	6	6	517904	517909	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_017027	TCC	2	6	517914	517919	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1624	NC_017027	GTAC	2	8	518018	518025	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1625	NC_017027	GGA	2	6	518223	518228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_017027	AC	3	6	518440	518445	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1629	NC_017027	AGC	2	6	518567	518572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1630	NC_017027	CAT	2	6	518573	518578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1631	NC_017027	AAAG	2	8	518581	518588	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_017027	AGTCG	2	10	518603	518612	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1633	NC_017027	AGGTT	2	10	518930	518939	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_017027	GGT	2	6	518965	518970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_017027	TGA	2	6	519018	519023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_017027	GGT	2	6	519117	519122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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