MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Pyrobaculum oguniense TE7 extrachromosomal element

Total Repeats: 58

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016886	GGCA	2	8	5	12	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_016886	A	6	6	56	61	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016886	CGG	2	6	123	128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_016886	CGTA	2	8	134	141	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_016886	T	6	6	203	208	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016886	AT	3	6	321	326	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016886	CGC	2	6	374	379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_016886	CGTA	2	8	387	394	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_016886	GC	3	6	397	402	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_016886	TACG	2	8	414	421	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_016886	GC	3	6	469	474	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_016886	AAAG	2	8	514	521	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016886	TACG	2	8	538	545	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_016886	TACG	2	8	603	610	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_016886	CCG	2	6	635	640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_016886	TACG	2	8	653	660	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_016886	A	6	6	677	682	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016886	TAA	2	6	687	692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016886	TAA	2	6	2362	2367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016886	ATA	2	6	2379	2384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016886	A	6	6	2398	2403	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016886	CG	4	8	3669	3676	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_016886	T	6	6	4025	4030	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016886	CTC	2	6	4036	4041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_016886	GTA	2	6	4105	4110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016886	AAG	2	6	4135	4140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016886	CTT	2	6	4176	4181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_016886	A	6	6	4195	4200	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016886	TA	3	6	4223	4228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016886	GGTA	2	8	4234	4241	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016886	T	6	6	4576	4581	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016886	ATT	2	6	4583	4588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016886	AAC	2	6	4619	4624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_016886	TTC	2	6	4631	4636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_016886	CGG	2	6	6865	6870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_016886	C	6	6	7994	7999	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
37	NC_016886	C	6	6	8007	8012	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
38	NC_016886	AG	3	6	11040	11045	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016886	ACG	2	6	11050	11055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_016886	TAC	2	6	11068	11073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_016886	CG	3	6	11405	11410	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_016886	ACGCA	2	10	11445	11454	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
43	NC_016886	ATT	2	6	11748	11753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016886	T	7	7	11752	11758	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016886	AAC	2	6	11788	11793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_016886	ACCA	2	8	12106	12113	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_016886	T	6	6	12116	12121	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016886	CGC	2	6	12185	12190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_016886	T	6	6	13810	13815	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016886	CA	3	6	13816	13821	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_016886	GCC	2	6	14180	14185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_016886	ATT	2	6	14376	14381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016886	CTTT	2	8	14382	14389	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_016886	T	6	6	14387	14392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016886	TGG	2	6	14408	14413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016886	CTG	2	6	14417	14422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_016886	CGC	2	6	16812	16817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_016886	T	6	6	16830	16835	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.