MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Pasteurella multocida subsp. multocida str. HN06 chromosome

Total Repeats: 7109

< Previous123456789101112131415Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_017027	A	6	6	2361034	2361039	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7002	NC_017027	GAA	2	6	2361061	2361066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7003	NC_017027	TTA	2	6	2362090	2362095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7004	NC_017027	TGT	2	6	2363618	2363623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7005	NC_017027	A	6	6	2363644	2363649	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7006	NC_017027	T	6	6	2366023	2366028	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7007	NC_017027	T	6	6	2366045	2366050	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7008	NC_017027	TTG	2	6	2370114	2370119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7009	NC_017027	TAG	2	6	2371295	2371300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7010	NC_017027	TGT	2	6	2371302	2371307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7011	NC_017027	A	7	7	2371321	2371327	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7012	NC_017027	TGA	3	9	2371442	2371450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7013	NC_017027	A	8	8	2371510	2371517	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7014	NC_017027	T	6	6	2371532	2371537	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7015	NC_017027	A	6	6	2371540	2371545	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7016	NC_017027	A	7	7	2373971	2373977	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7017	NC_017027	TA	3	6	2373987	2373992	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7018	NC_017027	TTGTT	2	10	2375283	2375292	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
7019	NC_017027	TGT	2	6	2375311	2375316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7020	NC_017027	A	7	7	2375328	2375334	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7021	NC_017027	AAC	2	6	2375384	2375389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7022	NC_017027	ATT	2	6	2375393	2375398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7023	NC_017027	TTTA	2	8	2375470	2375477	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7024	NC_017027	T	7	7	2376068	2376074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7025	NC_017027	TGAG	2	8	2376083	2376090	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7026	NC_017027	TCGCT	2	10	2376876	2376885	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
7027	NC_017027	ATAA	2	8	2376889	2376896	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7028	NC_017027	TAT	2	6	2376939	2376944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7029	NC_017027	TGA	2	6	2377452	2377457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7030	NC_017027	AGA	2	6	2377460	2377465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7031	NC_017027	A	6	6	2377494	2377499	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7032	NC_017027	AG	3	6	2377558	2377563	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7033	NC_017027	A	6	6	2377564	2377569	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7034	NC_017027	TAA	2	6	2379198	2379203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7035	NC_017027	AATT	2	8	2379253	2379260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7036	NC_017027	GAT	2	6	2379322	2379327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7037	NC_017027	TGT	2	6	2379350	2379355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7038	NC_017027	A	6	6	2379383	2379388	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7039	NC_017027	TGA	2	6	2379398	2379403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7040	NC_017027	T	7	7	2380731	2380737	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7041	NC_017027	T	6	6	2380740	2380745	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7042	NC_017027	ATAA	2	8	2380772	2380779	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7043	NC_017027	TTA	2	6	2381644	2381649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7044	NC_017027	T	6	6	2381692	2381697	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7045	NC_017027	GGGC	2	8	2383161	2383168	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7046	NC_017027	T	7	7	2383204	2383210	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7047	NC_017027	T	6	6	2383222	2383227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7048	NC_017027	TTA	2	6	2385701	2385706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7049	NC_017027	AAG	2	6	2385761	2385766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7050	NC_017027	A	6	6	2385800	2385805	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7051	NC_017027	A	6	6	2385848	2385853	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7052	NC_017027	AGGAG	2	10	2385857	2385866	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
7053	NC_017027	TG	3	6	2385894	2385899	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7054	NC_017027	TAA	2	6	2385938	2385943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7055	NC_017027	ATTG	2	8	2386021	2386028	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7056	NC_017027	GAA	2	6	2386067	2386072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7057	NC_017027	CAA	2	6	2386080	2386085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7058	NC_017027	TA	3	6	2386097	2386102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7059	NC_017027	A	7	7	2386121	2386127	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7060	NC_017027	T	6	6	2386781	2386786	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7061	NC_017027	T	6	6	2386839	2386844	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7062	NC_017027	TTTG	2	8	2386862	2386869	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7063	NC_017027	ATTC	2	8	2386870	2386877	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7064	NC_017027	A	6	6	2386925	2386930	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7065	NC_017027	AACA	2	8	2386932	2386939	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7066	NC_017027	A	6	6	2386949	2386954	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7067	NC_017027	CGC	2	6	2386957	2386962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7068	NC_017027	CAC	2	6	2387000	2387005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7069	NC_017027	AG	3	6	2388031	2388036	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7070	NC_017027	TGAA	2	8	2388509	2388516	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7071	NC_017027	A	6	6	2388515	2388520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7072	NC_017027	T	6	6	2388540	2388545	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7073	NC_017027	TTG	2	6	2388549	2388554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7074	NC_017027	CT	3	6	2388560	2388565	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7075	NC_017027	A	7	7	2388592	2388598	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7076	NC_017027	T	6	6	2388612	2388617	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7077	NC_017027	TAAAA	2	10	2389085	2389094	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7078	NC_017027	A	6	6	2389091	2389096	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7079	NC_017027	A	6	6	2390564	2390569	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7080	NC_017027	TAT	2	6	2390571	2390576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7081	NC_017027	ACA	2	6	2390836	2390841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7082	NC_017027	TGA	2	6	2390875	2390880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7083	NC_017027	T	7	7	2392638	2392644	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7084	NC_017027	GA	3	6	2393519	2393524	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7085	NC_017027	TAT	2	6	2393529	2393534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7086	NC_017027	T	7	7	2393560	2393566	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7087	NC_017027	A	7	7	2393571	2393577	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7088	NC_017027	GTT	2	6	2393592	2393597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7089	NC_017027	TCA	2	6	2393632	2393637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7090	NC_017027	T	6	6	2393665	2393670	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7091	NC_017027	TA	3	6	2393680	2393685	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7092	NC_017027	TTC	2	6	2395868	2395873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7093	NC_017027	T	6	6	2396450	2396455	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7094	NC_017027	TTA	2	6	2396512	2396517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7095	NC_017027	T	6	6	2396574	2396579	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7096	NC_017027	TTTA	2	8	2396587	2396594	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7097	NC_017027	AAAC	2	8	2398022	2398029	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7098	NC_017027	A	6	6	2398063	2398068	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7099	NC_017027	T	6	6	2398078	2398083	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7100	NC_017027	CT	3	6	2399460	2399465	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7101	NC_017027	TTCA	2	8	2399520	2399527	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7102	NC_017027	AAAT	2	8	2402016	2402023	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7103	NC_017027	TAA	2	6	2402035	2402040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7104	NC_017027	T	6	6	2402069	2402074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7105	NC_017027	T	7	7	2402103	2402109	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7106	NC_017027	AATT	2	8	2402148	2402155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7107	NC_017027	CG	3	6	2402167	2402172	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7108	NC_017027	T	6	6	2402183	2402188	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7109	NC_017027	ATA	2	6	2402209	2402214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

< Previous123456789101112131415Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.