MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Pediococcus claussenii ATCC BAA-344 plasmid pPECL-7

Total Repeats: 66

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017018	AGAA	2	8	623	630	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017018	TCC	2	6	2626	2631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_017018	A	6	6	2657	2662	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017018	A	7	7	3288	3294	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017018	GGT	2	6	3340	3345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017018	ATG	2	6	5347	5352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017018	TCA	2	6	5405	5410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017018	TG	3	6	7677	7682	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017018	CCA	2	6	7707	7712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_017018	ATGA	2	8	7759	7766	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017018	GCA	2	6	7827	7832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017018	TCC	2	6	8300	8305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_017018	TTA	2	6	8347	8352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017018	AAT	2	6	8371	8376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017018	A	7	7	8409	8415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017018	ATA	2	6	8423	8428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017018	CTG	2	6	8528	8533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017018	GAG	2	6	8562	8567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017018	CGT	2	6	8661	8666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017018	AAG	2	6	8875	8880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017018	TA	3	6	8891	8896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017018	ATAA	2	8	8900	8907	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017018	TCTT	2	8	9000	9007	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017018	TTA	2	6	9084	9089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017018	ATG	2	6	9115	9120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017018	ATG	2	6	9219	9224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017018	CAG	2	6	10640	10645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017018	ACT	2	6	10669	10674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017018	T	6	6	10706	10711	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017018	A	6	6	10723	10728	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017018	ATG	2	6	10734	10739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017018	TAC	2	6	12452	12457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017018	T	7	7	12468	12474	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017018	AAAT	2	8	12553	12560	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017018	TGTAT	2	10	12569	12578	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017018	AT	3	6	12590	12595	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017018	ACTTT	2	10	12598	12607	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_017018	TTG	2	6	12617	12622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017018	GTT	2	6	12647	12652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017018	TGA	2	6	12658	12663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017018	TCA	3	9	12672	12680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017018	TCA	2	6	12759	12764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017018	TCT	2	6	12819	12824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017018	CAG	2	6	12880	12885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017018	TCA	2	6	13066	13071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017018	ATTA	2	8	13097	13104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017018	ATT	2	6	13106	13111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017018	TAAAA	2	10	14780	14789	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017018	TA	3	6	14972	14977	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017018	A	8	8	15012	15019	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017018	A	6	6	15036	15041	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017018	AGTT	2	8	15311	15318	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017018	T	6	6	15371	15376	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017018	TA	3	6	15401	15406	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017018	ATT	2	6	15675	15680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017018	TTAAA	2	10	15687	15696	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017018	TAGT	2	8	15709	15716	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017018	AGAA	2	8	15741	15748	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017018	TTTG	2	8	15774	15781	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017018	AGTT	2	8	15829	15836	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017018	A	8	8	15860	15867	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017018	TTTTA	2	10	15870	15879	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017018	T	6	6	15896	15901	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017018	AATGA	2	10	15917	15926	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017018	AC	3	6	15942	15947	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_017018	ACA	2	6	16007	16012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.